ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 1703 条。当前显示第 3 / 18 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA01G608560
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GWHBCHF00000002
|
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CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00037 | TkA01G608560 |
|
TkA01G610450
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_000464
Chr01:8537607-8540161 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00037 | TkA01G610450 |
|
TkA01G611000
Chr01:154051516-154053657 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_000453
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CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.700 查询 79.381 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00037 | TkA01G611000 |
|
TkA01G612770
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_000422
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CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 98.945 / 对象 79.787 |
JCVI_TKOH_00037 | TkA01G612770 |
|
TkA01G613540
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GWHBCHF00000002
|
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CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.500 查询 99.740 / 对象 78.850 |
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|
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|
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CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.500 查询 94.323 / 对象 71.880 |
JCVI_TKOH_00037 | TkA01G617350 |
|
TkA01G617700
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_000351
Chr01:6560585-6561943 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
96.300 查询 75.472 / 对象 71.681 |
JCVI_TKOH_00037 | TkA01G617700 |
|
TkA01G621150
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_000310
Chr01:5744774-5745961 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.700 查询 97.290 / 对象 97.722 |
JCVI_TKOH_00037 | TkA01G621150 |
|
TkA01G623260
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GWHBCHF00000002
|
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CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00037 | TkA01G623260 |
|
TkA01G626990
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_000229
Chr01:4329102-4332263 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.800 查询 100.000 / 对象 71.143 |
JCVI_TKOH_00037 | TkA01G626990 |
|
TkA01G628200
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_000193
Chr01:3857936-3859653 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00037 | TkA01G628200 |
|
TkA01G628440
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GWHBCHF00000002
|
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CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.800 查询 96.089 / 对象 95.355 |
JCVI_TKOH_00037 | TkA01G628440 |
|
TkA01G629880
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_000169
Chr01:3575667-3576518 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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|
TkA01G630780
Chr01:159506825-159508719 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_000157
Chr01:3291577-3294770 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.100 查询 96.491 / 对象 71.868 |
JCVI_TKOH_00037 | TkA01G630780 |
|
TkA01G635650
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|
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CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.600 查询 99.697 / 对象 96.562 |
JCVI_TKOH_00037 | TkA01G635650 |
|
TkA01G636440
Chr01:161008859-161010085 (-)
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|
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Chr01:1794271-1796162 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.600 查询 99.731 / 对象 86.752 |
JCVI_TKOH_00037 | TkA01G636440 |
|
TkA01G636950
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|
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Chr01:1632068-1635196 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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|
TkA01G640380
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|
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CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.400 查询 94.653 / 对象 72.097 |
JCVI_TKOH_00037 | TkA01G640380 |
|
TkA01G640400
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|
LXL04_000038
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CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00037 | TkA01G640400 |
|
TkA01G640720
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_000025
Chr01:544204-546385 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.600 查询 86.100 / 对象 92.913 |
JCVI_TKOH_00037 | TkA01G640720 |
|
TkA02G017280
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|
LXL04_017662
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CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.000 查询 95.092 / 对象 73.113 |
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|
TkA02G017970
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|
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CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00076 | TkA02G017970 |
|
TkA02G019830
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|
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CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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|
TkA02G020220
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_017633
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CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00076 | TkA02G020220 |
|
TkA02G024430
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_017600
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CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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JCVI_TKOH_00076 | TkA02G024430 |
|
TkA02G024780
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|
LXL04_017601
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CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00076 | TkA02G024780 |
|
TkA02G028130
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_017569
Chr03:153610281-153617129 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.400 查询 100.000 / 对象 93.399 |
JCVI_TKOH_00076 | TkA02G028130 |
|
TkA02G037190
Chr02:9343472-9345757 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_017514
Chr03:152339422-152341298 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00076 | TkA02G037190 |
|
TkA02G042230
Chr02:10646253-10649465 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_017469
Chr03:149791594-149794852 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.900 查询 79.221 / 对象 84.806 |
JCVI_TKOH_00076 | TkA02G042230 |
|
TkA02G042850
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_017454
Chr03:149576778-149593229 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.900 查询 99.718 / 对象 78.792 |
JCVI_TKOH_00076 | TkA02G042850 |
|
TkA02G043030
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GWHBCHF00000003
|
LXL04_017448
Chr03:149517092-149529223 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.600 查询 100.000 / 对象 99.048 |
JCVI_TKOH_00076 | TkA02G043030 |
|
TkA02G044810
Chr02:11562827-11570848 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_017427
Chr03:148755479-148762804 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
97.800 查询 98.932 / 对象 75.880 |
JCVI_TKOH_00076 | TkA02G044810 |
|
TkA02G045240
Chr02:11673335-11675958 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_017402
Chr03:148320372-148322754 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.700 查询 100.000 / 对象 78.059 |
JCVI_TKOH_00076 | TkA02G045240 |
|
TkA02G047310
Chr02:12227257-12231094 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_017363
Chr03:147472817-147480802 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.200 查询 99.724 / 对象 70.772 |
JCVI_TKOH_00076 | TkA02G047310 |
|
TkA02G060210
Chr02:15673809-15674198 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_017290
Chr03:145095488-145096253 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 77.519 / 对象 90.909 |
JCVI_TKOH_00076 | TkA02G060210 |
|
TkA02G061870
Chr02:16166751-16169501 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_017265
Chr03:144581563-144584807 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.300 查询 100.000 / 对象 89.702 |
JCVI_TKOH_00076 | TkA02G061870 |
|
TkA02G061990
Chr02:16195431-16197692 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_017262
Chr03:144564721-144566684 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00076 | TkA02G061990 |
|
TkA02G067870
Chr02:17615659-17617158 (-)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_007008
Chr02:33406880-33408393 (-)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.000 查询 97.656 / 对象 96.310 |
TkA02G067870 | |
|
TkA02G073950
Chr02:19143328-19144065 (+)
GWHBCHF00000003
|
LXL04_017123
Chr03:141508113-141508454 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 76.087 / 对象 92.920 |
JCVI_TKOH_00076 | TkA02G073950 |
|
TkA02G074720
Chr02:19373047-19374737 (+)
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|
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|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
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较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
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较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
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较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00087 | TkA02G344210 |