ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 1703 条。当前显示第 11 / 18 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA05G462780
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GWHBCHF00000006
|
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CM104802.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.800 查询 87.346 / 对象 90.265 |
JCVI_TKOH_00246 | TkA05G462780 |
|
TkA05G462900
Chr05:115947346-115948149 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_022360
Chr04:149138377-149139121 (-)
CM104802.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00246 | TkA05G462900 |
|
TkA05G463660
Chr05:116125437-116130327 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_022370
Chr04:149286930-149291663 (+)
CM104802.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.700 查询 100.000 / 对象 98.662 |
JCVI_TKOH_00246 | TkA05G463660 |
|
TkA05G468300
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GWHBCHF00000006
|
LXL04_022299
Chr04:147796150-147796536 (-)
CM104802.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA05G468300 | |
|
TkA05G468720
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GWHBCHF00000006
|
LXL04_022434
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CM104802.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.000 查询 100.000 / 对象 94.063 |
JCVI_TKOH_00246 | TkA05G468720 |
|
TkA05G469190
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GWHBCHF00000006
|
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Chr04:150541965-150542373 (-)
CM104802.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 70.192 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00246 | TkA05G469190 |
|
TkA05G470370
Chr05:117853325-117854795 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_022457
Chr04:150834854-150835180 (+)
CM104802.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 77.698 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00246 | TkA05G470370 |
|
TkA05G471060
Chr05:118244251-118245560 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_022481
Chr04:151209781-151211613 (+)
CM104802.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 96.373 / 对象 74.699 |
JCVI_TKOH_00246 | TkA05G471060 |
|
TkA05G471250
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GWHBCHF00000006
|
LXL04_022489
Chr04:151428615-151430996 (+)
CM104802.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.700 查询 100.000 / 对象 77.175 |
JCVI_TKOH_00246 | TkA05G471250 |
|
TkA05G471260
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GWHBCHF00000006
|
LXL04_022490
Chr04:151435376-151437969 (-)
CM104802.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00246 | TkA05G471260 |
|
TkA05G473380
Chr05:118806303-118806755 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_014931
Chr03:59830886-59831233 (-)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.400 查询 76.667 / 对象 100.000 |
TkA05G473380 | |
|
TkA06G008600
Chr06:2163732-2166483 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_026500
Chr05:127415114-127418274 (+)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.400 查询 88.722 / 对象 74.526 |
JCVI_TKOH_00259 | TkA06G008600 |
|
TkA06G009340
Chr06:2399870-2400433 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_026488
Chr05:127129826-127130389 (+)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00259 | TkA06G009340 |
|
TkA06G010760
Chr06:2784271-2792079 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_026453
Chr05:126486676-126493426 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.300 查询 97.776 / 对象 74.537 |
JCVI_TKOH_00260 | TkA06G010760 |
|
TkA06G011210
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|
LXL04_026463
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CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00260 | TkA06G011210 |
|
TkA06G011860
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|
LXL04_026480
Chr05:126947082-126949061 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.400 查询 100.000 / 对象 75.153 |
JCVI_TKOH_00260 | TkA06G011860 |
|
TkA06G013770
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GWHBCHF00000007
|
LXL04_026348
Chr05:125004097-125008572 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00263 | TkA06G013770 |
|
TkA06G015390
Chr06:4145087-4150391 (+)
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|
LXL04_026301
Chr05:124657936-124662247 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
97.100 查询 97.347 / 对象 74.273 |
JCVI_TKOH_00264 | TkA06G015390 |
|
TkA06G017200
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|
LXL04_026271
Chr05:124177238-124178385 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.100 查询 89.535 / 对象 77.966 |
JCVI_TKOH_00264 | TkA06G017200 |
|
TkA06G019010
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|
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Chr05:123538273-123539910 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.800 查询 95.607 / 对象 70.826 |
JCVI_TKOH_00264 | TkA06G019010 |
|
TkA06G022510
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|
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CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00264 | TkA06G022510 |
|
TkA06G023240
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|
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CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.600 查询 99.814 / 对象 71.182 |
JCVI_TKOH_00264 | TkA06G023240 |
|
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|
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CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.200 查询 77.778 / 对象 91.724 |
JCVI_TKOH_00264 | TkA06G023830 |
|
TkA06G024720
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|
LXL04_026146
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CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.300 查询 100.000 / 对象 89.617 |
JCVI_TKOH_00264 | TkA06G024720 |
|
TkA06G024850
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|
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Chr02:123959139-123959615 (+)
CM104800.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 84.962 / 对象 71.519 |
TkA06G024850 | |
|
TkA06G027530
Chr06:7441343-7444233 (+)
GWHBCHF00000007
|
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Chr05:120908875-120910493 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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JCVI_TKOH_00264 | TkA06G027530 |
|
TkA06G028050
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GWHBCHF00000007
|
LXL04_026087
Chr05:120737865-120739618 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.400 查询 100.000 / 对象 93.502 |
JCVI_TKOH_00264 | TkA06G028050 |
|
TkA06G028150
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GWHBCHF00000007
|
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Chr06:84154510-84157003 (+)
CM104804.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA06G028150 | |
|
TkA06G029810
Chr06:8073668-8079964 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_026052
Chr05:120157301-120162968 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00264 | TkA06G029810 |
|
TkA06G030650
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GWHBCHF00000007
|
LXL04_034558
Chr07:106044626-106046055 (-)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 94.194 / 对象 100.000 |
TkA06G030650 | |
|
TkA06G031710
Chr06:8622430-8628587 (+)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_026014
Chr05:119788475-119793392 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.800 查询 100.000 / 对象 76.299 |
JCVI_TKOH_00264 | TkA06G031710 |
|
TkA06G031840
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|
LXL04_031497
Chr07:6892030-6893500 (+)
CM104805.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA06G031840 | |
|
TkA06G031980
Chr06:8703280-8705051 (+)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_026008
Chr05:119710528-119711818 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00264 | TkA06G031980 |
|
TkA06G032680
Chr06:8811597-8815729 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025862
Chr05:117834700-117838471 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00265 | TkA06G032680 |
|
TkA06G032700
Chr06:8819891-8830594 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025863
Chr05:117842483-117853930 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.300 查询 100.000 / 对象 91.820 |
JCVI_TKOH_00265 | TkA06G032700 |
|
TkA06G034900
Chr06:9401539-9405083 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025904
Chr05:118351181-118355650 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.700 查询 99.079 / 对象 83.724 |
JCVI_TKOH_00265 | TkA06G034900 |
|
TkA06G036330
Chr06:9741023-9744418 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025923
Chr05:118614075-118616949 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.800 查询 97.804 / 对象 74.903 |
JCVI_TKOH_00265 | TkA06G036330 |
|
TkA06G036470
Chr06:9783203-9785322 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025929
Chr05:118655131-118656477 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 74.330 |
JCVI_TKOH_00265 | TkA06G036470 |
|
TkA06G036670
Chr06:9839079-9848743 (-)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025937
Chr05:118699219-118703340 (-)
CM104803.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00265 | TkA06G036670 |
|
TkA06G037900
Chr06:10156098-10157352 (+)
GWHBCHF00000007
|
LXL04_025957
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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90.100 查询 95.961 / 对象 87.543 |
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较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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|
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|
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100.000 查询 100.000 / 对象 73.394 |
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94.400 查询 99.511 / 对象 96.338 |
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