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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG096730
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 27341545-27343281 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1614 bp · TkAUNG096730|TK1151|cDNA

ATGCAAGCGGCAGTCCCCCTGTTTGAACGCCAGTTCTTTCTAGCATTTCGTCGAGCACTTTCCATCTCTTGTTCCTCCCAACGCCTCCTCATTCCCAATACTCTTACATTCTCTACTCATGCGACAGATAATTTAGAACCTATCAAGGACGAAGGAACAACTGACGGCGCGGAATCAATCAGCGAGGATAATGAAGAAGCTCCCGGAAGCTTATGTGGGAGGATAGAGAAGCTAGCAAGAGGAGACCCTGTTGGTTCCGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1614 bp · TkAUNG096730|TK1151|CDS

ATGCAAGCGGCAGTCCCCCTGTTTGAACGCCAGTTCTTTCTAGCATTTCGTCGAGCACTTTCCATCTCTTGTTCCTCCCAACGCCTCCTCATTCCCAATACTCTTACATTCTCTACTCATGCGACAGATAATTTAGAACCTATCAAGGACGAAGGAACAACTGACGGCGCGGAATCAATCAGCGAGGATAATGAAGAAGCTCCCGGAAGCTTATGTGGGAGGATAGAGAAGCTAGCAAGAGGAGACCCTGTTGGTTCCGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

537 aa · TkAUNG096730|TK1151|PROTEIN

MQAAVPLFERQFFLAFRRALSISCSSQRLLIPNTLTFSTHATDNLEPIKDEGTTDGAESISEDNEEAPGSLCGRIEKLARGDPVGSAFQSWMGDGFPIHRGDIFHTINRLRKRKFNKRALEVMEWVIRERPYMPKQLDYSFLLEFTAKLHGIPQGEKLFSHIPSEFQDELLYNNLVIACLDKGMIRLSLAYMKKMRELGHSISYMVFNRLIILHSSPSRRKSIPKILTQMKADKVPRHVSTYNILLKMEASQHNIQGLNK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG096730
TK1151 IDTkAUNG096730
OH-1004 IDLXL04_036435
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)97.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG096730
位置ChrUn:27341545-27343281 (-)
描述Similar to At1g07590: Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g07590, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g07590 含五聚肽重复序列的蛋白 At1g07590，线粒体。 暂无已核实直接文献
At1g02370 含有五重复螺旋蛋白的 At1g02370，位于线粒体。 暂无已核实直接文献
At1g28020 假定含五肽重复蛋白 At1g28020。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036435 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0080156 mitochondrial mRNA modification 生物过程
GO:1902775 mitochondrial large ribosomal subunit assembly 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005840 ribosome 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:1990904 ribonucleoprotein complex 细胞组分
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
GO:0140978 mitochondrial large ribosomal subunit binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G02150
ath:AT1G07590
ath:AT1G15480
ath:AT1G60770
ath:AT1G80270
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.791
排名 1 · TkAUNG096730 · TK1151
质体0.134
排名 2 · TkAUNG096730 · TK1151
细胞核0.054
排名 3 · TkAUNG096730 · TK1151
细胞质0.030
排名 4 · TkAUNG096730 · TK1151
细胞膜0.010
排名 5 · TkAUNG096730 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF30136MSC6_C30-64 aa
PF13041PPR_231-39 aa
PF12854PPR_132-39 aa
PF26565PH_39110-195 aa
PF13812PPR_3116-143 aa
PF13041PPR_2169-201 aa
PF01535PPR172-199 aa
PF13812PPR_3172-211 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG096730PF30136MSC6_C30640.02914.4
TkAUNG096730PF13041PPR_231393.6e-33114.2
TkAUNG096730PF12854PPR_132391.1e-1351.4
TkAUNG096730PF26565PH_391101950.2112.0
TkAUNG096730PF13812PPR_31161431.8e-1660.7
TkAUNG096730PF13041PPR_21692013.6e-33114.2
TkAUNG096730PF01535PPR1721991.4e-2485.2
TkAUNG096730PF13812PPR_31722111.8e-1660.7
TkAUNG096730PF23276TPR_241812961e-1042.3
TkAUNG096730PF29070MSC6_N2214014.2e-1143.3
TkAUNG096730PF24760TPR_IF140_C2212650.006117.7
TkAUNG096730PF13812PPR_32252801.8e-1660.7
TkAUNG096730PF17177PPR_long2252783.4e-0833.8
TkAUNG096730PF13041PPR_22392833.6e-33114.2
TkAUNG096730PF12854PPR_12392471.1e-1351.4
TkAUNG096730PF19189Mtf22392840.07613.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q940Q2拟南芥sp|Q940Q2|PPR19_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g07590, mitochondrial64.100%Swiss-Prot高置信
Q9FZ24拟南芥sp|Q9FZ24|PPR4_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g02370, mitochondrial22.800%Swiss-Prot低置信
Q9C7F1拟南芥sp|Q9C7F1|PPR61_ARATH Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g2802022.700%Swiss-Prot低置信

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