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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_025848
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 117601449-117603494 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2046 bp · LXL04_025848|LXL04_025848|OH1004|cDNA

ATGAATGTATTGAGGTTATGTGTGATTGTTATACTTTCGGGGATTTCAGTAGCAGCTCAGCTCAACTCCACCTGCGATTCGAATGATTCGATGGCATTGAAGCATTTCATGAACGGAATGGATACCGCCATTGATGGATGGACTTCGAGGTCTTCCAATTGCTGTGATTGGGATGGCATTACTTGCGATTACTCTGGTAAGGTTATCAAATTGGAACTGTCACGGAAACGATTAGTGGGTACTTTGGCTGATTCACTGGC...

CDS

下载 CDS FASTA

2046 bp · LXL04_025848|LXL04_025848|OH1004|CDS

ATGAATGTATTGAGGTTATGTGTGATTGTTATACTTTCGGGGATTTCAGTAGCAGCTCAGCTCAACTCCACCTGCGATTCGAATGATTCGATGGCATTGAAGCATTTCATGAACGGAATGGATACCGCCATTGATGGATGGACTTCGAGGTCTTCCAATTGCTGTGATTGGGATGGCATTACTTGCGATTACTCTGGTAAGGTTATCAAATTGGAACTGTCACGGAAACGATTAGTGGGTACTTTGGCTGATTCACTGGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

681 aa · LXL04_025848|LXL04_025848|OH1004|PROTEIN

MNVLRLCVIVILSGISVAAQLNSTCDSNDSMALKHFMNGMDTAIDGWTSRSSNCCDWDGITCDYSGKVIKLELSRKRLVGTLADSLASLYQLRTLNLSRNLLKGTIATSIFHLAYLEILDLSSNEFSGSFPSSVNLPSIQLLDVSDNNLEGPIAPGLCINSTGIKELKLGVNYFAGEIPPEFENCSSLEHLCLDANLVSGIIPEYLFRLPKLFRLSLQDNNVIGQLQNTNPSNLLYFDISLNLISGILPDFFHTFPNLTY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_025848
TK1151 IDTkA06G039940
OH-1004 IDLXL04_025848
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)93.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 94.273
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_025848
位置Chr05:117601449-117603494 (+)
描述Similar to PSKR: Phytosulfokine receptor 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g02220 植物磺肽受体，具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性和鸟苷酸环化酶活性。
Disruption and overexpression of Arabidopsis phytosulfokine receptor gene affects cellular longevity and potential for growth.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.081109
The phytosulfokine (PSK) receptor is capable of guanylate cyclase activity and enabling cyclic GMP-dependent signaling in plants.2011 · DOI: 10.1074/jbc.m110.168823
The tyrosine-sulfated peptide receptors PSKR1 and PSY1R modify the immunity of Arabidopsis to biotrophic and necrotrophic pathogens in an antagonistic manner.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12050
At5g53890 具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性的植物硫肽受体。 暂无已核实直接文献
At1g17240 参与CLV3及CLV3样肽的感知，这些肽作为调节分生组织维护的细胞外信号。
Functional analyses of the CLAVATA2-like proteins and their domains that contribute to CLAVATA2 specificity.2010 · DOI: 10.1104/pp.109.148197
At1g72300 酪氨酸硫酸化糖肽受体，具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性。
Tyrosine-sulfated glycopeptide involved in cellular proliferation and expansion in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0706403104
The tyrosine-sulfated peptide receptors PSKR1 and PSY1R modify the immunity of Arabidopsis to biotrophic and necrotrophic pathogens in an antagonistic manner.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12050
Receptor kinase-mediated control of primary active proton pumping at the plasma membrane.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12680

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025848 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0010073 meristem maintenance 生物过程
GO:0031347 regulation of defense response 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0045851 pH reduction 生物过程
GO:0051707 response to other organism 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17240
ath:AT1G72300
ath:AT2G02220
ath:AT5G53890
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.846
排名 1 · LXL04_025848 · OH-1004
内质网0.086
排名 2 · LXL04_025848 · OH-1004
细胞质0.059
排名 3 · LXL04_025848 · OH-1004
细胞核0.039
排名 4 · LXL04_025848 · OH-1004
溶酶体／液泡0.030
排名 5 · LXL04_025848 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_227-63 aa
PF13855.13LRR_870-125 aa
PF23598.2LRR_1476-260 aa
PF13855.13LRR_891-149 aa
PF13855.13LRR_8165-221 aa
PF13855.13LRR_8305-364 aa
PF13855.13LRR_8328-387 aa
PF23598.2LRR_14367-463 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_025848PF08263.18LRRNT_227631.9e-0628.8
LXL04_025848PF13855.13LRR_8701255.8e-40135.6
LXL04_025848PF23598.2LRR_14762601.7e-1867.2
LXL04_025848PF13855.13LRR_8911495.8e-40135.6
LXL04_025848PF13855.13LRR_81652215.8e-40135.6
LXL04_025848PF13855.13LRR_83053645.8e-40135.6
LXL04_025848PF13855.13LRR_83283875.8e-40135.6
LXL04_025848PF23598.2LRR_143674631.7e-1867.2
LXL04_025848PF13855.13LRR_83784395.8e-40135.6
LXL04_025848PF12799.14LRR_44034448.8e-2690.1
LXL04_025848PF13855.13LRR_85145705.8e-40135.6
LXL04_025848PF23598.2LRR_145285901.7e-1867.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZVR7拟南芥Phytosulfokine receptor 148.733%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FN37拟南芥Phytosulfokine receptor 240.402%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9SHI3拟南芥Receptor-like protein 236.224%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9C7S5拟南芥Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 136.196%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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