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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG002760
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 878978-882027 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2677 bp · TkAUNG002760|TK1151|cDNA

GTCCAATTCCGACCTTTCACCTAAGAAAAACCGGCCCTTATATTTTTGGATTTATTAAAGCAACCTTTTTCTCATCTTTCAAAACCCATCAAAGAAAAATCATTTCTTGATATGGGTTCTCTCATATTCGATCCGATTTAGTGTGAACAACCCCCAGAAACTACACACAGGGACGATGGAGAAGGTATACGTGGCAATCGGGAATGACGTACAAGAAGGTTTTGCTACTCTCGAATGGACGCTAAGAAAATGGTCTTCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

2337 bp · TkAUNG002760|TK1151|CDS

ATGGAGAAGGTATACGTGGCAATCGGGAATGACGTACAAGAAGGTTTTGCTACTCTCGAATGGACGCTAAGAAAATGGTCTTCTTCTCCAATCTCCATTGTTATCCTTCATGCAGATATAAACAGGGACTATGTTTACACATATTATGGAAAACTCCCTGCGAGTTATGTGAACGATGAGAGTGTCGACTTACTTAATAAGTATCAACAAGGAAAACTGAACAAGATTCTACAGCAGTACATAGATTTTTGTGGCGAGGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

778 aa · TkAUNG002760|TK1151|PROTEIN

MEKVYVAIGNDVQEGFATLEWTLRKWSSSPISIVILHADINRDYVYTYYGKLPASYVNDESVDLLNKYQQGKLNKILQQYIDFCGEVKTETLNIEKYDEPIHTRILQLISGLRICKLVMGATFFKSFSSGKFGNLVMGLKKLQQKKPDFCEFYLISGGKLFFLKEENNEGFIEDDQGMTIAKLNKKRGSFKGWIGKMYPKNTRDSSSSSSSSADSPSIWERSTEEIEQYFNQLLNSNEDEEESETGQASNAIFENNEFTE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG002760
TK1151 IDTkAUNG002760
OH-1004 IDLXL04_014012
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG002760
位置ChrUn:878978-882027 (-)
描述Similar to PUB50: Putative U-box domain-containing protein 50
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g65500 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献
At2g45910 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献
At3g49060 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献
At2g19410 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献
At1g66880 叶锈病10抗病位点受体样蛋白激酶样 1.4。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0163000 起E3泛素连接酶的作用。
MODD Mediates Deactivation and Degradation of OsbZIP46 to Negatively Regulate ABA Signaling and Drought Resistance in Rice.2016 · DOI: 10.1105/tpc.16.00171
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014012 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0061630 ubiquitin protein ligase activity 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G19410
ath:AT2G45910
ath:AT5G61550
ath:AT5G65500
dosa:Os06g0163000
osa:4340220
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.486
排名 1 · TkAUNG002760 · TK1151
细胞核0.328
排名 2 · TkAUNG002760 · TK1151
细胞膜0.324
排名 3 · TkAUNG002760 · TK1151
内质网0.048
排名 4 · TkAUNG002760 · TK1151
高尔基体0.042
排名 5 · TkAUNG002760 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07160SKA154-73 aa
PF25190Tad557-86 aa
PF12795MscS_porin210-242 aa
PF07160SKA1278-404 aa
PF02601Exonuc_VII_L288-391 aa
PF30810AFAP_C288-349 aa
PF12795MscS_porin291-404 aa
PF13990YjcZ295-360 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG002760PF07160SKA154730.007416.8
TkAUNG002760PF25190Tad557860.6510.9
TkAUNG002760PF12795MscS_porin2102423.47.9
TkAUNG002760PF07160SKA12784040.007416.8
TkAUNG002760PF02601Exonuc_VII_L2883913.77.6
TkAUNG002760PF30810AFAP_C2883494.98.2
TkAUNG002760PF12795MscS_porin2914043.47.9
TkAUNG002760PF13990YjcZ2953600.2811.3
TkAUNG002760PF16331TolA_bind_tri3123731.59.7
TkAUNG002760PF22913NBAS_11th3143530.2611.9
TkAUNG002760PF07889DUF16643314002.19.1
TkAUNG002760PF30810AFAP_C3453794.98.2
TkAUNG002760PF13990YjcZ3554130.2811.3
TkAUNG002760PF04799Fzo_mitofusin3584167.06.8
TkAUNG002760PF22913NBAS_11th3624340.2611.9
TkAUNG002760PF25190Tad53724220.6510.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FGD7拟南芥sp|Q9FGD7|PUB50_ARATH Putative U-box domain-containing protein 5041.700%Swiss-Prot中等置信
Q8GUH1拟南芥sp|Q8GUH1|PUB33_ARATH U-box domain-containing protein 3326.900%Swiss-Prot低置信
Q94A51拟南芥sp|Q94A51|PUB32_ARATH U-box domain-containing protein 3226.600%Swiss-Prot低置信
Q8S8S7拟南芥sp|Q8S8S7|PUB34_ARATH U-box domain-containing protein 3433.800%Swiss-Prot低置信
F4HQ17拟南芥sp|F4HQ17|LRL14_ARATH LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.436.400%Swiss-Prot低置信
Q5WA76水稻sp|Q5WA76|PUB70_ORYSJ U-box domain-containing protein 7034.900%Swiss-Prot中等置信

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