RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG073030
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 21089717-21094582 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3214 bp · TkAUNG073030|TK1151|cDNA

ATGGACTTGATTTGAAATGAGCTTGTTAAAGCAACGTTCTGGAGTCCATTTGAATTTAGGATTTTGTGAGCTTGTTTTATCGTCTGCATAGTTCAAGTGCATTTTACAAATTAGCAATTGGATAAAACAAGGGCAAACCAGGAAAGGATAGATCTTCTGTTGCCTAATTAGGACACATACAAGATGACAGTAAGGAGTGCTCCTGGTACACCGGCTTCAAAAATTGAAAGAACACCCATATCAACACCTGGAGGGTCAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

2826 bp · TkAUNG073030|TK1151|CDS

ATGACAGTAAGGAGTGCTCCTGGTACACCGGCTTCAAAAATTGAAAGAACACCCATATCAACACCTGGAGGGTCAAGAGTCCGGGAAGAGAAAATTGTTGTAACTGTACGATTGAGACCTCTAAATAAAAGGGAACAACTGGCCAAAGATAACGTATCATGGGAATGCATTGATGATCATTCAATTGTATATAAACCACAATCTCAGGAGCGTGTCCATCAACCATCTTCCTTTACATTTGATAAAGTCTTTGGCCCTAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

941 aa · TkAUNG073030|TK1151|PROTEIN

MTVRSAPGTPASKIERTPISTPGGSRVREEKIVVTVRLRPLNKREQLAKDNVSWECIDDHSIVYKPQSQERVHQPSSFTFDKVFGPTTVTETVYEDGVKTVALSALMGINATIFAYGQTSSGKTYTMRGITEKAVNDIYQHIMRTPERDFRIKISGLEIYNENVRDLLNSESGRNLKLLDDPEKGTVVEKLVEETATDDQHLRSLINICEAQRQVGETALNDTSSRSHQIIRLTIESTLRETSDCVRSFVSSLNFVDLAG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG073030
TK1151 IDTkAUNG073030
OH-1004 IDLXL04_020167
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG073030
位置ChrUn:21089717-21094582 (-)
描述Similar to NACK1: Kinesin-like protein NACK1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g18370 可能的端向动力蛋白，在 NACK-PQR (ANP1-MKK6-MPK4) MAP 激酶信号通路中发挥作用，该通路对体细胞细胞质分裂至关重要，特别是对细胞板的形成及其扩展。
Expansion of the cell plate in plant cytokinesis requires a kinesin-like protein/MAPKKK complex.2002 · DOI: 10.1016/s0092-8674(02)00691-8
The AtNACK1/HINKEL and STUD/TETRASPORE/AtNACK2 genes, which encode functionally redundant kinesins, are essential for cytokinesis in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-2443.2004.00798.x
Arabidopsis kinesins HINKEL and TETRASPORE act redundantly to control cell plate expansion during cytokinesis in the male gametophyte.2008 · DOI: 10.1093/mp/ssn042
HINKEL kinesin, ANP MAPKKKs and MKK6/ANQ MAPKK, which phosphorylates and activates MPK4 MAPK, constitute a pathway that is required for cytokinesis in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1093/pcp/pcq135
Phosphorylation of a mitotic kinesin-like protein and a MAPKKK by cyclin-dependent kinases (CDKs) is involved in the transition to cytokinesis in plants.2011 · DOI: 10.1073/pnas.1110174108
At3g43210 可能是朝微管正端运动的马达蛋白，作用于NACK-PQR（ANP3-MKK6-MPK4）MAP激酶信号通路；该通路对体细胞胞质分裂，尤其是细胞板的形成和扩展必不可少。
The AtNACK1/HINKEL and STUD/TETRASPORE/AtNACK2 genes, which encode functionally redundant kinesins, are essential for cytokinesis in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-2443.2004.00798.x
Arabidopsis kinesins HINKEL and TETRASPORE act redundantly to control cell plate expansion during cytokinesis in the male gametophyte.2008 · DOI: 10.1093/mp/ssn042
HINKEL kinesin, ANP MAPKKKs and MKK6/ANQ MAPKK, which phosphorylates and activates MPK4 MAPK, constitute a pathway that is required for cytokinesis in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1093/pcp/pcq135
AtMPK4 is required for male-specific meiotic cytokinesis in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04642.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0513900 可能对于促进节间分化过程中胞质分裂的进展至关重要。
The rice mutant dwarf bamboo shoot 1: a leaky mutant of the NACK-type kinesin-like gene can initiate organ primordia but not organ development.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci206
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020167 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000911 cytokinesis by cell plate formation 生物过程
GO:0000919 cell plate assembly 生物过程
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0007112 male meiosis cytokinesis 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009558 embryo sac cellularization 生物过程
GO:0010245 radial microtubular system formation 生物过程
GO:0048229 gametophyte development 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G18370
ath:AT3G43210
dosa:Os01g0513900
nta:107775653
nta:107780313
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.696
排名 1 · TkAUNG073030 · TK1151
细胞核0.270
排名 2 · TkAUNG073030 · TK1151
细胞膜0.095
排名 3 · TkAUNG073030 · TK1151
线粒体0.055
排名 4 · TkAUNG073030 · TK1151
高尔基体0.054
排名 5 · TkAUNG073030 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16796Microtub_bd32-168 aa
PF00225Kinesin37-353 aa
PF20227DUF6586168-253 aa
PF25100DUF7809336-402 aa
PF11995DUF3490341-413 aa
PF30963HDR1390-424 aa
PF20227DUF6586399-425 aa
PF30963HDR1465-531 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG073030PF16796Microtub_bd321683.3e-2279.8
TkAUNG073030PF00225Kinesin373536.1e-102341.7
TkAUNG073030PF20227DUF65861682530.3112.0
TkAUNG073030PF25100DUF78093364020.3911.7
TkAUNG073030PF11995DUF34903414134.9e-68228.7
TkAUNG073030PF30963HDR13904244.28.3
TkAUNG073030PF20227DUF65863994250.3112.0
TkAUNG073030PF30963HDR14655314.28.3
TkAUNG073030PF11995DUF34904875064.9e-68228.7
TkAUNG073030PF20227DUF65865045230.3112.0
TkAUNG073030PF16796Microtub_bd5275613.3e-2279.8
TkAUNG073030PF30963HDR15686114.28.3
TkAUNG073030PF20227DUF65865695940.3112.0
TkAUNG073030PF25100DUF78095826100.3911.7
TkAUNG073030PF11995DUF34906807244.9e-68228.7
TkAUNG073030PF20227DUF65866847140.3112.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8S905拟南芥sp|Q8S905|KN7A_ARATH Kinesin-like protein KIN-7A72.900%Swiss-Prot高置信
Q8LNZ2拟南芥sp|Q8LNZ2|KN7B_ARATH Kinesin-like protein KIN-7B55.200%Swiss-Prot高置信
Q9AWM8水稻sp|Q9AWM8|KN7A_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-7A64.100%Swiss-Prot高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看