TkA01G617700 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G617700

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 155891189-155899954 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2051 bp · TkA01G617700|TK1151|cDNA

TAAGAAATAACTTGACATGCTAATAATAAGGTCAAATATGATATACATATTTTGTCCAACTTTTTTTTTTTATAAAGTAAGCCAAAAAACAATACCAATGTCTCAGGGTAATAAGTAATAACACATATATATACAGTATAAACCACAATCAAGTTCGCAAAGCTTTAAGCCCCAAGAACAAAGTTGATAACTTAATAATTAAGATGGAAAAGGAAGAAGTGGTGGTGTTAGTGGTGCCCTTTGTGCTTCAAGGTCATCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1275 bp · TkA01G617700|TK1151|CDS

ATGAGCTCAGTCGTTCAAGATGTAGTTTCATATGAAAACGCAGAATCTTATGTCTTCCATGGTGCTTCGGCTTTCACCACGTTTTCGTACATTTGGGAAGCGAATGGAAGGCCATCTTTAGATGATACTGAATCGTATATGCAACTTACAAAGGTCCCTGCTCTTGAAGGTATTATACCCCCAGAAATTCTGGAATCCGTTATGTGTCATAGTATCTGCAGTACCTTTAATTCAGGCAATCTTCATGACACATGTAAAGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

424 aa · TkA01G617700|TK1151|PROTEIN

MSSVVQDVVSYENAESYVFHGASAFTTFSYIWEANGRPSLDDTESYMQLTKVPALEGIIPPEILESVMCHSICSTFNSGNLHDTCKVFDGKFIDFLSKQGLAGSTNQWAMGPFNPVAIIDNKNLNKRHKSLEWLDKQPQNSVIYVSFGTTTSFSDDEIRELANGLENSQHKFIWVLRDADKGDIFNGEIRRVELPEGFEERIEETGLVVREWAPQLEILAHPATGGFMSHCGWNSCMESITMGVPIAAWPMHSDQPRNAT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G617700`
TK1151 ID	TkA01G617700
OH-1004 ID	LXL04_000351
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	96.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 75.472 / OH-1004 71.681 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA01G617700`
位置	Chr01:155891189-155899954 (+)
描述	Similar to ZOG1: Zeatin O-glucosyltransferase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_000351` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0009101 glycoprotein biosynthetic process 生物过程 GO:0009690 cytokinin metabolic process 生物过程 GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程 GO:0010015 root morphogenesis 生物过程 GO:0010083 regulation of vegetative meristem growth 生物过程 GO:0010380 regulation of chlorophyll biosynthetic process 生物过程 GO:0010817 regulation of hormone levels 生物过程 GO:0045926 negative regulation of growth 生物过程 GO:0048316 seed development 生物过程 GO:0048439 flower morphogenesis 生物过程 GO:0080036 regulation of cytokinin-activated signaling pathway 生物过程 GO:0035251 UDP-glucosyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用	ag:AAD04166 zma:541881 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.675

排名 1 · TkA01G617700 · TK1151

细胞核0.182

排名 2 · TkA01G617700 · TK1151

过氧化物酶体0.122

排名 3 · TkA01G617700 · TK1151

质体0.085

排名 4 · TkA01G617700 · TK1151

线粒体0.063

排名 5 · TkA01G617700 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26168Glyco_transf_N1-115 aa

PF00201UDPGT133-262 aa

PF07249Cerato-platanin205-236 aa

PF06722EryCIII-like_C208-280 aa

PF04101Glyco_tran_28_C229-287 aa

PF21816Zap1_zf1230-239 aa

PF07249Cerato-platanin305-326 aa

PF00201UDPGT311-354 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G617700	`PF26168`	Glyco_transf_N	1	115	3.9e-13	50.6
TkA01G617700	`PF00201`	UDPGT	133	262	1.4e-31	110.6
TkA01G617700	`PF07249`	Cerato-platanin	205	236	0.1	13.5
TkA01G617700	`PF06722`	EryCIII-like_C	208	280	5.5e-05	23.9
TkA01G617700	`PF04101`	Glyco_tran_28_C	229	287	0.0028	18.4
TkA01G617700	`PF21816`	Zap1_zf1	230	239	0.28	11.6
TkA01G617700	`PF07249`	Cerato-platanin	305	326	0.1	13.5
TkA01G617700	`PF00201`	UDPGT	311	354	1.4e-31	110.6
TkA01G617700	`PF06722`	EryCIII-like_C	314	400	5.5e-05	23.9
TkA01G617700	`PF04101`	Glyco_tran_28_C	319	366	0.0028	18.4
TkA01G617700	`PF21816`	Zap1_zf1	320	329	0.28	11.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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