ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 1703 条。当前显示第 16 / 18 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA08G253850
Chr08:66268471-66268926 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_033362
Chr07:41678730-41679185 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00350 | TkA08G253850 |
|
TkA08G255800
Chr08:66699059-66703155 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_033378
Chr07:42121955-42125541 (-)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00350 | TkA08G255800 |
|
TkA08G257550
Chr08:67143839-67146610 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_033452
Chr07:44118650-44120721 (-)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00351 | TkA08G257550 |
|
TkA08G261460
Chr08:68158568-68159937 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_020673
Chr04:104378311-104379683 (+)
CM104802.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA08G261460 | |
|
TkA08G268320
Chr08:69932701-69933264 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_033488
Chr07:45534789-45535205 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.100 查询 73.944 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00352 | TkA08G268320 |
|
TkA08G270080
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GWHBCHF00000009
|
LXL04_033514
Chr07:45958877-45962037 (-)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00352 | TkA08G270080 |
|
TkA08G270320
Chr08:70425425-70430122 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_033521
Chr07:46122526-46125259 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.700 查询 91.954 / 对象 97.531 |
JCVI_TKOH_00352 | TkA08G270320 |
|
TkA08G270350
Chr08:70445011-70448291 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_033524
Chr07:46140310-46147491 (-)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.100 查询 98.639 / 对象 76.416 |
JCVI_TKOH_00352 | TkA08G270350 |
|
TkA08G293200
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GWHBCHF00000009
|
LXL04_033658
Chr07:51889165-51893381 (-)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.800 查询 98.693 / 对象 75.379 |
JCVI_TKOH_00352 | TkA08G293200 |
|
TkA08G302320
Chr08:78305624-78307160 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_033695
Chr07:53492862-53495228 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.600 查询 99.702 / 对象 84.383 |
JCVI_TKOH_00352 | TkA08G302320 |
|
TkA08G314860
Chr08:81369230-81369772 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_033846
Chr07:60655403-60657824 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 71.429 |
JCVI_TKOH_00354 | TkA08G314860 |
|
TkA08G340540
Chr08:87315717-87316776 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_025711
Chr05:115671815-115672741 (+)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
98.400 查询 98.930 / 对象 82.960 |
JCVI_TKOH_00340 | TkA08G340540 |
|
TkA08G342490
Chr08:87809153-87811056 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_025739
Chr05:116156274-116157837 (+)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
100.000 查询 96.838 / 对象 87.814 |
JCVI_TKOH_00340 | TkA08G342490 |
|
TkA08G348770
Chr08:89383638-89384337 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_004209
Chr01:129495896-129496595 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA08G348770 | |
|
TkA08G361080
Chr08:92537765-92539008 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_034116
Chr07:82906318-82908440 (-)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.300 查询 88.806 / 对象 70.833 |
JCVI_TKOH_00357 | TkA08G361080 |
|
TkA08G363480
Chr08:93141340-93142263 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_034135
Chr07:83882700-83883799 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.100 查询 95.200 / 对象 74.359 |
JCVI_TKOH_00357 | TkA08G363480 |
|
TkA08G382600
Chr08:97735183-97739365 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_034223
Chr07:91663781-91667355 (-)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.500 查询 100.000 / 对象 91.509 |
JCVI_TKOH_00358 | TkA08G382600 |
|
TkA08G390140
Chr08:99501407-99502195 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_034459
Chr07:101571279-101573632 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.000 查询 82.470 / 对象 94.372 |
JCVI_TKOH_00359 | TkA08G390140 |
|
TkA08G394030
Chr08:100479918-100480877 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_034443
Chr07:100877656-100878573 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.400 查询 95.062 / 对象 88.846 |
JCVI_TKOH_00359 | TkA08G394030 |
|
TkA08G394930
Chr08:100727408-100732332 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_034425
Chr07:100234293-100238631 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00359 | TkA08G394930 |
|
TkA08G402820
Chr08:102577125-102578805 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_003598
Chr01:87295465-87297146 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.000 查询 100.000 / 对象 89.030 |
TkA08G402820 | |
|
TkA08G405640
Chr08:103207710-103210042 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_034527
Chr07:103824032-103825579 (-)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.500 查询 94.444 / 对象 99.727 |
JCVI_TKOH_00361 | TkA08G405640 |
|
TkA08G406180
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GWHBCHF00000009
|
LXL04_034514
Chr07:103503038-103506937 (-)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.100 查询 87.173 / 对象 84.123 |
JCVI_TKOH_00361 | TkA08G406180 |
|
TkA08G406210
Chr08:103371203-103384215 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_034512
Chr07:103483208-103489286 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.900 查询 80.782 / 对象 87.544 |
JCVI_TKOH_00361 | TkA08G406210 |
|
TkA08G406380
Chr08:103417800-103420810 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_034511
Chr07:103399377-103402324 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00361 | TkA08G406380 |
|
TkA08G408260
Chr08:103923535-103928917 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_034239
Chr07:92806417-92811385 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.200 查询 95.610 / 对象 73.913 |
JCVI_TKOH_00362 | TkA08G408260 |
|
TkA08G425870
Chr08:108183366-108190728 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_034702
Chr07:114304938-114311322 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
95.700 查询 100.000 / 对象 80.000 |
JCVI_TKOH_00363 | TkA08G425870 |
|
TkA08G426440
Chr08:108339639-108344934 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_034705
Chr07:114386077-114388897 (-)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.000 查询 85.430 / 对象 78.338 |
JCVI_TKOH_00363 | TkA08G426440 |
|
TkA08G430830
Chr08:109491871-109498977 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_034727
Chr07:115133287-115139487 (-)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00363 | TkA08G430830 |
|
TkA08G431130
Chr08:109607664-109608170 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_034734
Chr07:115280465-115281091 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.400 查询 98.214 / 对象 79.327 |
JCVI_TKOH_00363 | TkA08G431130 |
|
TkA08G433360
Chr08:110161433-110164268 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_034749
Chr07:115726231-115731663 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.000 查询 99.388 / 对象 71.829 |
JCVI_TKOH_00363 | TkA08G433360 |
|
TkA08G433500
Chr08:110197235-110199925 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_034751
Chr07:115778844-115780819 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00363 | TkA08G433500 |
|
TkA08G434350
Chr08:110391179-110393272 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_034762
Chr07:116045122-116046708 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00363 | TkA08G434350 |
|
TkAUNG000890
ChrUn:203440-205393 (+)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_014481
Chr03:50155062-50156472 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.700 查询 97.635 / 对象 100.000 |
TkAUNG000890 | |
|
TkAUNG001350
ChrUn:347359-351623 (-)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_008743
Chr02:107595102-107598930 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
97.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkAUNG001350 | |
|
TkAUNG001360
ChrUn:347360-355395 (+)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_008742
Chr02:107591398-107595232 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
95.300 查询 96.624 / 对象 93.641 |
TkAUNG001360 | |
|
TkAUNG001500
ChrUn:403303-409588 (+)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_007709
Chr02:57465879-57472094 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
96.600 查询 100.000 / 对象 95.423 |
TkAUNG001500 | |
|
TkAUNG001710
ChrUn:485536-489421 (+)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_021920
Chr04:140266879-140270910 (+)
CM104802.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
96.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkAUNG001710 | |
|
TkAUNG001810
ChrUn:524159-527818 (+)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_030351
Chr06:114789554-114793381 (-)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 93.615 |
TkAUNG001810 | |
|
TkAUNG002100
ChrUn:646059-646541 (+)
GWHBCHF00000001
|
LXL04_035671
Chr08:26807044-26807526 (-)
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较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
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较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
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较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
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