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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG018680
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 4955390-4959980 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1120 bp · TkAUNG018680|TK1151|cDNA

CTAAAAAGAAAATATCTTCATGTTGAATATTCTCATTCACTAGATTTGAGATTATCCCTATATATCTGCCCAAAAAAACCATACATTTTCATTTAAAACCAAGACATGGCGGCTTTCCCAATATTCCGGTTGCCGGAGGTGTTTAATCCGGCCATAACCACTCATCACGGCCACAGATTCAATCACCAAAAACTCCTTGTCTCAAGCAGATGTATGCGAAGTCCTGCTAAAAAAACAAGAAATGGTCAGAATCATTACGA...

CDS

下载 CDS FASTA

888 bp · TkAUNG018680|TK1151|CDS

ATGGCGGCTTTCCCAATATTCCGGTTGCCGGAGGTGTTTAATCCGGCCATAACCACTCATCACGGCCACAGATTCAATCACCAAAAACTCCTTGTCTCAAGCAGATGTATGCGAAGTCCTGCTAAAAAAACAAGAAATGGTCAGAATCATTACGAGTTGCTTGGCGTATCTGTGGACTCCAATTCTAAAGAAATAAAAGAATCCTACAGAAAACTGCAAAAGAAATACCATCCAGATATTGCAGGCCAAAAGGGTCATGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

295 aa · TkAUNG018680|TK1151|PROTEIN

MAAFPIFRLPEVFNPAITTHHGHRFNHQKLLVSSRCMRSPAKKTRNGQNHYELLGVSVDSNSKEIKESYRKLQKKYHPDIAGQKGHEHTILLNEAYNVLMKDNLRKDYDASIGHVRVGFGGDALDMGHSSWNGPFRRHALFVDEKACIGCRECVHNARNTFIMDEILGCARVNVQFGDDDTSIEVAVESCPMDCIHWVEKEELAILEYFNIPRPKQGHGVFNQGWERPQNVFMAAKTFQKQQQQAQSESQSQHKTVRCDV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG018680
TK1151 IDTkAUNG018680
OH-1004 IDLXL04_023960
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)97.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 89.492 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG018680
位置ChrUn:4955390-4959980 (+)
描述Similar to DJC76: Chaperone protein dnaJ C76, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g23240 可能与HSC70分子伴侣一起作用，在盐胁迫期间帮助蛋白折叠并防止叶绿体内蛋白聚集（可能）。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023960 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006260 DNA replication 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0042026 protein refolding 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0031072 heat shock protein binding 分子功能
GO:0051082 unfolded protein binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G23240
sab:SAB1451c
sam:MW1531
sax:USA300HOU_1580
sca:SCA_1201
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.751
排名 1 · TkAUNG018680 · TK1151
线粒体0.197
排名 2 · TkAUNG018680 · TK1151
细胞核0.052
排名 3 · TkAUNG018680 · TK1151
细胞质0.028
排名 4 · TkAUNG018680 · TK1151
细胞膜0.010
排名 5 · TkAUNG018680 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12797Fer4_233-37 aa
PF00226DnaJ49-109 aa
PF07701HNOBA51-75 aa
PF30912TIM141_C52-101 aa
PF12838Fer4_7138-155 aa
PF12797Fer4_2140-154 aa
PF13459Fer4_15141-197 aa
PF14697Fer4_21141-196 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG018680PF12797Fer4_233370.02815.1
TkAUNG018680PF00226DnaJ491092.1e-1660.5
TkAUNG018680PF07701HNOBA51750.1911.9
TkAUNG018680PF30912TIM141_C521010.00318.2
TkAUNG018680PF12838Fer4_71381550.02715.6
TkAUNG018680PF12797Fer4_21401540.02815.1
TkAUNG018680PF13459Fer4_151411975.9e-0524.4
TkAUNG018680PF14697Fer4_211411960.001919.0
TkAUNG018680PF13237Fer4_101411909.47.0
TkAUNG018680PF13370Fer4_131421972.5e-1041.6
TkAUNG018680PF00037Fer41421540.03114.8
TkAUNG018680PF12837Fer4_61421540.08213.6
TkAUNG018680PF13187Fer4_91451550.06214.1
TkAUNG018680PF12838Fer4_71872020.02715.6
TkAUNG018680PF12797Fer4_21871910.02815.1
TkAUNG018680PF00037Fer41871950.03114.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FMX6拟南芥sp|Q9FMX6|DJC76_ARATH Chaperone protein dnaJ C76, chloroplastic41.600%Swiss-Prot中等置信

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