TkA01G030790 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G030790

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 7912617-7919350 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2615 bp · TkA01G030790|TK1151|cDNA

TCTCCAGCTCGTGGATGTGTGGGTAACTCCAATGCGGGCCCCACTCAGACGCTCATCTTCCACTATCAATTAAATCATCACTGAAACAAAACCGACACAAATTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAACTCACCCGTGTGGATCCCTCCCTCCGACGCCGTCTTGCCATGAAAAGGGGGATACCCACCTCCTCCTCCTCCTCCCACCTCCGCCGTCTCTACTTCCTATCTCTAATGTCATTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1068 bp · TkA01G030790|TK1151|CDS

ATGAAAAGGGGGATACCCACCTCCTCCTCCTCCTCCCACCTCCGCCGTCTCTACTTCCTATCTCTAATGTCATTAATCCTATCCTTCTCCCTTTCTCCTCTCGCCCCTGTCCTCGCCGACACAGATCAGGAGGAGCTGCTTGAAGATACCGGCGTTGTCTTAGATAATAACGCCACTGTTACTTCTATTAATGCTTCTTCTACTACGGATAGAGAGAACAGCTTTGCTGGCATGATCGATCGTGCTTTGGAGAAAGAGTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

355 aa · TkA01G030790|TK1151|PROTEIN

MKRGIPTSSSSSHLRRLYFLSLMSLILSFSLSPLAPVLADTDQEELLEDTGVVLDNNATVTSINASSTTDRENSFAGMIDRALEKEFTESDQNQEEDAGSFNSSVAGQQAVLETVARVKSKKNDTKDDKSFQLHHVFDTDHGAEETPTLIDRKDNVFIISNFKSKYPVLQLDLRLISDLVVVIVSATCGGIAFACAGQPVITGYLLAGSVVGPGGLDVVSELVQVETVAQFGVIFLLFALGLEFSMAKLKVVRVVAVLGG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G030790`
TK1151 ID	TkA01G030790
OH-1004 ID	LXL04_005644
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	99.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 59.167 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G030790

位置 Chr01:7912617-7919350 (-)

