TkAUNG091680 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkAUNG091680

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 25951989-25958629 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

6410 bp · TkAUNG091680|TK1151|cDNA

ATTACGTCGTTTAAAAAAAAATGGTACACTTGGATGTAATGTTTACCAAATTACCCTAGAATCCCTGAAATCCCCCGCCGTATCTTTCTTTGCAAAAACAAAGCCGCCTCTTTCTCTCTCGCCGCCGCAAGAGAGAAAGAAGACGGTGCTAATCACGCCGGAACGTTCGTCAGGGTGCCATTATTGAAATTTCTATCAGTATCAGCTTAAACCCTAAACCTTCAATACTTATCTCGTGACTTAATAATGTCTGCAAAATG...

CDS

下载 CDS FASTA

5976 bp · TkAUNG091680|TK1151|CDS

ATGTCTGCAAAATGGCGATCTTTACAGCATCGTCACCGCTACACTTACAGCGCAATCGTCTTTCCTCAATACTACAAACAAACTCTAGATGACTTCATTAAGTTGTCTGCATCTGAAGATCATGATGCCTCTGCTCGTGTGTTCTACTCGCAGCTCAACGAACTCGTTTCCCTCAATTCGACTTACGCGCAACTCAGTCACGCTAAAAAAATCGCTTTCGCTTTCACCGAGTTACTTAAAAATAGCAACGAGGTCGTTGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1991 aa · TkAUNG091680|TK1151|PROTEIN

MSAKWRSLQHRHRYTYSAIVFPQYYKQTLDDFIKLSASEDHDASARVFYSQLNELVSLNSTYAQLSHAKKIAFAFTELLKNSNEVVVSQASRFYLEILFLENSVPLHRTLVSVLAKTRDFQSVISDCFRSLCEEYADVNGNGNGKRKRFCVSRVGLSMMSSPKLGYLVEVVEECAILMSLDVVSSLNGVVLETNELSRPSPIVMEQCQEALSCIYYLLQRCPSKFTSLIGLQDSNIIENIITTILSILKSEAFSRDCFVA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG091680`
TK1151 ID	TkAUNG091680
OH-1004 ID	LXL04_024070
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	98.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkAUNG091680`
位置	ChrUn:25951989-25958629 (+)
描述	Similar to THADA: Thyroid adenoma-associated protein homolog
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_024070` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0002128 tRNA nucleoside ribose methylation 生物过程 GO:0030488 tRNA methylation 生物过程 GO:0032471 negative regulation of endoplasmic reticulum calcium ion concentration 生物过程 GO:0055088 lipid homeostasis 生物过程 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0030234 enzyme regulator activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用	cfa:100126180 gga:421398 mmu:240174 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.593

排名 1 · TkAUNG091680 · TK1151

细胞质0.360

排名 2 · TkAUNG091680 · TK1151

细胞膜0.049

排名 3 · TkAUNG091680 · TK1151

线粒体0.048

排名 4 · TkAUNG091680 · TK1151

高尔基体0.044

排名 5 · TkAUNG091680 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12333Ipi1_N507-540 aa

PF02985HEAT525-539 aa

PF02985HEAT555-571 aa

PF25150TPR_Trm732556-854 aa

PF12333Ipi1_N661-687 aa

PF10350DUF24281000-1270 aa

PF02985HEAT1264-1284 aa

PF25151TPR_Trm732_C1272-1432 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG091680	`PF12333`	Ipi1_N	507	540	0.14	13.3
TkAUNG091680	`PF02985`	HEAT	525	539	0.00068	20.4
TkAUNG091680	`PF02985`	HEAT	555	571	0.00068	20.4
TkAUNG091680	`PF25150`	TPR_Trm732	556	854	5.9e-20	72.5
TkAUNG091680	`PF12333`	Ipi1_N	661	687	0.14	13.3
TkAUNG091680	`PF10350`	DUF2428	1000	1270	2.1e-73	247.7
TkAUNG091680	`PF02985`	HEAT	1264	1284	0.00068	20.4
TkAUNG091680	`PF25151`	TPR_Trm732_C	1272	1432	2.2e-34	119.4
TkAUNG091680	`PF02985`	HEAT	1369	1396	0.00068	20.4
TkAUNG091680	`PF26719`	TPR_Atp25_C	1389	1485	0.00037	20.5
TkAUNG091680	`PF30095`	TBCD_C_yeast	1545	1601	0.033	14.1
TkAUNG091680	`PF25150`	TPR_Trm732	1550	1575	5.9e-20	72.5
TkAUNG091680	`PF02985`	HEAT	1553	1576	0.00068	20.4
TkAUNG091680	`PF25151`	TPR_Trm732_C	1603	1656	2.2e-34	119.4
TkAUNG091680	`PF25151`	TPR_Trm732_C	1670	1714	2.2e-34	119.4
TkAUNG091680	`PF26719`	TPR_Atp25_C	1680	1784	0.00037	20.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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