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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G293200
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 76000300-76002536 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1380 bp · TkA08G293200|TK1151|cDNA

ATGGCTCGATTATCAGACAGGAAAAAGTCTGTCGCGGCTTATGCTCCGAAGGGGCTCAACTTCATTAGCAAGGAGGAAGGCACAACGTGGGTCGCCTTGGAGAAGCGATTTAACGATCTCACCATGGACACCAATGGCTTACTTCCACGCTCGCGTTTCTGGGAATGCATCGGAATGAACGACAGTTCCCAAGAGTTTGCTGGGGAGCTGTTTGATGTATTAGCTCGAAGAAGGCAAATAAAAGGTGACTCGATTAACAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1380 bp · TkA08G293200|TK1151|CDS

ATGGCTCGATTATCAGACAGGAAAAAGTCTGTCGCGGCTTATGCTCCGAAGGGGCTCAACTTCATTAGCAAGGAGGAAGGCACAACGTGGGTCGCCTTGGAGAAGCGATTTAACGATCTCACCATGGACACCAATGGCTTACTTCCACGCTCGCGTTTCTGGGAATGCATCGGAATGAACGACAGTTCCCAAGAGTTTGCTGGGGAGCTGTTTGATGTATTAGCTCGAAGAAGGCAAATAAAAGGTGACTCGATTAACAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

459 aa · TkA08G293200|TK1151|PROTEIN

MARLSDRKKSVAAYAPKGLNFISKEEGTTWVALEKRFNDLTMDTNGLLPRSRFWECIGMNDSSQEFAGELFDVLARRRQIKGDSINKEEMYEFWGQISDESFESRLQTFFDMIDKDADGRITKEEVREIISLSASINNLSNIKNKAHEYAAFFMEELDPDNLGYLMTIMLKQIENLEMLLLQAPKHNMSGESRKLSHMLSQKLKTTQSGNPIKRWYDDLRFPKVSINSLYGAPTQGYKNYKVVLLVGIGIGATPLINIVQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G293200
TK1151 IDTkA08G293200
OH-1004 IDLXL04_033658
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)93.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.693 / OH-1004 75.379
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G293200
位置Chr08:76000300-76002536 (-)
描述Similar to RBOHC: Respiratory burst oxidase homolog protein C
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g51060 钙依赖性 NADPH 氧化酶，可产生超氧化物。
Reactive oxygen species produced by NADPH oxidase regulate plant cell growth.2003 · DOI: 10.1038/nature01485
Hydrogen peroxide mediates plant root cell response to nutrient deprivation.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0401707101
At5g47910 钙依赖性 NADPH 氧化酶，可产生超氧化物。
Arabidopsis gp91phox homologues AtrbohD and AtrbohF are required for accumulation of reactive oxygen intermediates in the plant defense response.2002 · DOI: 10.1073/pnas.012452499
NADPH oxidase AtrbohD and AtrbohF genes function in ROS-dependent ABA signaling in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1093/emboj/cdg277
Cytosolic ascorbate peroxidase 1 is a central component of the reactive oxygen gene network of Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1105/tpc.104.026971
Extracellular ATP induces the accumulation of superoxide via NADPH oxidases in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.073072
The role of NADPH oxidase and MAP kinase phosphatase in UV-B-dependent gene expression in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2006.01555.x
Arabidopsis thaliana expresses multiple lines of defense to counterattack Erwinia chrysanthemi.2007 · DOI: 10.1094/mpmi-20-7-0794
The MAP4 Kinase SIK1 Ensures Robust Extracellular ROS Burst and Antibacterial Immunity in Plants.2018 · DOI: 10.1016/j.chom.2018.08.007
At5g07390 钙依赖性 NADPH 氧化酶，可产生超氧化物。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033658 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009060 aerobic respiration 生物过程
GO:0010053 root epidermal cell differentiation 生物过程
GO:0033198 response to ATP 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004601 peroxidase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
GO:0016174 NAD(P)H oxidase H2O2-forming activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G51060
sot:102586476
sot:102598898
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.374
排名 1 · TkA08G293200 · TK1151
细胞质0.354
排名 2 · TkA08G293200 · TK1151
细胞核0.195
排名 3 · TkA08G293200 · TK1151
内质网0.080
排名 4 · TkA08G293200 · TK1151
高尔基体0.063
排名 5 · TkA08G293200 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08414NADPH_Ox6-104 aa
PF13202EF-hand_521-26 aa
PF23564EF-hand_FSTL130-66 aa
PF24764rva_472-116 aa
PF00036EF-hand_185-94 aa
PF13202EF-hand_585-93 aa
PF23564EF-hand_FSTL198-145 aa
PF13499EF-hand_7103-163 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G293200PF08414NADPH_Ox61043.3e-33114.8
TkA08G293200PF13202EF-hand_521266.5e-0523.0
TkA08G293200PF23564EF-hand_FSTL130660.0001423.0
TkA08G293200PF24764rva_4721160.03714.5
TkA08G293200PF00036EF-hand_185944.4e-0626.6
TkA08G293200PF13202EF-hand_585936.5e-0523.0
TkA08G293200PF23564EF-hand_FSTL1981450.0001423.0
TkA08G293200PF13499EF-hand_71031631.4e-0629.3
TkA08G293200PF13833EF-hand_81031250.1212.8
TkA08G293200PF00036EF-hand_11061314.4e-0626.6
TkA08G293200PF13405EF-hand_61061311e-0525.6
TkA08G293200PF13202EF-hand_51061286.5e-0523.0
TkA08G293200PF08414NADPH_Ox1101343.3e-33114.8
TkA08G293200PF00036EF-hand_11531654.4e-0626.6
TkA08G293200PF13833EF-hand_81531660.1212.8
TkA08G293200PF13405EF-hand_61561651e-0525.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O81210拟南芥sp|O81210|RBOHC_ARATH Respiratory burst oxidase homolog protein C33.300%Swiss-Prot中等置信
Q9FIJ0拟南芥sp|Q9FIJ0|RBOHD_ARATH Respiratory burst oxidase homolog protein D32.000%Swiss-Prot中等置信
O81209拟南芥sp|O81209|RBOHA_ARATH Respiratory burst oxidase homolog protein A31.900%Swiss-Prot中等置信

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