基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G096360 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:25090012-25093234 (+) |
| 描述 | Similar to CITRX: Thioredoxin-like protein CITRX%2C chloroplastic (Solanum lycopersicum OX%3D4081) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_035922 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g06730 |
硫醇二硫化物氧化还原酶在叶绿体正常发育中发挥作用,最有可能通过调节质体编码聚合酶 依赖性叶绿体转录。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009657 | plastid organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.101; 覆盖度=101.714; E 值=2.18e-81; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045454 | cell redox homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.101; 覆盖度=101.714; E 值=2.18e-81; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.101; 覆盖度=101.714; E 值=2.18e-81; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009579 | thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.851; 覆盖度=103.429; E 值=7.92e-79; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042644 | chloroplast nucleoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=69.231; 覆盖度=96.571; E 值=4.17e-77; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015035 | protein-disulfide reductase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.851; 覆盖度=103.429; E 值=7.92e-79; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015036 | disulfide oxidoreductase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.101; 覆盖度=101.714; E 值=2.18e-81; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0047134 | protein-disulfide reductase [NAD(P)H] activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.101; 覆盖度=101.714; E 值=2.18e-81; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblPlants | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G06730 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=69.231; 覆盖度=96.571; E 值=4.17e-77 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sly:543657 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.101; 覆盖度=101.714; E 值=2.18e-81 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sot:102585257 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.571; 覆盖度=100.0; E 值=1.09e-80 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |