TkAUNG084530 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkAUNG084530

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 24040099-24044367 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3266 bp · TkAUNG084530|TK1151|cDNA

TACACAGATCATTTCATTGAGGTGCTCAAAACACATACATTCTATCTCAACAAATCAACAAATAGATGGCATTCTTCATCATCTTCTCCTTCTCTTTCTCTTCCTGTCCTTTCTTCTCAGTCATGGAATTATGATGTTTTCCTAAGTTTTAGAGGAGAAGATACTCGCAAGAATTTTGTAGATCATCTCTACTCAGCTCTTGATCAAAATGGGATCTACACTTACAAGGATGATGTAACACTTCCACGGGGGGAATCGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

3201 bp · TkAUNG084530|TK1151|CDS

TGGAAGTTTGCTTGGAAACTCACATCCCTCTATACATACACAGATCATTTCATTGAGGTGCTCAAAACACATACATTCTATCTCAACAAATCAACAAATAGATGGCATTCTTCATCATCTTCTCCTTCTCTTTCTCTTCCTGTCCTTTCTTCTCAGTCATGGAATTATGATGTTTTCCTAAGTTTTAGAGGAGAAGATACTCGCAAGAATTTTGTAGATCATCTCTACTCAGCTCTTGATCAAAATGGGATCTACACTTA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1066 aa · TkAUNG084530|TK1151|PROTEIN

WKFAWKLTSLYTYTDHFIEVLKTHTFYLNKSTNRWHSSSSSPSLSLPVLSSQSWNYDVFLSFRGEDTRKNFVDHLYSALDQNGIYTYKDDVTLPRGESISPSLLKAVEESQIAVIIFSKNYANSTWCLDELTHIMKLREEGKQTVFPIFYDVEPTDVRKQKRTYKEAFDKHESESTFSKKIKSWGQAFLNDFQGWFSTPQKQPELENTVKVDSWRNALVEASSISGWETKQIANGHEAQCIKQIVDEISQRLVTLRANED...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG084530`
TK1151 ID	TkAUNG084530
OH-1004 ID	LXL04_005578
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	91.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 90.338 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG084530

位置 ChrUn:24040099-24044367 (-)

描述 Similar to RUN1: Disease resistance protein RUN1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g11170`	推定的抗病蛋白At4g11170。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005578 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程

GO:0010193 response to ozone 生物过程

GO:0019677 NAD+ catabolic process 生物过程

GO:0043068 positive regulation of programmed cell death 生物过程

GO:0050832 defense response to fungus 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0003953 NAD+ nucleosidase activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G11170

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.367

排名 1 · TkAUNG084530 · TK1151

细胞核0.314

排名 2 · TkAUNG084530 · TK1151

细胞膜0.311

排名 3 · TkAUNG084530 · TK1151

内质网0.097

排名 4 · TkAUNG084530 · TK1151

质体0.060

排名 5 · TkAUNG084530 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26659PH_DUOX49-84 aa

PF01582TIR55-197 aa

PF13676TIR_258-170 aa

PF21242ECT2_PH137-179 aa

PF07303Occludin_ELL158-190 aa

PF01582TIR206-258 aa

PF07303Occludin_ELL237-276 aa

PF25199nSTAND_NTPase5264-298 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG084530	`PF26659`	PH_DUOX	49	84	0.039	14.3
TkAUNG084530	`PF01582`	TIR	55	197	3.2e-48	164.6
TkAUNG084530	`PF13676`	TIR_2	58	170	9e-18	65.6
TkAUNG084530	`PF21242`	ECT2_PH	137	179	0.049	14.5
TkAUNG084530	`PF07303`	Occludin_ELL	158	190	4.1	8.9
TkAUNG084530	`PF01582`	TIR	206	258	3.2e-48	164.6
TkAUNG084530	`PF07303`	Occludin_ELL	237	276	4.1	8.9
TkAUNG084530	`PF25199`	nSTAND_NTPase5	264	298	0.03	14.9
TkAUNG084530	`PF13191`	AAA_16	265	379	0.0014	19.9
TkAUNG084530	`PF00931`	NB-ARC	271	435	1.1e-23	84.4
TkAUNG084530	`PF01637`	ATPase_2	277	381	5.9e-05	23.7
TkAUNG084530	`PF13401`	AAA_22	284	383	5e-05	24.3
TkAUNG084530	`PF24883`	NPHP3_N	284	346	0.0027	18.6
TkAUNG084530	`PF05729`	NACHT	285	381	0.0023	18.5
TkAUNG084530	`PF13238`	AAA_18	285	374	0.018	16.2
TkAUNG084530	`PF00004`	AAA	287	378	0.081	14.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O82500`	拟南芥	sp\|O82500\|Y4117_ARATH Putative disease resistance protein At4g11170	30.500%	Swiss-Prot	中等置信

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