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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G063040
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 17009916-17013354 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3152 bp · TkA06G063040|TK1151|cDNA

AAACAGTAATACCGTCTAGGTTCTCTTCATGTGATCAAAAGAAATTGCTGCCCGTTGTCCCTTTTTCGTCTGTTCATGGTTTAGAGGGTGATTGGTTAATCGAATAAATGGAGGTTTCTTGCTTCAATGAGCTCGATTTTCGTCTCGTATGAAGTGGTTTCTTGTTTATTAATTGGATTTTTGTCTTGTGGTTGGTGGGTTCTTACTTTAAGCTCAACTTGAAGGGTTTTGGGGTCAACGGATTCAAGAAACCTATCGCA...

CDS

下载 CDS FASTA

2280 bp · TkA06G063040|TK1151|CDS

ATGTCGAAAAGTTTAGTATTTGGAGTCTTGATTGCTTCTTTGTTTCTATCAGTTTCGTTAGCTAACGATAACGAATTCGCTCACTGTCACTGTGATGATGAAGGATCATGGAATGCACATATAATCGAAAGCCAAAGAGTAAGCGATTTCTTGATAGCAATCGCGTATTTTTCAATCCCACTCGAATTACTTTACTTTCTTAGTTGTTCAAACGTGCCGTTCAAATGGGTTCTCGTTCAATTCATCGCATTCATCGTTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

759 aa · TkA06G063040|TK1151|PROTEIN

MSKSLVFGVLIASLFLSVSLANDNEFAHCHCDDEGSWNAHIIESQRVSDFLIAIAYFSIPLELLYFLSCSNVPFKWVLVQFIAFIVLCGLTHLINGWGYYGNQTFQLMMALTVAKLLTALVSCATAITLLTLIPLLLKFKVRELFLKQNVLELDQEVGIMKKQKEAGWHVRMLTHEIRKSLDRHTILYTTLVELSNTLVLQNCAVWMLNDSKSEMNLTHELRPNSSGYHSSIPKNDPDVLHITGKKGVTMLRVDSELAIQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G063040
TK1151 IDTkA06G063040
OH-1004 IDLXL04_035658
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 97.809
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G063040
位置Chr06:17009916-17013354 (-)
描述Similar to EIN4: Protein EIN4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g04580 与细菌双组分调节剂相关的乙烯受体。 暂无已核实直接文献
At3g23150 与细菌双组分调节剂相关的乙烯受体。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0169100 与细菌双组分调节剂相关的乙烯受体。
The ethylene receptor ETR2 delays floral transition and affects starch accumulation in rice.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.065391
UniProt: Q8H1X1 与细菌双组分调节剂相关的乙烯受体。 暂无已核实直接文献
UniProt: Q6T5K2 与细菌双组分调节剂相关的乙烯受体。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035658 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0010105 negative regulation of ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:2000904 regulation of starch metabolic process 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0000155 phosphorelay sensor kinase activity 分子功能
GO:0004673 protein histidine kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G04580
ath:AT3G23150
dosa:Os04g0169100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.376
排名 1 · TkA06G063040 · TK1151
高尔基体0.163
排名 2 · TkA06G063040 · TK1151
细胞膜0.139
排名 3 · TkA06G063040 · TK1151
细胞质0.134
排名 4 · TkA06G063040 · TK1151
细胞核0.133
排名 5 · TkA06G063040 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25487ETR1_N41-138 aa
PF00512HisKA170-179 aa
PF01590GAF182-329 aa
PF00512HisKA216-222 aa
PF01229Glyco_hydro_39307-409 aa
PF24896Receiver_CRE1360-360 aa
PF00512HisKA366-430 aa
PF02518HATPase_c477-598 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G063040PF25487ETR1_N411386.7e-41139.7
TkA06G063040PF00512HisKA1701791.7e-1144.7
TkA06G063040PF01590GAF1823291e-0836.5
TkA06G063040PF00512HisKA2162221.7e-1144.7
TkA06G063040PF01229Glyco_hydro_393074090.06312.8
TkA06G063040PF24896Receiver_CRE13603600.04414.7
TkA06G063040PF00512HisKA3664301.7e-1144.7
TkA06G063040PF02518HATPase_c4775980.001819.4
TkA06G063040PF24896Receiver_CRE16266700.04414.7
TkA06G063040PF00072Response_reg6337441.5e-2177.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZTP3拟南芥sp|Q9ZTP3|EIN4_ARATH Protein EIN458.900%Swiss-Prot高置信
Q0WPQ2拟南芥sp|Q0WPQ2|ETR2_ARATH Ethylene receptor 252.300%Swiss-Prot高置信
Q7XX84水稻sp|Q7XX84|ETR2_ORYSJ Ethylene receptor 253.000%Swiss-Prot高置信
Q8H1X1水稻sp|Q8H1X1|ETR2_ORYSI Ethylene receptor 252.800%Swiss-Prot高置信
Q6T5K2水稻sp|Q6T5K2|ETR3_ORYSI Ethylene receptor 350.200%Swiss-Prot高置信

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