LXL04_026343 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_026343

当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 124925840-124927931 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1293 bp · LXL04_026343|LXL04_026343|OH1004|cDNA

ATGAGGACTTCAATGGCGGATTGGTGGGAAACTTGGCCAGCAAAAACAGCAGAATCTCTCTTTTCTTTCATGAACACATTagttttcgtttttcttgattTGTTGGATATCATAATGTGCGTTTTCTTCAGATATGTTGATGAGATTTTGGAGGGAAAGTCAACCCCATGTTATTGTCGAAGTCAAGGTCGAATTAATGGCTGTGAAGATAAAGACATTGGGATTTCAGATACTCTATTTGGAAGGAAAAACGTGTTTAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1293 bp · LXL04_026343|LXL04_026343|OH1004|CDS

ATGAGGACTTCAATGGCGGATTGGTGGGAAACTTGGCCAGCAAAAACAGCAGAATCTCTCTTTTCTTTCATGAACACATTAGTTTTCGTTTTTCTTGATTTGTTGGATATCATAATGTGCGTTTTCTTCAGATATGTTGATGAGATTTTGGAGGGAAAGTCAACCCCATGTTATTGTCGAAGTCAAGGTCGAATTAATGGCTGTGAAGATAAAGACATTGGGATTTCAGATACTCTATTTGGAAGGAAAAACGTGTTTAG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

430 aa · LXL04_026343|LXL04_026343|OH1004|PROTEIN

MRTSMADWWETWPAKTAESLFSFMNTLVFVFLDLLDIIMCVFFRYVDEILEGKSTPCYCRSQGRINGCEDKDIGISDTLFGRKNVFREIGFTRITQPKVSLSSNNTGTDDLREIRWSDCGCESCVSWINNGDDQKLHVVVKESSEGYQDSGKNVIFLHGFLSSSFLWTETVFPELGNSKYRLFAIDLLGFGNSPKPRECLYTLNDHLEMVEKSVIQKFNLTSFHLVAHSMGCIIALALAAKHPNNLKSITLIAPPYFLSS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_026343`
TK1151 ID	TkAUNG022790
OH-1004 ID	LXL04_026343
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	98.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_026343

位置 Chr05:124925840-124927931 (-)

描述 Similar to BDG4: Probable lysophospholipase BODYGUARD 4

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g17780`	参与角质层发育和形态发生。	暂无已核实直接文献
`At5g17720`	参与角质层发育和形态发生。	暂无已核实直接文献
`At1g64670`	通过促进角质和木栓质单体的装载，调控角质层的发育及形态发生。	The plant cuticle is required for osmotic stress regulation of abscisic acid biosynthesis and osmotic stress tolerance in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1105/tpc.110.081943
`At4g24140`	参与角质层发育和形态发生。	暂无已核实直接文献
`At5g41900`	参与角质层发育和形态发生。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026343 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程

GO:0009688 abscisic acid biosynthetic process 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0010115 regulation of abscisic acid biosynthetic process 生物过程

GO:0010143 cutin biosynthetic process 生物过程

GO:0010148 transpiration 生物过程

GO:0010224 response to UV-B 生物过程

GO:0010345 suberin biosynthetic process 生物过程

GO:0048527 lateral root development 生物过程

GO:0050832 defense response to fungus 生物过程

GO:0071555 cell wall organization 生物过程

GO:1901959 positive regulation of cutin biosynthetic process 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G64670

ath:AT4G24140

ath:AT5G17720

ath:AT5G17780

ath:AT5G41900

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.302

排名 1 · LXL04_026343 · OH-1004

高尔基体0.206

排名 2 · LXL04_026343 · OH-1004

细胞膜0.153

排名 3 · LXL04_026343 · OH-1004

细胞核0.150

排名 4 · LXL04_026343 · OH-1004

细胞质0.116

排名 5 · LXL04_026343 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12146.16Hydrolase_4152-404 aa

PF00561.27Abhydrolase_1153-405 aa

PF12697.14Abhydrolase_6154-415 aa

PF10230.16LIDHydrolase177-403 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_026343	`PF12146.16`	Hydrolase_4	152	404	6.1e-17	62.5
LXL04_026343	`PF00561.27`	Abhydrolase_1	153	405	6.9e-30	105.2
LXL04_026343	`PF12697.14`	Abhydrolase_6	154	415	4.7e-18	67.3
LXL04_026343	`PF10230.16`	LIDHydrolase	177	403	7.5e-07	29.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q700D5`	拟南芥	Probable lysophospholipase BODYGUARD 4	51.667%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9FN79`	拟南芥	Probable lysophospholipase BODYGUARD 5	47.981%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q8LFX7`	拟南芥	Probable lysophospholipase BODYGUARD 1	39.565%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`O22977`	拟南芥	Probable lysophospholipase BODYGUARD 3	37.764%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9FJ24`	拟南芥	Probable lysophospholipase BODYGUARD 2	37.555%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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