RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG027250
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 7280995-7281930 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

936 bp · TkAUNG027250|TK1151|cDNA

ATGAATGGAACAATTGCGCCAGAGATGAAGAAGTTACCATTATTAGAACAGATTTTGTTGTCTCACAATGCTTTCACAGGTGAGACTCCGGAAGAAATTGGAGAGTGTGTTCATTTGGGGAGACTTGAATTGTCGTATAATAATTTCACTGGTGAAATACCTGAAAGCTTTGGGAAGTTAGTTAGTTTGAGGTCGCTTTACCTTAATAATATTAAGCTTTCAGGGGAGATACCTTCAAGTTTAGGTAACTGTGTTGGATT...

CDS

下载 CDS FASTA

936 bp · TkAUNG027250|TK1151|CDS

ATGAATGGAACAATTGCGCCAGAGATGAAGAAGTTACCATTATTAGAACAGATTTTGTTGTCTCACAATGCTTTCACAGGTGAGACTCCGGAAGAAATTGGAGAGTGTGTTCATTTGGGGAGACTTGAATTGTCGTATAATAATTTCACTGGTGAAATACCTGAAAGCTTTGGGAAGTTAGTTAGTTTGAGGTCGCTTTACCTTAATAATATTAAGCTTTCAGGGGAGATACCTTCAAGTTTAGGTAACTGTGTTGGATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

311 aa · TkAUNG027250|TK1151|PROTEIN

MNGTIAPEMKKLPLLEQILLSHNAFTGETPEEIGECVHLGRLELSYNNFTGEIPESFGKLVSLRSLYLNNIKLSGEIPSSLGNCVGLADVNLSHNRFNGHIPPGLLSDMIQNAIFFRSPGFLAVFYVGMLTSVLLAAICCVIGWRYLKRILSSNAEPETKSPPEMTQKFPRIMYKELSEATNGFDEQRLLGSGGYGRVYLGSLPDGTQIAVKVLQLETGNSTKSFNRECQVLKRIRHRNLIRIITACSLPDFKALVLPYM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG027250
TK1151 IDTkAUNG027250
OH-1004 IDLXL04_029816
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)91.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.357 / OH-1004 83.333
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG027250
位置ChrUn:7280995-7281930 (-)
描述Similar to At2g24130: Putative leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g24130
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g24130 推定的富含亮氨酸重复的受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g24130。 暂无已核实直接文献
At3g47570 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At3g47570。 暂无已核实直接文献
At5g59270 推测的含L型凝集素结构域的受体激酶II.2。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: Q1MX30 受体激酶，可检测稻瘟病菌 X.oryzae pv. oryzae 的蛋白 Ax21 以促进先天免疫。 暂无已核实直接文献
Os11g0569733 受体激酶，可检测稻瘟病菌 X.oryzae pv. oryzae 的蛋白 Ax21 以促进先天免疫。
Cleavage and nuclear localization of the rice XA21 immune receptor.2012 · DOI: 10.1038/ncomms1932
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029816 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G24130
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.804
排名 1 · TkAUNG027250 · TK1151
内质网0.108
排名 2 · TkAUNG027250 · TK1151
细胞质0.073
排名 3 · TkAUNG027250 · TK1151
细胞核0.047
排名 4 · TkAUNG027250 · TK1151
溶酶体／液泡0.043
排名 5 · TkAUNG027250 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13855LRR_810-24 aa
PF23286LRR_1312-55 aa
PF13855LRR_814-70 aa
PF00560LRR_115-36 aa
PF12799LRR_415-53 aa
PF13516LRR_620-28 aa
PF23598LRR_1427-89 aa
PF13516LRR_636-52 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG027250PF13855LRR_810246.2e-0936.2
TkAUNG027250PF23286LRR_1312550.00417.6
TkAUNG027250PF13855LRR_814706.2e-0936.2
TkAUNG027250PF00560LRR_115365.5e-1347.0
TkAUNG027250PF12799LRR_415534.4e-0627.5
TkAUNG027250PF13516LRR_620280.7710.7
TkAUNG027250PF23598LRR_1427890.0006119.4
TkAUNG027250PF13516LRR_636520.7710.7
TkAUNG027250PF13855LRR_838976.2e-0936.2
TkAUNG027250PF00560LRR_139605.5e-1347.0
TkAUNG027250PF00560LRR_162845.5e-1347.0
TkAUNG027250PF12799LRR_462954.4e-0627.5
TkAUNG027250PF13516LRR_662690.7710.7
TkAUNG027250PF23286LRR_13651190.00417.6
TkAUNG027250PF13855LRR_8811086.2e-0936.2
TkAUNG027250PF00560LRR_1901055.5e-1347.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZUI0拟南芥sp|Q9ZUI0|Y2241_ARATH Putative leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g2413047.700%Swiss-Prot中等置信
C0LGP4拟南芥sp|C0LGP4|Y3475_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g4757039.700%Swiss-Prot低置信
Q9FIF0拟南芥sp|Q9FIF0|LRK22_ARATH Putative L-type lectin-domain containing receptor kinase II.240.700%Swiss-Prot低置信
Q1MX30水稻sp|Q1MX30|XA21_ORYSI Receptor kinase-like protein Xa2139.300%Swiss-Prot中等置信
Q2R2D5水稻sp|Q2R2D5|XA21_ORYSJ Receptor kinase-like protein Xa2138.100%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看