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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 1703 条。当前显示第 16 / 18 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA08G253850
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
90.100
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TkA08G255800
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CM104805.1
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较可信
91.300
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00350 TkA08G255800
TkA08G257550
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
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TkA08G261460
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CM104802.1
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较可信
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TkA08G261460
TkA08G268320
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CM104805.1
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较可信
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
94.800
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JCVI_TKOH_00352 TkA08G270080
TkA08G270320
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CM104805.1
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较可信
92.700
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CM104805.1
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较可信
98.100
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JCVI_TKOH_00352 TkA08G270350
TkA08G293200
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CM104805.1
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较可信
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CM104805.1
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较可信
91.600
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JCVI_TKOH_00352 TkA08G302320
TkA08G314860
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CM104805.1
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较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 71.429
JCVI_TKOH_00354 TkA08G314860
TkA08G340540
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较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
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CM104803.1
较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
100.000
查询 96.838 / 对象 87.814
JCVI_TKOH_00340 TkA08G342490
TkA08G348770
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CM104799.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.300
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TkA08G348770
TkA08G361080
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
98.300
查询 88.806 / 对象 70.833
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CM104805.1
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较可信
94.100
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JCVI_TKOH_00357 TkA08G363480
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
91.500
查询 100.000 / 对象 91.509
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
94.000
查询 82.470 / 对象 94.372
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
94.400
查询 95.062 / 对象 88.846
JCVI_TKOH_00359 TkA08G394030
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
94.700
查询 100.000 / 对象 100.000
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较可信
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TkA08G402820
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较可信
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
90.100
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JCVI_TKOH_00361 TkA08G406180
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较可信
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JCVI_TKOH_00361 TkA08G406210
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
92.500
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JCVI_TKOH_00361 TkA08G406380
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.200
查询 95.610 / 对象 73.913
JCVI_TKOH_00362 TkA08G408260
TkA08G425870
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
95.700
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JCVI_TKOH_00363 TkA08G425870
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
92.000
查询 85.430 / 对象 78.338
JCVI_TKOH_00363 TkA08G426440
TkA08G430830
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
94.100
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00363 TkA08G430830
TkA08G431130
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.400
查询 98.214 / 对象 79.327
JCVI_TKOH_00363 TkA08G431130
TkA08G433360
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
99.000
查询 99.388 / 对象 71.829
JCVI_TKOH_00363 TkA08G433360
TkA08G433500
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CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
92.800
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00363 TkA08G433500
TkA08G434350
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GWHBCHF00000009
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Chr07:116045122-116046708 (+)
CM104805.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
94.300
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00363 TkA08G434350
TkAUNG000890
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CM104801.1
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较可信
99.700
查询 97.635 / 对象 100.000
TkAUNG000890
TkAUNG001350
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GWHBCHF00000001
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Chr02:107595102-107598930 (+)
CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
97.800
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG001350
TkAUNG001360
ChrUn:347360-355395 (+)
GWHBCHF00000001
LXL04_008742
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CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
95.300
查询 96.624 / 对象 93.641
TkAUNG001360
TkAUNG001500
ChrUn:403303-409588 (+)
GWHBCHF00000001
LXL04_007709
Chr02:57465879-57472094 (+)
CM104800.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
96.600
查询 100.000 / 对象 95.423
TkAUNG001500
TkAUNG001710
ChrUn:485536-489421 (+)
GWHBCHF00000001
LXL04_021920
Chr04:140266879-140270910 (+)
CM104802.1
较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
96.000
查询 100.000 / 对象 100.000
TkAUNG001710
TkAUNG001810
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GWHBCHF00000001
LXL04_030351
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较可信 1:1 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足
较可信
100.000
查询 100.000 / 对象 93.615
TkAUNG001810
TkAUNG002100
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GWHBCHF00000001
LXL04_035671
Chr08:26807044-26807526 (-)
CM104806.1
较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
97.500
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00416 TkAUNG002100
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LXL04_035669
Chr08:26779192-26780584 (+)
CM104806.1
较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
99.300
查询 99.322 / 对象 99.660
JCVI_TKOH_00416 TkAUNG002290
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GWHBCHF00000001
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较可信 1:1 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应
较可信
99.400
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