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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG097570
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 27552058-27555406 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1627 bp · TkAUNG097570|TK1151|cDNA

TATGGTCTAACAAAAGTATATTCATTCACCGCAAGGCCGAGATACACCGTTGGCTGCTTTTATGATTTGATCGTAGTTATTGTAAGCCACCTTTGACAGTCAATAGACTGATACTCATGTGGGCTCTTGAACAACAACTTTTGTTCGTATTACTCCCAAGTGAACTTCCCCCAAAACTTCCCGGCGTTCTTCTTCACCGCCTCCTTTAGCCACCCGAACATCGTCGACATACATACGACTCCCCTCGTTCCATCTTCCCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1110 bp · TkAUNG097570|TK1151|CDS

ATGGAGATCACCAATGTAATGGAATATGAAGCACTTGCAAAGGAGAAATTACCCAAAATGATCTATGATTATTATGCATCGGGTGCAGAAGACCAATGGACTCTTCTTGAAAATCGAAATGCTTTTTCAAGAATCTTGTTCAGACCTCGTATACTTATCGATGTAAGCAAAATAGATTTGACCACAACGGTTTTAGGCTTCAATATTTCAATGCCAATCATGGTTGCACCTACAGCCATGCAGAAAATGGCTCACCCTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

369 aa · TkAUNG097570|TK1151|PROTEIN

MEITNVMEYEALAKEKLPKMIYDYYASGAEDQWTLLENRNAFSRILFRPRILIDVSKIDLTTTVLGFNISMPIMVAPTAMQKMAHPDGEYATARASATAGTIMTLSSWATSSVEEVASTGPGVRFFQLYVYKDRSVVTQLVKRAEKAGFKAIVLTVDTPRLGRRESDIKNRFVLPQNLSLKNFDGLDLGKLDKTDDSGLASYVAGQVDRSLSWKDIKWLKSITPLPILVKGVLTAEDARIAVQSGVAGIIVSNHGARQLD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG097570
TK1151 IDTkAUNG097570
OH-1004 IDLXL04_010961
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG097570
位置ChrUn:27552058-27555406 (+)
描述Similar to GLO5: Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g14420 催化甘醇酸氧化为乙醛酸，同时 O2 被还原为 H2O2。 暂无已核实直接文献
At3g14415 催化甘醇酸氧化为乙醛酸，同时 O2 被还原为 H2O2。 暂无已核实直接文献
At4g18360 催化甘醇酸氧化为乙醛酸，同时 O2 被还原为 H2O2。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010961 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009854 oxidative photosynthetic carbon pathway 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0050665 hydrogen peroxide biosynthetic process 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0010494 cytoplasmic stress granule 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G14415
ath:AT3G14420
ath:AT4G18360
zma:100279535
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

过氧化物酶体0.673
排名 1 · TkAUNG097570 · TK1151
线粒体0.189
排名 2 · TkAUNG097570 · TK1151
细胞质0.117
排名 3 · TkAUNG097570 · TK1151
质体0.050
排名 4 · TkAUNG097570 · TK1151
细胞核0.040
排名 5 · TkAUNG097570 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01070FMN_dh13-354 aa
PF00478IMPDH53-102 aa
PF01180DHO_dh60-97 aa
PF02581TMP-TENI87-120 aa
PF00977His_biosynth137-155 aa
PF02225PA139-160 aa
PF05690ThiG145-175 aa
PF02581TMP-TENI210-252 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG097570PF01070FMN_dh133543.1e-138461.3
TkAUNG097570PF00478IMPDH531021.4e-0628.3
TkAUNG097570PF01180DHO_dh60970.003617.2
TkAUNG097570PF02581TMP-TENI871200.03114.4
TkAUNG097570PF00977His_biosynth1371550.0003320.9
TkAUNG097570PF02225PA1391600.04214.7
TkAUNG097570PF05690ThiG1451755.2e-0523.4
TkAUNG097570PF02581TMP-TENI2102520.03114.4
TkAUNG097570PF05690ThiG2172625.2e-0523.4
TkAUNG097570PF01180DHO_dh2272450.003617.2
TkAUNG097570PF03060NMO2293431.1e-0629.0
TkAUNG097570PF00977His_biosynth2312560.0003320.9
TkAUNG097570PF02225PA2342600.04214.7
TkAUNG097570PF02581TMP-TENI2633070.03114.4
TkAUNG097570PF00478IMPDH2653091.4e-0628.3
TkAUNG097570PF01180DHO_dh2653130.003617.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LRR9拟南芥sp|Q9LRR9|GLO1_ARATH Glycolate oxidase 184.000%Swiss-Prot高置信
Q9LRS0拟南芥sp|Q9LRS0|GLO2_ARATH Glycolate oxidase 284.100%Swiss-Prot高置信
O49506拟南芥sp|O49506|GLO5_ARATH Glycolate oxidase 385.600%Swiss-Prot高置信

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