描述 Similar to KEA4: K(+) efflux antiporter 4

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g11800`	可能作为电中性 K⁺/H⁺ 反向转运蛋白，参与 K⁺ 稳态及渗透调节。	Golgi-localized cation/proton exchangers regulate ionic homeostasis and skotomorphogenesis in Arabidopsis.2019 · DOI: 10.1111/pce.13452 K + Efflux Antiporters 4, 5, and 6 Mediate pH and K + Homeostasis in Endomembrane Compartments.2018 · DOI: 10.1104/pp.18.01053 Evidence for potassium transport activity of Arabidopsis KEA1-KEA6.2019 · DOI: 10.1038/s41598-019-46463-7
`At2g19600`	可能作为电中性 K⁺/H⁺ 反向转运蛋白，参与 K⁺ 稳态及渗透调节。	A novel AtKEA gene family, homolog of bacterial K+/H+ antiporters, plays potential roles in K+ homeostasis and osmotic adjustment in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1371/journal.pone.0081463 Golgi-localized cation/proton exchangers regulate ionic homeostasis and skotomorphogenesis in Arabidopsis.2019 · DOI: 10.1111/pce.13452 K + Efflux Antiporters 4, 5, and 6 Mediate pH and K + Homeostasis in Endomembrane Compartments.2018 · DOI: 10.1104/pp.18.01053 Evidence for potassium transport activity of Arabidopsis KEA1-KEA6.2019 · DOI: 10.1038/s41598-019-46463-7
`At5g51710`	可能作为电中性 K⁺/H⁺ 反向转运蛋白，参与 K⁺ 稳态及渗透调节。	A novel AtKEA gene family, homolog of bacterial K+/H+ antiporters, plays potential roles in K+ homeostasis and osmotic adjustment in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1371/journal.pone.0081463 Golgi-localized cation/proton exchangers regulate ionic homeostasis and skotomorphogenesis in Arabidopsis.2019 · DOI: 10.1111/pce.13452 K + Efflux Antiporters 4, 5, and 6 Mediate pH and K + Homeostasis in Endomembrane Compartments.2018 · DOI: 10.1104/pp.18.01053 Evidence for potassium transport activity of Arabidopsis KEA1-KEA6.2019 · DOI: 10.1038/s41598-019-46463-7
`At4g00630`	可能作为电中性 K⁺/H⁺ 反向转运蛋白，调节质体中的单价阳离子及 pH 稳态。	Arabidopsis KEA2, a homolog of bacterial KefC, encodes a K(+)/H(+) antiporter with a chloroplast transit peptide.2012 · DOI: 10.1016/j.bbamem.2012.04.011 A novel AtKEA gene family, homolog of bacterial K+/H+ antiporters, plays potential roles in K+ homeostasis and osmotic adjustment in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1371/journal.pone.0081463 Envelope K+/H+ Antiporters AtKEA1 and AtKEA2 Function in Plastid Development.2016 · DOI: 10.1104/pp.16.00995 Plastidial transporters KEA1 and KEA2 at the inner envelope membrane adjust stromal pH in the dark.2021 · DOI: 10.1111/nph.17042 Loss of function of the chloroplast membrane K + /H + antiporters AtKEA1 and AtKEA2 alters the ROS and NO metabolism but promotes drought stress resilience.2021 · DOI: 10.1016/j.plaphy.2021.01.010 Loss of inner-envelope K+/H+ exchangers impairs plastid rRNA maturation and gene expression.2021 · DOI: 10.1093/plcell/koab123 Exogenous sucrose influences KEA1 and KEA2 to regulate abscisic acid-mediated primary root growth in Arabidopsis.2022 · DOI: 10.1016/j.plantsci.2022.111209
`At1g01790`	可能作为电中性 K⁺/H⁺ 反向转运蛋白，参与叶绿体 K⁺ 稳态、渗透调节及质体发育。	A novel AtKEA gene family, homolog of bacterial K+/H+ antiporters, plays potential roles in K+ homeostasis and osmotic adjustment in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1371/journal.pone.0081463 Envelope K+/H+ Antiporters AtKEA1 and AtKEA2 Function in Plastid Development.2016 · DOI: 10.1104/pp.16.00995 Evidence for potassium transport activity of Arabidopsis KEA1-KEA6.2019 · DOI: 10.1038/s41598-019-46463-7 Plastidial transporters KEA1 and KEA2 at the inner envelope membrane adjust stromal pH in the dark.2021 · DOI: 10.1111/nph.17042 Loss of function of the chloroplast membrane K + /H + antiporters AtKEA1 and AtKEA2 alters the ROS and NO metabolism but promotes drought stress resilience.2021 · DOI: 10.1016/j.plaphy.2021.01.010 Loss of inner-envelope K+/H+ exchangers impairs plastid rRNA maturation and gene expression.2021 · DOI: 10.1093/plcell/koab123 Exogenous sucrose influences KEA1 and KEA2 to regulate abscisic acid-mediated primary root growth in Arabidopsis.2022 · DOI: 10.1016/j.plantsci.2022.111209

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005644 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0051897 positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction 生物过程

GO:0000138 Golgi trans cisterna 细胞组分

GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0015386 potassium:proton antiporter activity 分子功能

GO:0043495 protein-membrane adaptor activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G19600

ath:AT5G11800

ath:AT5G51710

hsa:55002

mmu:234076

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.467

排名 1 · TkA01G030790 · TK1151

内质网0.203

排名 2 · TkA01G030790 · TK1151

细胞质0.165

排名 3 · TkA01G030790 · TK1151

溶酶体／液泡0.163

排名 4 · TkA01G030790 · TK1151

细胞膜0.111

排名 5 · TkA01G030790 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00999Na_H_Exchanger183-345 aa

PF29119F13C5_C228-241 aa

PF29119F13C5_C264-280 aa

PF29119F13C5_C321-340 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G030790	`PF00999`	Na_H_Exchanger	183	345	7.5e-34	117.9
TkA01G030790	`PF29119`	F13C5_C	228	241	3.9	8.0
TkA01G030790	`PF29119`	F13C5_C	264	280	3.9	8.0
TkA01G030790	`PF29119`	F13C5_C	321	340	3.9	8.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`B5X0N6`	拟南芥	sp\|B5X0N6\|KEA6_ARATH K(+) efflux antiporter 6	74.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q9ZUN3`	拟南芥	sp\|Q9ZUN3\|KEA4_ARATH K(+) efflux antiporter 4	74.900%	Swiss-Prot	高置信
`Q8VYR9`	拟南芥	sp\|Q8VYR9\|KEA5_ARATH K(+) efflux antiporter 5	65.800%	Swiss-Prot	高置信
`O65272`	拟南芥	sp\|O65272\|KEA2_ARATH K(+) efflux antiporter 2, chloroplastic	36.500%	Swiss-Prot	低置信
`Q9ZTZ7`	拟南芥	sp\|Q9ZTZ7\|KEA1_ARATH K(+) efflux antiporter 1, chloroplastic	35.800%	Swiss-Prot	低置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看

基因详情