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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G259060
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 66122487-66129931 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4496 bp · TkA02G259060|TK1151|cDNA

GTTGATAATGTATTAAAGCACTAGTCAAATATAAATATTTTAAAATTTTCCTGTTTGTCTCTTTCACTTTGGTTTTGATTCCGAGCGGCATAATTACCTGCTCAGCTAGTGATCTCTCAGTGCTCTCTCTTGCCATAAAGGCAGTGTTAGCTCTGTGCACGTAACTCGACTCATCGGATTCAAAACAAAACCATCGAGTCTATTCGCATTCAGTCATTTCTTCAGAACTTCATCGGTTCAAAACTTGCATAATGGTAGAC...

CDS

下载 CDS FASTA

3816 bp · TkA02G259060|TK1151|CDS

ATGGTAGACGGTTCTTATGCACCGCTGCAAGCTAATCCACCGTCTGAAACAACCGAAAATGTTACTCCGATGGCTAATGCCGGAATGTTAAGTAAGCTTACATTTTGGTGGCTGAATCCGTTGCTTATGAAAGGAAAAAGTAAAGTTCTTGACGATAATGACATCCCAAAGTTACGAAAAGAAGACACAGCAGAAGAATGCTATTCCAGATTCATGGAGACGATTAAGAAACGAAGAGAAAGGAGTGTTTCCGGTGGCCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1271 aa · TkA02G259060|TK1151|PROTEIN

MVDGSYAPLQANPPSETTENVTPMANAGMLSKLTFWWLNPLLMKGKSKVLDDNDIPKLRKEDTAEECYSRFMETIKKRRERSVSGGHGGSDPSIFSTLFVWQSKQLVITGFFALIKVLAMASGPLILRAFIQFCQGKGSFQHEGYFLTLGLFLAKCLESVSERQLKFRNRLIGLQLKSMLCAAIYQKQLRLSNDAKLSYSSGQIMNYATVDTTRIGEFPFWFHHIWTIVLQISLGIFIIYYSVGVATISALLVIILTVVG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G259060
TK1151 IDTkA02G259060
OH-1004 IDLXL04_029563
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G259060
位置Chr02:66122487-66129931 (-)
描述Similar to ABCC10: ABC transporter C family member 10
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g59140 谷胱甘肽 S-结合物泵。 暂无已核实直接文献
At1g04120 谷胱甘肽 S-结合物泵。
The Arabidopsis thaliana ABC transporter AtMRP5 controls root development and stomata movement.2001 · DOI: 10.1093/emboj/20.8.1875
The plant multidrug resistance ABC transporter AtMRP5 is involved in guard cell hormonal signalling and water use.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.016012.x
Binding of sulfonylurea by AtMRP5, an Arabidopsis multidrug resistance-related protein that functions in salt tolerance.2004 · DOI: 10.1104/pp.103.027045
The Arabidopsis ATP-binding cassette protein AtMRP5/AtABCC5 is a high affinity inositol hexakisphosphate transporter involved in guard cell signaling and phytate storage.2009 · DOI: 10.1074/jbc.m109.030247
At3g13080 谷胱甘肽 S-结合物泵。
An ABC-transporter of Arabidopsis thaliana has both glutathione-conjugate and chlorophyll catabolite transport activity.1998 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.1998.00076.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XCD4 ABC 转运蛋白，可能影响植酸转运和区室化。 暂无已核实直接文献
Os03g0142800 ABC 转运蛋白，可能影响植酸转运和区室化。
Mutations of the multi-drug resistance-associated protein ABC transporter gene 5 result in reduction of phytic acid in rice seeds.2009 · DOI: 10.1007/s00122-009-1018-1
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029563 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0030007 intracellular potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008281 sulfonylurea receptor activity 分子功能
GO:0008559 ABC-type xenobiotic transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G04120
ath:AT3G59140
dosa:Os03g0142800
zma:100125659
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.462
排名 1 · TkA02G259060 · TK1151
溶酶体／液泡0.224
排名 2 · TkA02G259060 · TK1151
细胞质0.178
排名 3 · TkA02G259060 · TK1151
内质网0.167
排名 4 · TkA02G259060 · TK1151
高尔基体0.095
排名 5 · TkA02G259060 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00664ABC_membrane107-374 aa
PF03029ATP_bind_1361-417 aa
PF03193RsgA_GTPase412-471 aa
PF03308MeaB430-470 aa
PF00158Sigma54_activat431-470 aa
PF00005ABC_tran437-571 aa
PF00006ATP-synt_ab439-469 aa
PF01935DUF87440-471 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G259060PF00664ABC_membrane1073745e-49168.1
TkA02G259060PF03029ATP_bind_13614170.02115.3
TkA02G259060PF03193RsgA_GTPase4124710.000221.9
TkA02G259060PF03308MeaB4304700.003317.2
TkA02G259060PF00158Sigma54_activat4314700.05413.9
TkA02G259060PF00005ABC_tran4375712.1e-51174.8
TkA02G259060PF00006ATP-synt_ab4394690.00716.8
TkA02G259060PF01935DUF874404713.3e-0524.8
TkA02G259060PF19557BrxC-PglY_N4424670.04313.9
TkA02G259060PF13191AAA_164444713.3e-0525.2
TkA02G259060PF00270DEAD4444640.000819.9
TkA02G259060PF02367TsaE4444700.01615.9
TkA02G259060PF02463SMC_N4454703.2e-1040.5
TkA02G259060PF13476AAA_234454670.0004621.6
TkA02G259060PF12775AAA_74464720.007416.6
TkA02G259060PF05783DLIC4464770.01714.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LYS2拟南芥sp|Q9LYS2|AB10C_ARATH ABC transporter C family member 1055.800%Swiss-Prot高置信
Q7GB25拟南芥sp|Q7GB25|AB5C_ARATH ABC transporter C family member 543.800%Swiss-Prot中等置信
Q9LK64拟南芥sp|Q9LK64|AB3C_ARATH ABC transporter C family member 343.800%Swiss-Prot中等置信
A2XCD4水稻sp|A2XCD4|AB13C_ORYSI ABC transporter C family member 1344.700%Swiss-Prot中等置信
Q10RX7水稻sp|Q10RX7|AB13C_ORYSJ ABC transporter C family member 1344.700%Swiss-Prot中等置信

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