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基因概览

TkAUNG094620

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 26750984-26754480 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1372 bp · TkAUNG094620|TK1151|cDNA

CATGGAAACAAATCCGGAGTTTGACGATGGAAGGTTGTCTACGGCTTCTGAATCGCAGAGAAGACAGCTACACGCAGCAGAATGCTCCGAGCTATTACTCTCAGACGCTTAGTCGCACATACTCCTCGTTCAATCTCATATTGTAGACACCTTGGAACATTAGTTATAGCAGAACATGAAGGTGGTTCACTGACTGGCACTTCCCTGAGTTCAATAGAAGCTTCCAGCAAGTTCTTATGTAAAGACAACTCTTTATCATT...

CDS

下载 CDS FASTA

1053 bp · TkAUNG094620|TK1151|CDS

ATGCTCCGAGCTATTACTCTCAGACGCTTAGTCGCACATACTCCTCGTTCAATCTCATATTGTAGACACCTTGGAACATTAGTTATAGCAGAACATGAAGGTGGTTCACTGACTGGCACTTCCCTGAGTTCAATAGAAGCTTCCAGCAAGTTCTTATGTAAAGACAACTCTTTATCATTGCTATTGGCTGGGACAGGCCCATCTTTACAAGAGGCTGCTACAAAAGCTGCTTCATGTCATCCTTCCATTTCTCAGGTGCT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

350 aa · TkAUNG094620|TK1151|PROTEIN

MLRAITLRRLVAHTPRSISYCRHLGTLVIAEHEGGSLTGTSLSSIEASSKFLCKDNSLSLLLAGTGPSLQEAATKAASCHPSISQVLVADSDRFKHSLAEPWAKLIHLVQQKGDYSHIVAASGSFGKNILPRAAALLDVSPITDVIEISEPRTFVRPIYAGNALCTIRYTGSNPCMLTIRSTSFPVSASSDSKTNAAPIHQVDLSSLGEEGTSRHVKQTTQESERPDLGSARVVITGGRALKSAENFKMIEELAEKLGAA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG094620`
TK1151 ID	TkAUNG094620
OH-1004 ID	LXL04_030953
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG094620

位置 ChrUn:26750984-26754480 (-)

描述 Similar to ETFA: Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g50940`	异二聚体电子转移黄素蛋白，可接受来自多种线粒体脱氢酶的电子。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: A2XNR6`	异二聚体电子转移黄素蛋白，可接受来自多种线粒体脱氢酶的电子。	暂无已核实直接文献
`Os03g0835400`	异二聚体电子转移黄素蛋白，可接受来自多种线粒体脱氢酶的电子。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030953 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009063 amino acid catabolic process 生物过程

GO:0022904 respiratory electron transport chain 生物过程

GO:0033539 fatty acid beta-oxidation using acyl-CoA dehydrogenase 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分

GO:0045251 electron transfer flavoprotein complex 细胞组分

GO:0005507 copper ion binding 分子功能

GO:0009055 electron transfer activity 分子功能

GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能

GO:0050660 flavin adenine dinucleotide binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G50940

dosa:Os03g0835400

hsa:2108

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.921

排名 1 · TkAUNG094620 · TK1151

细胞质0.126

排名 2 · TkAUNG094620 · TK1151

细胞核0.073

排名 3 · TkAUNG094620 · TK1151

细胞膜0.028

排名 4 · TkAUNG094620 · TK1151

质体0.019

排名 5 · TkAUNG094620 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01012ETF26-205 aa

PF00766ETF_alpha227-307 aa

PF00205TPP_enzyme_M230-294 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG094620	`PF01012`	ETF	26	205	5.7e-36	124.7
TkAUNG094620	`PF00766`	ETF_alpha	227	307	1.3e-35	121.9
TkAUNG094620	`PF00205`	TPP_enzyme_M	230	294	0.0041	17.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9C6I6`	拟南芥	sp\|Q9C6I6\|ETFA_ARATH Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial	68.800%	Swiss-Prot	高置信
`A2XNR6`	水稻	sp\|A2XNR6\|ETFA_ORYSI Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial	70.500%	Swiss-Prot	高置信
`Q75LJ3`	水稻	sp\|Q75LJ3\|ETFA_ORYSJ Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial	70.500%	Swiss-Prot	高置信

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