ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 6347 条。当前显示第 31 / 64 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA04G062300
Chr04:16614043-16623999 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036233
Chr08:38265698-38270992 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.800 查询 100.000 / 对象 98.469 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G062300 |
|
TkA04G062330
Chr04:16629416-16633944 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036230
Chr08:38252362-38254866 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G062330 |
|
TkA04G062410
Chr04:16660276-16667052 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036227
Chr08:38222660-38228918 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
98.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G062410 |
|
TkA04G062430
Chr04:16670359-16670730 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036226
Chr08:38204257-38204628 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G062430 |
|
TkA04G062450
Chr04:16673834-16676037 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036224
Chr08:38199004-38200301 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G062450 |
|
TkA04G062460
Chr04:16676798-16679384 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036223
Chr08:38195285-38197497 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G062460 |
|
TkA04G062590
Chr04:16719622-16723483 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036221
Chr08:38116383-38119474 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
95.900 查询 94.600 / 对象 90.603 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G062590 |
|
TkA04G063150
Chr04:16851617-16852640 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036214
Chr08:37992374-37993016 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
98.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G063150 |
|
TkA04G063200
Chr04:16862533-16866432 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036210
Chr08:37980017-37983455 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G063200 |
|
TkA04G063670
Chr04:16971063-16972241 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036206
Chr08:37945634-37947043 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
95.400 查询 100.000 / 对象 83.582 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G063670 |
|
TkA04G064350
Chr04:17139150-17139827 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036202
Chr08:37851998-37852675 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
95.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G064350 |
|
TkA04G064370
Chr04:17144969-17150119 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036200
Chr08:37831717-37836997 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.300 查询 100.000 / 对象 98.482 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G064370 |
|
TkA04G064380
Chr04:17150981-17152622 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036199
Chr08:37827878-37829173 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G064380 |
|
TkA04G064390
Chr04:17153134-17155924 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036198
Chr08:37824501-37826267 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
98.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G064390 |
|
TkA04G066890
Chr04:17726394-17729815 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036166
Chr08:37405693-37408731 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G066890 |
|
TkA04G067350
Chr04:17853116-17856440 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036173
Chr08:37516977-37520102 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
95.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G067350 |
|
TkA04G067440
Chr04:17879405-17881007 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036174
Chr08:37535519-37536257 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G067440 |
|
TkA04G067450
Chr04:17881340-17883801 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036175
Chr08:37537002-37538495 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
97.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G067450 |
|
TkA04G067470
Chr04:17894125-17896990 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036176
Chr08:37549281-37551501 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G067470 |
|
TkA04G067500
Chr04:17909987-17913127 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036177
Chr08:37577904-37580183 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G067500 |
|
TkA04G067610
Chr04:17941215-17943594 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036180
Chr08:37608598-37610487 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
98.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G067610 |
|
TkA04G067620
Chr04:17943815-17944527 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036181
Chr08:37610865-37611370 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G067620 |
|
TkA04G067970
Chr04:18017518-18024138 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036184
Chr08:37646624-37652465 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
98.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G067970 |
|
TkA04G068020
Chr04:18046915-18049057 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036186
Chr08:37676081-37677525 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G068020 |
|
TkA04G068290
Chr04:18113075-18114307 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036188
Chr08:37745629-37746370 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G068290 |
|
TkA04G068350
Chr04:18131311-18133333 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036189
Chr08:37756436-37757553 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G068350 |
|
TkA04G068660
Chr04:18194652-18198106 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036196
Chr08:37788707-37790865 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G068660 |
|
TkA04G070980
Chr04:18806175-18808409 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036153
Chr08:36772186-36774223 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G070980 |
|
TkA04G071020
Chr04:18815963-18819508 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036152
Chr08:36761214-36764218 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G071020 |
|
TkA04G071390
Chr04:18919150-18921097 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036147
Chr08:36661442-36662765 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G071390 |
|
TkA04G071550
Chr04:18955862-18956236 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036145
Chr08:36613647-36614105 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
98.400 查询 100.000 / 对象 81.579 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G071550 |
|
TkA04G072540
Chr04:19192465-19194996 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036137
Chr08:36352999-36355115 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G072540 |
|
TkA04G072550
Chr04:19195003-19197621 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036136
Chr08:36350682-36352632 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G072550 |
|
TkA04G072630
Chr04:19209775-19210973 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036134
Chr08:36299050-36300863 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
98.600 查询 100.000 / 对象 80.460 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G072630 |
|
TkA04G072650
Chr04:19214899-19218367 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036133
Chr08:36292918-36295924 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G072650 |
|
TkA04G073510
Chr04:19390192-19393522 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036125
Chr08:36109153-36111931 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G073510 |
|
TkA04G073520
Chr04:19397168-19399773 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036124
Chr08:36084438-36086717 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
97.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G073520 |
|
TkA04G074340
Chr04:19579633-19581247 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036113
Chr08:35926328-35927940 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
98.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G074340 |
|
TkA04G076690
Chr04:20174424-20177741 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036087
Chr08:35495370-35496914 (-)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
96.100 查询 100.000 / 对象 94.239 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G076690 |
|
TkA04G077180
Chr04:20321031-20333143 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036082
Chr08:35438436-35441116 (+)
CM104806.1
|
严格 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 主共线性支持 严格 |
99.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G077180 |
|
TkA04G077910
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