ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 2 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA01G030350
Chr01:7793866-7795179 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005639
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CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 100.000 / 对象 83.562 |
JCVI_TKOH_00003 | TkA01G030350 |
|
TkA01G030360
Chr01:7799641-7801304 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005640
Chr01:169717753-169719429 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00003 | TkA01G030360 |
|
TkA01G030400
Chr01:7815710-7816102 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_004062
Chr01:123828709-123829213 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
39.700 查询 94.615 / 对象 93.571 |
TkA01G030400 | |
|
TkA01G030790
Chr01:7912617-7919350 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005644
Chr01:169837667-169843587 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 100.000 / 对象 59.167 |
JCVI_TKOH_00003 | TkA01G030790 |
|
TkA01G031060
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_005605
Chr01:169102617-169107166 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.400 查询 100.000 / 对象 58.074 |
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|
TkA01G031360
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_005602
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CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.100 查询 100.000 / 对象 42.520 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G031360 |
|
TkA01G031380
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_005600
Chr01:169065098-169065803 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G031380 |
|
TkA01G031580
Chr01:8155859-8156209 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_033023
Chr07:34132751-34134656 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.400 查询 51.724 / 对象 29.902 |
TkA01G031580 | |
|
TkA01G032020
Chr01:8284173-8286673 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005588
Chr01:168932260-168938333 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.600 查询 98.053 / 对象 67.143 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G032020 |
|
TkA01G032130
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_005587
Chr01:168882384-168894609 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.300 查询 93.466 / 对象 56.041 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G032130 |
|
TkA01G033080
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_005570
Chr01:168537603-168546518 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 100.000 / 对象 5.719 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G033080 |
|
TkA01G033420
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_005571
Chr01:168548019-168568350 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.100 查询 97.304 / 对象 33.176 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G033420 |
|
TkA01G033540
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_005569
Chr01:168531037-168535393 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.200 查询 96.914 / 对象 62.384 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G033540 |
|
TkA01G034190
Chr01:8889212-8890662 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005566
Chr01:168436420-168437573 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G034190 |
|
TkA01G034310
Chr01:8929471-8933705 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005558
Chr01:168388840-168391741 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G034310 |
|
TkA01G034320
Chr01:8937800-8938513 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005557
Chr01:168380848-168383245 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 96.203 / 对象 34.545 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G034320 |
|
TkA01G034470
Chr01:8978913-8985405 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005554
Chr01:168346593-168352633 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G034470 |
|
TkA01G034690
Chr01:9023745-9024188 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_011635
Chr02:168622933-168624364 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.400 查询 51.701 / 对象 36.364 |
TkA01G034690 | |
|
TkA01G034760
Chr01:9038398-9040208 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_006768
Chr02:24875129-24877088 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
56.100 查询 62.565 / 对象 45.092 |
TkA01G034760 | |
|
TkA01G034940
Chr01:9087978-9088307 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005549
Chr01:168224005-168228998 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.000 查询 91.743 / 对象 38.023 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G034940 |
|
TkA01G035230
Chr01:9162916-9164482 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005548
Chr01:168136737-168139207 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 92.655 / 对象 50.000 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G035230 |
|
TkA01G036280
Chr01:9405645-9407674 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_019373
Chr04:30043620-30047987 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.100 查询 98.904 / 对象 51.535 |
TkA01G036280 | |
|
TkA01G036290
Chr01:9409632-9409994 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_018182
Chr04:8161463-8166715 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 10.619 |
TkA01G036290 | |
|
TkA01G036300
Chr01:9412391-9412747 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_025178
Chr05:107165915-107170156 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 92.373 / 对象 14.174 |
TkA01G036300 | |
|
TkA01G036940
Chr01:9539323-9541146 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005532
Chr01:167740707-167742539 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
83.500 查询 100.000 / 对象 98.578 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G036940 |
|
TkA01G037150
Chr01:9598867-9601981 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_002412
Chr01:48081562-48086235 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
58.000 查询 93.868 / 对象 37.265 |
TkA01G037150 | |
|
TkA01G037360
Chr01:9662891-9664388 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_007803
Chr02:62614174-62615474 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
36.100 查询 68.605 / 对象 53.953 |
TkA01G037360 | |
|
TkA01G037450
Chr01:9686004-9687335 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_033889
Chr07:63348479-63349593 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA01G037450 | |
|
TkA01G037580
Chr01:9719366-9724924 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005524
Chr01:166644712-166647367 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.500 查询 100.000 / 对象 40.764 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G037580 |
|
TkA01G037650
Chr01:9739562-9740737 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_026407
Chr05:125868958-125870100 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
60.300 查询 98.950 / 对象 93.947 |
TkA01G037650 | |
|
TkA01G037720
Chr01:9764875-9766075 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005519
Chr01:166518239-166532825 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
90.200 查询 94.326 / 对象 27.310 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G037720 |
|
TkA01G037770
Chr01:9783541-9790746 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_037528
Chr09:13121121-13134896 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
95.500 查询 87.525 / 对象 62.285 |
TkA01G037770 | |
|
TkA01G038610
Chr01:9974532-9976286 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_031606
Chr07:8294869-8297700 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.300 查询 91.156 / 对象 33.753 |
TkA01G038610 | |
|
TkA01G043290
Chr01:11197305-11203561 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005484
Chr01:165183333-165185047 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 99.468 / 对象 52.381 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G043290 |
|
TkA01G043320
Chr01:11207236-11207586 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_031274
Chr07:3805421-3810254 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
71.700 查询 45.690 / 对象 63.855 |
TkA01G043320 | |
|
TkA01G044390
Chr01:11478548-11479064 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005473
Chr01:164922664-164930206 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 100.000 / 对象 28.437 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G044390 |
|
TkA01G045160
Chr01:11683274-11684648 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005469
Chr01:164756449-164759486 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 100.000 / 对象 46.791 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G045160 |
|
TkA01G045580
Chr01:11783449-11783999 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_032390
Chr07:21686776-21687175 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.000 查询 34.247 / 对象 60.976 |
TkA01G045580 | |
|
TkA01G048560
Chr01:12533600-12542422 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005453
Chr01:164360765-164375008 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.200 查询 99.560 / 对象 49.260 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G048560 |
|
TkA01G048570
Chr01:12543035-12547936 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005453
Chr01:164360765-164375008 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 99.813 / 对象 30.467 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G048570 |
|
TkA01G048850
Chr01:12606754-12607800 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_007031
Chr02:34133158-34135419 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.200 查询 100.000 / 对象 57.453 |
TkA01G048850 | |
|
TkA01G048870
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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TkA01G048870 | |
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85.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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