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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G017280
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 4063415-4065444 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1216 bp · TkA02G017280|TK1151|cDNA

TTCTATTTCTTTATAAGCAGCGAAGGGTTATCTGGTGGTACACAGAGAATCAAACAACCAACTACTCTCTGCTCAACAACGACAATGGCGGTAACACAAGGCAAATGGGTGAAGTTGAACCAAAAAGGAACCGGGCCCGGTGCACGAAGCTCACACGCAATCACCATTGTTGGACAAAAAGCATACGCCTTTGGTGGCGAGTTCACCCCACGCGTCCCCATCAACAACTCCCTCTACATCTTCGACCTCACCACCCAAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

981 bp · TkA02G017280|TK1151|CDS

ATGGCGGTAACACAAGGCAAATGGGTGAAGTTGAACCAAAAAGGAACCGGGCCCGGTGCACGAAGCTCACACGCAATCACCATTGTTGGACAAAAAGCATACGCCTTTGGTGGCGAGTTCACCCCACGCGTCCCCATCAACAACTCCCTCTACATCTTCGACCTCACCACCCAAACCTGGTCAACCGCCGAGTCCACAGGCGACATCCCGCCGCCACGTGTCGGCGTCACAATGGCCGCCATCGGGACCACCATCTATGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

326 aa · TkA02G017280|TK1151|PROTEIN

MAVTQGKWVKLNQKGTGPGARSSHAITIVGQKAYAFGGEFTPRVPINNSLYIFDLTTQTWSTAESTGDIPPPRVGVTMAAIGTTIYVFGGRDATHTELNELYSFDTLTNEWTLLSTGDTGPTHRSYHSVATDDHRHMYVFGGCGVAGRLNDLWAYDVVENNWVEFPLPGDNLKGRGGPGLGVVGGKIWVVYGFAGMEVDDVHYFDPDGKKWVEVETTGQKPTPRSVFSSVVVGKYVFVCGGEVDPSDLGHMGAGRFTHEV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G017280
TK1151 IDTkA02G017280
OH-1004 IDLXL04_017662
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.092 / OH-1004 73.113
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G017280
位置Chr02:4063415-4065444 (+)
描述Similar to NSP5: Nitrile-specifier protein 5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g16390 分化蛋白，负责构成性和由草食动物诱导的简单腈形成，特别是在根部。 暂无已核实直接文献
At2g33070 负责编制性和草食性诱导的简单腈形成的特异蛋白，尤其存在于种子中。
Nitrile-specifier proteins involved in glucosinolate hydrolysis in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1074/jbc.m807500200
Characterization of recombinant nitrile-specifier proteins (NSPs) of Arabidopsis thaliana: dependency on Fe(II) ions and the effect of glucosinolate substrate and reaction conditions.2012 · DOI: 10.1016/j.phytochem.2012.08.004
NSP-Dependent Simple Nitrile Formation Dominates upon Breakdown of Major Aliphatic Glucosinolates in Roots, Seeds, and Seedlings of Arabidopsis thaliana Columbia-0.2016 · DOI: 10.3389/fpls.2016.01821
Glucosinolate Content in Dormant and Germinating Arabidopsis thaliana Seeds Is Affected by Non-Functional Alleles of Classical Myrosinase and Nitrile-Specifier Protein Genes.2019 · DOI: 10.3389/fpls.2019.01549
At1g54040 指定蛋白，参与构成性和食草动物诱导的简单腈形成（通过相似性推测）。 暂无已核实直接文献
At3g16400 决定器蛋白，负责恒定及食草性诱导的简单硝基腈形成，尤其在幼苗和根部。 暂无已核实直接文献
At3g16410 分化蛋白，有助于构成性和由草食动物诱导的简单腈形成。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017662 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0010162 seed dormancy process 生物过程
GO:0019762 glucosinolate catabolic process 生物过程
GO:0080027 response to herbivore 生物过程
GO:0080028 nitrile biosynthetic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G33070
ath:AT3G16390
ath:AT3G16400
ath:AT3G16410
ath:AT5G48180
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.766
排名 1 · TkA02G017280 · TK1151
细胞核0.472
排名 2 · TkA02G017280 · TK1151
过氧化物酶体0.063
排名 3 · TkA02G017280 · TK1151
线粒体0.061
排名 4 · TkA02G017280 · TK1151
细胞膜0.040
排名 5 · TkA02G017280 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24981Beta-prop_ATRN-LZTR13-81 aa
PF24681Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC75-32 aa
PF13415Beta-prop_FBX425-111 aa
PF13964Beta-prop_Calicin6-142 aa
PF24996NANM7-90 aa
PF13854Kelch_HCF8-93 aa
PF13418Beta-prop_TYW418-72 aa
PF01344Kelch_120-64 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G017280PF24981Beta-prop_ATRN-LZTR13814.1e-39135.3
TkA02G017280PF24681Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC75327.4e-77258.3
TkA02G017280PF13415Beta-prop_FBX4251116.4e-49167.1
TkA02G017280PF13964Beta-prop_Calicin61421.3e-1248.1
TkA02G017280PF24996NANM7902.3e-0937.3
TkA02G017280PF13854Kelch_HCF8931.1e-2488.0
TkA02G017280PF13418Beta-prop_TYW418721.3e-0939.1
TkA02G017280PF01344Kelch_120641.7e-41140.0
TkA02G017280PF25210Kelch_FKB95211373.9e-1763.5
TkA02G017280PF07646Kelch_221625.6e-1245.7
TkA02G017280PF24681Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7232417.4e-77258.3
TkA02G017280PF27494Y4lK26380.1213.2
TkA02G017280PF25852DUF6242_C471532.3e-0628.1
TkA02G017280PF24996NANM481432.3e-0937.3
TkA02G017280PF07893DUF166851630.3111.1
TkA02G017280PF13418Beta-prop_TYW4701621.3e-0939.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O04318拟南芥sp|O04318|JAL27_ARATH Thiohydroximate-O-sulfate sulfur/sulfate-lyase (nitrile-forming) NSP348.700%Swiss-Prot中等置信
O49326拟南芥sp|O49326|JAL21_ARATH Thiohydroximate-O-sulfate sulfur/sulfate-lyase (nitrile-forming) NSP248.900%Swiss-Prot中等置信
Q8RY71拟南芥sp|Q8RY71|ESP_ARATH N-(sulfonatooxy)alkenimidothioic acid sulfate-lyase (epithionitrile-forming)48.200%Swiss-Prot中等置信
Q9SDM9拟南芥sp|Q9SDM9|JAL28_ARATH Thiohydroximate-O-sulfate sulfur/sulfate-lyase (nitrile-forming) NSP148.300%Swiss-Prot中等置信
O04316拟南芥sp|O04316|JAL29_ARATH Thiohydroximate-O-sulfate sulfur/sulfate-lyase (nitrile-forming) NSP448.000%Swiss-Prot中等置信

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