TkA04G096360 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA04G096360

当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 25090012-25093234 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

835 bp · TkA04G096360|TK1151|cDNA

AATGTTTGCATTCTTCCACTTTCTATATCCTTTTGTAGAGAGAGTTTGCAAAACCCTCTCCAAAACCTCTTCTCCCTCTCAATCTCTCAGAAATTCAAAGCCCTCTGCAAATTCACATCTCCATCTACAAATCCGAGCCGCGTAATCAACCACAATGCTACTCGCAGCTACACCTATTTCCTTTTATGCTCCACCAAAGCCTCTTTCACCTGTAATACGTTCTTCTCCCCTGAAAACAAGAGATTTTGCTTCTATATTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

522 bp · TkA04G096360|TK1151|CDS

ATGCTACTCGCAGCTACACCTATTTCCTTTTATGCTCCACCAAAGCCTCTTTCACCTGTAATACGTTCTTCTCCCCTGAAAACAAGAGATTTTGCTTCTATATTCTCCACCACTACCCAATCCGTAACATCTTCAGTTCAGTCGCCGTCACGAAGGTTGCTTCCTACTCCACCTTCAGGAAAATTTCTCAGAGAAGACTACCTTGTTAAAAAGTTTTCTGCTAAAGAAATTCAGGATTTAGTAAGAGGAGAAAGAAACGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

173 aa · TkA04G096360|TK1151|PROTEIN

MLLAATPISFYAPPKPLSPVIRSSPLKTRDFASIFSTTTQSVTSSVQSPSRRLLPTPPSGKFLREDYLVKKFSAKEIQDLVRGERNVPLIIDFYATWCGPCILMAQELEMCVIGNNAMIVKVDTDDEYEFARDMQVRGLPTLYFISPDPTKDAIRTEGVIPIQMMRDIIDKDM

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA04G096360`
TK1151 ID	TkA04G096360
OH-1004 ID	LXL04_035922
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	96.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA04G096360

位置 Chr04:25090012-25093234 (+)

描述 Similar to CITRX: Thioredoxin-like protein CITRX, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g06730`	硫醇二硫化物氧化还原酶在叶绿体正常发育中发挥作用，最有可能通过调节质体编码聚合酶依赖性叶绿体转录。	Plastidial thioredoxin z interacts with two fructokinase-like proteins in a thiol-dependent manner: evidence for an essential role in chloroplast development in Arabidopsis and Nicotiana benthamiana.2010 · DOI: 10.1105/tpc.109.071001

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035922 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009657 plastid organization 生物过程

GO:0045454 cell redox homeostasis 生物过程

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009579 thylakoid 细胞组分

GO:0042644 chloroplast nucleoid 细胞组分

GO:0015035 protein-disulfide reductase activity 分子功能

GO:0015036 disulfide oxidoreductase activity 分子功能

GO:0047134 protein-disulfide reductase [NAD(P)H] activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G06730

sly:543657

sot:102585257

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.984

排名 1 · TkA04G096360 · TK1151

线粒体0.024

排名 2 · TkA04G096360 · TK1151

细胞核0.018

排名 3 · TkA04G096360 · TK1151

细胞质0.017

排名 4 · TkA04G096360 · TK1151

细胞膜0.011

排名 5 · TkA04G096360 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04756OST3_OST626-40 aa

PF00085Thioredoxin74-159 aa

PF13098Thioredoxin_284-171 aa

PF13899Thioredoxin_784-109 aa

PF04756OST3_OST6115-152 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA04G096360	`PF04756`	OST3_OST6	26	40	0.17	12.0
TkA04G096360	`PF00085`	Thioredoxin	74	159	5.6e-15	55.9
TkA04G096360	`PF13098`	Thioredoxin_2	84	171	3.7e-07	31.2
TkA04G096360	`PF13899`	Thioredoxin_7	84	109	0.0037	18.1
TkA04G096360	`PF04756`	OST3_OST6	115	152	0.17	12.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9M7X9`	拟南芥	sp\|Q9M7X9\|CITRX_ARATH Thioredoxin-like protein CITRX, chloroplastic	77.600%	Swiss-Prot	高置信

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