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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G057750
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 14890608-14892710 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1737 bp · TkA01G057750|TK1151|cDNA

ATGAGACGCCTTTCTGCTCTTGCTTCTAGGGTTGAACAAATCCCAAATCAAATTACACACAAGTCACTAAATCAACCAAAGCTCGAATCCAGTTCTTCATCCCACCACCAAAACCCTCCAGTCACCACCACTAATTTCACCGCAAGAGGTAAGTTTTCTTCACTTAACTCTCAATCGAAAACCCCCACTCATAAACCCATTGATCATCACTACATTTCCCAGATTCTTTCAAGAAAAGACTGGTACTTGCTTCTAAACCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1737 bp · TkA01G057750|TK1151|CDS

ATGAGACGCCTTTCTGCTCTTGCTTCTAGGGTTGAACAAATCCCAAATCAAATTACACACAAGTCACTAAATCAACCAAAGCTCGAATCCAGTTCTTCATCCCACCACCAAAACCCTCCAGTCACCACCACTAATTTCACCGCAAGAGGTAAGTTTTCTTCACTTAACTCTCAATCGAAAACCCCCACTCATAAACCCATTGATCATCACTACATTTCCCAGATTCTTTCAAGAAAAGACTGGTACTTGCTTCTAAACCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

578 aa · TkA01G057750|TK1151|PROTEIN

MRRLSALASRVEQIPNQITHKSLNQPKLESSSSSHHQNPPVTTTNFTARGKFSSLNSQSKTPTHKPIDHHYISQILSRKDWYLLLNHDLKSKKLSLNPRIIVSVLQNQENPLHNLIFYLWVSNINPSFAKNQSIRGVLANTLYRKGPVLLSKELINLVRTSNCSITEDSLCILINSWGRLGLAKYCSQVFDQISYLGLTPSTRLYNAVIDALVKSNALDLAYLKFHQMKADRCDPDRFTYNFLIHGVCKIGVIDEASRLM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G057750
TK1151 IDTkA01G057750
OH-1004 IDLXL04_005382
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 74.567 / OH-1004 48.318
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G057750
位置Chr01:14890608-14892710 (+)
描述Similar to PPR40: Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g16890 对线粒体复合体III的泛醌-细胞色素c氧化还原酶活性必需。
Arabidopsis PPR40 connects abiotic stress responses to mitochondrial electron transport.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.111260

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005382 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006397 mRNA processing 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0042775 mitochondrial ATP synthesis coupled electron transport 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G16890
ath:AT5G39710
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.765
排名 1 · TkA01G057750 · TK1151
质体0.115
排名 2 · TkA01G057750 · TK1151
细胞核0.056
排名 3 · TkA01G057750 · TK1151
细胞质0.030
排名 4 · TkA01G057750 · TK1151
细胞膜0.009
排名 5 · TkA01G057750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF19189Mtf229-70 aa
PF13041PPR_2158-175 aa
PF29070MSC6_N161-296 aa
PF12854PPR_1171-191 aa
PF01535PPR171-195 aa
PF23276TPR_24174-265 aa
PF13812PPR_3189-245 aa
PF12854PPR_1197-229 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G057750PF19189Mtf229700.1712.3
TkA01G057750PF13041PPR_21581752.1e-74246.1
TkA01G057750PF29070MSC6_N1612961.8e-2074.1
TkA01G057750PF12854PPR_11711914.2e-65215.9
TkA01G057750PF01535PPR1711954.1e-49162.2
TkA01G057750PF23276TPR_241742653.1e-2486.1
TkA01G057750PF13812PPR_31892451.1e-33115.8
TkA01G057750PF12854PPR_11972294.2e-65215.9
TkA01G057750PF08579RPM21972160.05114.7
TkA01G057750PF17177PPR_long1983354e-2176.1
TkA01G057750PF13041PPR_22002492.1e-74246.1
TkA01G057750PF01535PPR2052334.1e-49162.2
TkA01G057750PF29978ATP18_TPR2092460.0002721.6
TkA01G057750PF06239ECSIT_N2132320.008316.1
TkA01G057750PF12854PPR_12322644.2e-65215.9
TkA01G057750PF13041PPR_22382842.1e-74246.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LSQ2拟南芥sp|Q9LSQ2|PP239_ARATH Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g16890, mitochondrial59.800%Swiss-Prot中等置信

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