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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG002620
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 833598-836824 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2704 bp · TkAUNG002620|TK1151|cDNA

TTTCACTATAATAAACGACGACGTACAGTGTCAACGGTAACTTAGTTGGGAATTGGGAGCAATTTAAAATAAGGTATGATTCTGTTACAACGGCTACCTGCAACAACATTTCCTCCCCAAATCCTTCCACTCATACAAGTAATTTTTCCTAAAATTCTTCAATAAACCGATCACATTCAACAATCTCTCGATTCTCGTTCTGTTGATGGGTTAATCTTGACTCCGAACACCAGGTTATAACAAACAGTGAAAACATGACC...

CDS

下载 CDS FASTA

2190 bp · TkAUNG002620|TK1151|CDS

ATGACCGAAAAAGTTTATGAAGAGCTACACAATGCAAAAGCAGAAATCGAAAAGCTGAGATCAGAATACCATGAAAAATCCAGTCTCTGTAACAACTTGAAAAGATCACATGATGATCAAGTCAAAAAAATCCAAGAACTCAATCTAAAACTCGAAAAACAGCATCAAGAAACAGAATTAAAGACTGATGAAATCTATGCTGCAAATCAGTCACTCAAAGATCTTGAATGTAAACTTAAAGAAAAGGAGAATATCATAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

729 aa · TkAUNG002620|TK1151|PROTEIN

MTEKVYEELHNAKAEIEKLRSEYHEKSSLCNNLKRSHDDQVKKIQELNLKLEKQHQETELKTDEIYAANQSLKDLECKLKEKENIIKSFTSMNDKLRVDFNSKLQESEEEKTNILCLLDEANMKIQELEQKNRDFMDKIEVLKEGIVSVSQKKCASESKVAKASKQMRERGDLFEKLEEEKVNLEEQIKWKNEQFKHLEEAHEKIRNKLRIKEKEWDMEKSSFFDEISTLETKLDSQITLSEDLKRRLEISNQDLAHEQN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG002620
TK1151 IDTkAUNG002620
OH-1004 IDLXL04_014008
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 97.330
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG002620
位置ChrUn:833598-836824 (-)
描述Similar to At4g38062: Uncharacterized protein At4g38062
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g38062 未表征蛋白 At4g38062。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014008 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G38062
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.616
排名 1 · TkAUNG002620 · TK1151
细胞核0.312
排名 2 · TkAUNG002620 · TK1151
细胞膜0.091
排名 3 · TkAUNG002620 · TK1151
高尔基体0.045
排名 4 · TkAUNG002620 · TK1151
内质网0.040
排名 5 · TkAUNG002620 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF30966At4g38062_C14-253 aa
PF30964At4g38062_N15-263 aa
PF30966At4g38062_C105-340 aa
PF30966At4g38062_C256-478 aa
PF30964At4g38062_N260-351 aa
PF13784Fic_N262-304 aa
PF17743DUF5580270-299 aa
PF28237Asr1405_Asl0597281-325 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG002620PF30966At4g38062_C142533.1e-29102.9
TkAUNG002620PF30964At4g38062_N152637.7e-108361.6
TkAUNG002620PF30966At4g38062_C1053403.1e-29102.9
TkAUNG002620PF30966At4g38062_C2564783.1e-29102.9
TkAUNG002620PF30964At4g38062_N2603517.7e-108361.6
TkAUNG002620PF13784Fic_N2623043.48.5
TkAUNG002620PF17743DUF55802702990.05914.1
TkAUNG002620PF28237Asr1405_Asl05972813250.08213.7
TkAUNG002620PF30565DUF86322963560.1213.1
TkAUNG002620PF30964At4g38062_N3574537.7e-108361.6
TkAUNG002620PF13784Fic_N3654093.48.5
TkAUNG002620PF17743DUF55803764040.05914.1
TkAUNG002620PF28237Asr1405_Asl05973934070.08213.7
TkAUNG002620PF30565DUF86324014570.1213.1
TkAUNG002620PF13784Fic_N4064243.48.5
TkAUNG002620PF30964At4g38062_N4785917.7e-108361.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P0CB23拟南芥sp|P0CB23|Y4862_ARATH Uncharacterized protein At4g3806235.200%Swiss-Prot中等置信

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