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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G037720
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 9764875-9766075 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

825 bp · TkA01G037720|TK1151|cDNA

CATTTGTCCAACTAAATAGTCGTCAAAGACTCAAATTTCCCCCCCGTCTCCCCTCACCTTCCTCCCCTTCTTTTCTTATAAAAATAAATAGACAGAGTTTACTCAAGTCATTCCACAAGCTGAATTCTCCTCCTTTTCAATTGAATTCTTCATATCTCCATCAACATGGGTGAAGCCAAGAAAATCGTTGTGAAGGTGGATGTACACGATGATAAACAGAAAAGGAAGGCTATGAAGGCAGTTTCAAAGCTTTCAGGGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

426 bp · TkA01G037720|TK1151|CDS

ATGGGTGAAGCCAAGAAAATCGTTGTGAAGGTGGATGTACACGATGATAAACAGAAAAGGAAGGCTATGAAGGCAGTTTCAAAGCTTTCAGGGATTGAGTCGTTAGCAATAGACATGAAAGACAAGAAATTGACGGTGATCGGGGATGTTGATCCAGTTTGTATCATCGGAAAACTTAAAAAGCATTGGTACGCTGAGATAGTGACCGTTGGGCCAGCCAAAGAAGAGAAGAAAGATGAAAAGAAGGACGAAAAGAAGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

141 aa · TkA01G037720|TK1151|PROTEIN

MGEAKKIVVKVDVHDDKQKRKAMKAVSKLSGIESLAIDMKDKKLTVIGDVDPVCIIGKLKKHWYAEIVTVGPAKEEKKDEKKDEKKDDKKDDDKDKKKKEEEENLKKWAAYQYQMCYTPCMTQRYCVQTIEEYPSNSCGIL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G037720
TK1151 IDTkA01G037720
OH-1004 IDLXL04_005519
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)90.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 94.326 / OH-1004 27.310
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G037720
位置Chr01:9764875-9766075 (+)
描述Similar to HIPP39: Heavy metal-associated isoprenylated plant protein 39
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g01490 可能的重金属结合蛋白。 暂无已核实直接文献
At5g52740 可能的重金属结合蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005519 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G01490
ath:AT5G52740
ath:AT5G52760
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.584
排名 1 · TkA01G037720 · TK1151
细胞膜0.342
排名 2 · TkA01G037720 · TK1151
细胞核0.335
排名 3 · TkA01G037720 · TK1151
细胞外0.060
排名 4 · TkA01G037720 · TK1151
线粒体0.044
排名 5 · TkA01G037720 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF09581Spore_III_AF5-115 aa
PF14851FAM1768-24 aa
PF00403HMA9-64 aa
PF02950Conotoxin14-28 aa
PF12220U1snRNP70_N27-109 aa
PF02724CDC4540-103 aa
PF25789TPR_NAA3563-121 aa
PF21532Bin2_C66-109 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G037720PF09581Spore_III_AF51150.05414.4
TkA01G037720PF14851FAM1768242.28.8
TkA01G037720PF00403HMA9644.5e-0937.3
TkA01G037720PF02950Conotoxin14282.010.1
TkA01G037720PF12220U1snRNP70_N271096.78.0
TkA01G037720PF02724CDC45401030.49.6
TkA01G037720PF25789TPR_NAA35631211.38.5
TkA01G037720PF21532Bin2_C661090.2811.6
TkA01G037720PF30881At4g14450721220.08113.9
TkA01G037720PF14851FAM176751062.28.8
TkA01G037720PF20644Rrn7_cyclin_N761270.1512.9
TkA01G037720PF02950Conotoxin761262.010.1
TkA01G037720PF00403HMA1261324.5e-0937.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O03982拟南芥sp|O03982|HIP39_ARATH Heavy metal-associated isoprenylated plant protein 3962.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LTE3拟南芥sp|Q9LTE3|HIP12_ARATH Heavy metal-associated isoprenylated plant protein 1248.600%Swiss-Prot中等置信

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