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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G042230
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 10646253-10649465 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1851 bp · TkA02G042230|TK1151|cDNA

ATGCCCACAGACTACGATTATTCTGATAACAACAATAACAACAACGACAACAACAATAATAACAACAACAACGATAACAACGACGACAACGGTAACAACAACAACGGCAACAACAATAATAACAACAACAACGGCAACAACAACAACAACGATAACTACAACGACAACGACAATAACAACAACAACAACAACAACAACGGCGGAAACAACAACAACAACAACAACAACGGCGGAAACAACAACAACAACAACAACAACAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1851 bp · TkA02G042230|TK1151|CDS

ATGCCCACAGACTACGATTATTCTGATAACAACAATAACAACAACGACAACAACAATAATAACAACAACAACGATAACAACGACGACAACGGTAACAACAACAACGGCAACAACAATAATAACAACAACAACGGCAACAACAACAACAACGATAACTACAACGACAACGACAATAACAACAACAACAACAACAACAACGGCGGAAACAACAACAACAACAACAACAACGGCGGAAACAACAACAACAACAACAACAACAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

616 aa · TkA02G042230|TK1151|PROTEIN

MPTDYDYSDNNNNNNDNNNNNNNNDNNDDNGNNNNGNNNNNNNNGNNNNNDNYNDNDNNNNNNNNNGGNNNNNNNNGGNNNNNNNNNGNNNNNNNNDKNNKNNNNGNQNSPPPPPPPPPPPPPPPPPPLGPPQAPLRHKFAPPHPHPRSSSDVNDTGNDILIVVGGVVAAGVLFFIMTLCVMACLKKRKRKRQDEMYYYNNYQRNAYQSQPPNDIHLKMPPPPNSGPASSEHGWVAVPPPPPPPMSEEFSTASFSGPFQP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G042230
TK1151 IDTkA02G042230
OH-1004 IDLXL04_017469
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)94.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 79.221 / OH-1004 84.806
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G042230
位置Chr02:10646253-10649465 (-)
描述Similar to PERK1: Proline-rich receptor-like protein kinase PERK1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g18470 在脱落酸（ABA）介导的Ca²⁺通道激活过程中必需。
Plasma membrane-associated proline-rich extensin-like receptor kinase 4, a novel regulator of Ca signalling, is required for abscisic acid responses in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03956.x
Arabidopsis proline-rich extensin-like receptor kinase 4 modulates the early event toward abscisic acid response in root tip growth.2009 · DOI: 10.4161/psb.4.11.9739
At3g24550 富脯氨酸受体样蛋白激酶 PERK1。 暂无已核实直接文献
At1g49270 富脯氨酸受体样蛋白激酶PERK7。 暂无已核实直接文献
At3g18810 推定的富脯氨酸受体样蛋白激酶 PERK6。 暂无已核实直接文献
At4g34440 蛋白激酶 PERK5，富含脯氨酸的受体样蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017469 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G49270
ath:AT2G18470
ath:AT3G24550
ath:AT4G34440
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.875
排名 1 · TkA02G042230 · TK1151
细胞质0.096
排名 2 · TkA02G042230 · TK1151
细胞核0.066
排名 3 · TkA02G042230 · TK1151
内质网0.061
排名 4 · TkA02G042230 · TK1151
高尔基体0.020
排名 5 · TkA02G042230 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02724CDC4519-100 aa
PF15345TMEM5135-35 aa
PF22812CR_prot_dom_plant119-191 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr160-196 aa
PF28230SCY_4732_161-195 aa
PF07178TraL161-203 aa
PF14575EphA2_TM165-204 aa
PF15345TMEM51166-211 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G042230PF02724CDC45191000.005315.8
TkA02G042230PF15345TMEM5135350.2911.6
TkA02G042230PF22812CR_prot_dom_plant1191910.0001422.9
TkA02G042230PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1601968.4e-45153.8
TkA02G042230PF28230SCY_4732_1611950.01515.8
TkA02G042230PF07178TraL1612030.2112.7
TkA02G042230PF14575EphA2_TM1652040.1213.8
TkA02G042230PF15345TMEM511662110.2911.6
TkA02G042230PF12104Tcell_CD4_C1721940.08613.7
TkA02G042230PF22812CR_prot_dom_plant2202240.0001422.9
TkA02G042230PF22812CR_prot_dom_plant2382450.0001422.9
TkA02G042230PF22812CR_prot_dom_plant2582670.0001422.9
TkA02G042230PF07178TraL2772960.2112.7
TkA02G042230PF00069Pkinase2935591.5e-42146.5
TkA02G042230PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2955628.4e-45153.8
TkA02G042230PF03109ABC13013210.02214.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZNQ8拟南芥sp|Q9ZNQ8|PERK4_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK470.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LV48拟南芥sp|Q9LV48|PERK1_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK171.600%Swiss-Prot中等置信
Q9XI96拟南芥sp|Q9XI96|PERK7_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK769.100%Swiss-Prot中等置信
Q9LS95拟南芥sp|Q9LS95|PERK6_ARATH Putative proline-rich receptor-like protein kinase PERK667.900%Swiss-Prot中等置信
Q8GX23拟南芥sp|Q8GX23|PERK5_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK569.900%Swiss-Prot中等置信

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