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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 1703 条。当前显示第 17 / 18 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkAUNG053040
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GWHBCHF00000001
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CM104802.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.800
查询 100.000 / 对象 85.777
TkAUNG053040
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CM104804.1
较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
99.100
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00412 TkAUNG053620
TkAUNG053630
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CM104804.1
较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
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CM104804.1
较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
98.700
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00412 TkAUNG053680
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CM104800.1
较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
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CM104800.1
较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
99.700
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CM104800.1
较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
98.900
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00386 TkAUNG055600
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
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JCVI_TKOH_00386 TkAUNG055820
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CM104799.1
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较可信
98.500
查询 95.470 / 对象 71.728
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CM104799.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.500
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG060110
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CM104801.1
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较可信
94.600
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00395 TkAUNG060640
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较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
99.700
查询 100.000 / 对象 100.000
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CM104801.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.900
查询 100.000 / 对象 74.278
JCVI_TKOH_00395 TkAUNG060730
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CM104801.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.500
查询 100.000 / 对象 85.020
TkAUNG061790
TkAUNG061810
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CM104801.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.200
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG061810
TkAUNG064230
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CM104799.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.300
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG064230
TkAUNG064430
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG064430
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
95.100
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG064440
TkAUNG064460
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.700
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG064460
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CM104804.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.100
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG064880
TkAUNG065020
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.300
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG065020
TkAUNG065050
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.500
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG065050
TkAUNG065570
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
98.800
查询 95.769 / 对象 84.130
TkAUNG065570
TkAUNG066550
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较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
98.900
查询 100.000 / 对象 100.000
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.100
查询 100.000 / 对象 99.359
TkAUNG066840
TkAUNG066880
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG066880
TkAUNG066940
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
98.100
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG066940
TkAUNG067460
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CM104799.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
90.200
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TkAUNG067460
TkAUNG067940
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CM104799.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 76.042
JCVI_TKOH_00378 TkAUNG067940
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较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00397 TkAUNG068210
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较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
93.600
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00397 TkAUNG068420
TkAUNG068980
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较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.700
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG068980
TkAUNG069200
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较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
98.600
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG069200
TkAUNG069210
ChrUn:20118435-20130143 (-)
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LXL04_003956
Chr01:117738282-117740335 (+)
CM104799.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG069210
TkAUNG069470
ChrUn:20202370-20203437 (+)
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较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 84.726
TkAUNG069470
TkAUNG069680
ChrUn:20237855-20239256 (+)
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LXL04_024700
Chr05:96903478-96904430 (-)
CM104803.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG069680
TkAUNG069710
ChrUn:20240519-20245677 (-)
GWHBCHF00000001
LXL04_024699
Chr05:96896770-96901487 (+)
CM104803.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.800
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG069710
TkAUNG070040
ChrUn:20310784-20316541 (+)
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Chr04:134666514-134670947 (-)
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较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
98.400
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG070040
TkAUNG070520
ChrUn:20443611-20447361 (-)
GWHBCHF00000001
LXL04_029591
Chr06:94927450-94930586 (-)
CM104804.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.600
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG070520
TkAUNG071380
ChrUn:20650199-20652264 (-)
GWHBCHF00000001
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Chr01:138295874-138298168 (+)
CM104799.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
91.000
查询 92.105 / 对象 72.754
TkAUNG071380
TkAUNG071970
ChrUn:20815126-20819457 (+)
GWHBCHF00000001
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较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
99.800
查询 97.785 / 对象 96.309
JCVI_TKOH_00400 TkAUNG071970
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CM104802.1
较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
99.300
查询 97.623 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00400 TkAUNG072010
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CM104802.1
较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
98.100
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00400 TkAUNG072020
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