TkAUNG090210 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkAUNG090210

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 25611020-25613609 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1874 bp · TkAUNG090210|TK1151|cDNA

CATAAAGATATTATAAAAAAATCCAACTTGCTACCCGTGTCCCTCTTTCATCGACCCATCTCTAAACATCTAATCATCGTTTTCCTTTTCCATGGTTTTCTGACTTTCTCCATACTTCCACTGCAAAATTCTATTCTAGGGTTTTTTTAATTCCGTTAATGGCGCTCTCACACCCCTAAATTGGACACAACATCCATCTCCATGGAAGCTCGTAGTTACAGTAATGCTGCCGCATCCGCACCAGATGGCGGTACAGCTGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1353 bp · TkAUNG090210|TK1151|CDS

ATGGAAGCTCGTAGTTACAGTAATGCTGCCGCATCCGCACCAGATGGCGGTACAGCTGCTCCACCGCCTGCGCCGCCCCCGATGTCCACTGTCAATGCTCCGCCGCCGTTCTTGGTCAAAACTTACGATATGGTGGATGATCCGGCTACCGATAAGGTTGTTTCCTGGAGCGCTACGAATAACAGCTTCGTCGTCTGGGACCCGCCCGAATTCGCTAAAGACCTTTTGCCCAAATACTTCAAGCACAATAACTTCTCCAG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

450 aa · TkAUNG090210|TK1151|PROTEIN

MEARSYSNAAASAPDGGTAAPPPAPPPMSTVNAPPPFLVKTYDMVDDPATDKVVSWSATNNSFVVWDPPEFAKDLLPKYFKHNNFSSFVRQLNTYGFRKVDPDRWEFANEGFLRGQKHLLKTIIRRKSTSGHHQPAPQPHQQTSSTTACVEVGKFGLEEEVERLKRDKNVLMQELVRLRQQQQTTDTQMQSMVQRLQGMEQRQQQMMSFLAKAVNSPGFLAHFVQQQNESTKFITEGNKKRRYKEDGGVSDNSQDGRIVK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG090210`
TK1151 ID	TkAUNG090210
OH-1004 ID	LXL04_026121
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG090210

位置 ChrUn:25611020-25613609 (-)

描述 Similar to HSF8: Heat shock factor protein HSF8

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g17750`	特异性结合 DNA 序列 5'-AGAAnnTTCT-3' 的转录激活剂，称为热休克启动子元件 (HSE)。	暂无已核实直接文献
`At1g32330`	转录调控因子，特异性结合 DNA 序列 5'-AGAAnnTTCT-3'，该序列称为热休克启动子元件（HSE）。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os03g0854500`	转录调控因子，特异性结合热休克启动子元素（HSE）的DNA。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026121 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程

GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0034605 cellular response to heat 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0000978 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding 分子功能

GO:0003677 DNA binding 分子功能

GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G32330

ath:AT4G17750

dosa:Os03g0854500

sly:101263626

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.934

排名 1 · TkAUNG090210 · TK1151

细胞质0.178

排名 2 · TkAUNG090210 · TK1151

细胞膜0.024

排名 3 · TkAUNG090210 · TK1151

线粒体0.019

排名 4 · TkAUNG090210 · TK1151

内质网0.016

排名 5 · TkAUNG090210 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00447HSF_DNA-bind37-126 aa

PF05300MIC19_MIC2551-214 aa

PF14932HAUS-augmin3119-214 aa

PF07787TMEM43128-191 aa

PF12325TMF_TATA_bd133-210 aa

PF17675APG6_N157-207 aa

PF07407Seadorna_VP6157-214 aa

PF26095CC_Bre1157-202 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG090210	`PF00447`	HSF_DNA-bind	37	126	2.1e-30	105.9
TkAUNG090210	`PF05300`	MIC19_MIC25	51	214	0.0039	18.3
TkAUNG090210	`PF14932`	HAUS-augmin3	119	214	0.028	14.6
TkAUNG090210	`PF07787`	TMEM43	128	191	0.016	15.3
TkAUNG090210	`PF12325`	TMF_TATA_bd	133	210	0.0051	17.6
TkAUNG090210	`PF17675`	APG6_N	157	207	0.019	16.1
TkAUNG090210	`PF07407`	Seadorna_VP6	157	214	0.26	11.1
TkAUNG090210	`PF26095`	CC_Bre1	157	202	0.38	11.8
TkAUNG090210	`PF30810`	AFAP_C	158	205	0.055	14.4
TkAUNG090210	`PF20994`	CENPU	160	212	0.06	13.7
TkAUNG090210	`PF22709`	Mu_Gam-Sipho_Gp157-TOTE	171	197	0.22	12.1
TkAUNG090210	`PF29577`	FAM161_N	172	194	7.8	6.9
TkAUNG090210	`PF16937`	T3SS_HrpK1	180	280	0.11	13.1
TkAUNG090210	`PF29577`	FAM161_N	194	215	7.8	6.9
TkAUNG090210	`PF25868`	Fn1_3	224	246	0.022	14.9
TkAUNG090210	`PF22709`	Mu_Gam-Sipho_Gp157-TOTE	353	370	0.22	12.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P41151`	拟南芥	sp\|P41151\|HFA1A_ARATH Heat stress transcription factor A-1a	58.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LQM7`	拟南芥	sp\|Q9LQM7\|HFA1D_ARATH Heat stress transcription factor A-1d	47.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q84T61`	水稻	sp\|Q84T61\|HSFA1_ORYSJ Heat stress transcription factor A-1	50.700%	Swiss-Prot	高置信

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