TkA04G109470 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA04G109470

当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 28455300-28457130 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

927 bp · TkA04G109470|TK1151|cDNA

ATTTACAAAGAAGAGATAAACTAAAAACTCTTGGGCGTATCCATTTTAGGGTTTTACCACCTACTCATCTTTTCTTTTATCGACAAAACACAGAGAAAAATGGAGACTTCGCTCAGATACGGCGGAGATTCCACCGCTCTGAGAGTCAATACGAATAAGAAAGCTCCGACAGTAAGGTACGCCAGTGACGCCAGCGCCGCCCTCAAAATCCATGCTAAGCAGAAGTTCCGTATCGATTCCAACACTCGCCTTCAGCTTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

567 bp · TkA04G109470|TK1151|CDS

ATGGAGACTTCGCTCAGATACGGCGGAGATTCCACCGCTCTGAGAGTCAATACGAATAAGAAAGCTCCGACAGTAAGGTACGCCAGTGACGCCAGCGCCGCCCTCAAAATCCATGCTAAGCAGAAGTTCCGTATCGATTCCAACACTCGCCTTCAGCTTCATGGAGAACTTGATACAAGAATTGGAGCTCCAACTTTTTTCAGTGCACTTCTTCGATACTTCCCTCCAGAACTTTCAGCAAAAATTGGAGCCGGATTACA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

188 aa · TkA04G109470|TK1151|PROTEIN

METSLRYGGDSTALRVNTNKKAPTVRYASDASAALKIHAKQKFRIDSNTRLQLHGELDTRIGAPTFFSALLRYFPPELSAKIGAGLQYDRREKLHYNMHGKKSFPLTNDGFVNFVVKGRCDLDKDFQKPTPSGAAELVWNILDFQKDQDLRVKVGYEISEKIPYVQVRENNWTFTADANGKWNVKYNL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA04G109470`
TK1151 ID	TkA04G109470
OH-1004 ID	LXL04_035778
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA04G109470

位置 Chr04:28455300-28457130 (-)

描述 Similar to OEP21B: Outer envelope pore protein 21B, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g20816`	电压依赖的整流型阴离子通道，介导磷酸丙糖、3-磷酸甘油酸及无机磷酸（Pi）等在叶绿体与细胞质之间转运；方向取决于质体膜间隙中的ATP与磷酸丙糖之比：磷酸丙糖/ATP比值较高时（如光合作用期间）促进输出，ATP/磷酸丙糖比值较高时（如暗期）促进磷酸化溶质输入（基于相似性推测）。	暂无已核实直接文献
`At1g76405`	电压依赖的整流型阴离子通道，介导磷酸丙糖、3-磷酸甘油酸及无机磷酸（Pi）等在叶绿体与细胞质之间转运；方向取决于质体膜间隙中的ATP与磷酸丙糖之比：磷酸丙糖/ATP比值较高时（如光合作用期间）促进输出，ATP/磷酸丙糖比值较高时（如暗期）促进磷酸化溶质输入（基于相似性推测）。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: B8AFI8`	电压依赖的整流型阴离子通道，介导磷酸丙糖、3-磷酸甘油酸及无机磷酸（Pi）等在叶绿体与细胞质之间转运；方向取决于质体膜间隙中的ATP与磷酸丙糖之比：磷酸丙糖/ATP比值较高时（如光合作用期间）促进输出，ATP/磷酸丙糖比值较高时（如暗期）促进磷酸化溶质输入（基于相似性推测）。	暂无已核实直接文献
`Os02g0832200`	电压依赖的整流型阴离子通道，介导磷酸丙糖、3-磷酸甘油酸及无机磷酸（Pi）等在叶绿体与细胞质之间转运；方向取决于质体膜间隙中的ATP与磷酸丙糖之比：磷酸丙糖/ATP比值较高时（如光合作用期间）促进输出，ATP/磷酸丙糖比值较高时（如暗期）促进磷酸化溶质输入（基于相似性推测）。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035778 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0044070 regulation of monoatomic anion transport 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0009707 chloroplast outer membrane 细胞组分

GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分

GO:0034426 etioplast membrane 细胞组分

GO:0046930 pore complex 细胞组分

GO:0008308 voltage-gated monoatomic anion channel activity 分子功能

GO:0015288 porin activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G20816

ath:AT1G76405

dosa:Os02g0832200

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.877

排名 1 · TkA04G109470 · TK1151

线粒体0.115

排名 2 · TkA04G109470 · TK1151

细胞质0.026

排名 3 · TkA04G109470 · TK1151

细胞外0.018

排名 4 · TkA04G109470 · TK1151

细胞核0.013

排名 5 · TkA04G109470 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF30985OEP213-23 aa

PF30985OEP2125-188 aa

PF09961DUF219528-81 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA04G109470	`PF30985`	OEP21	3	23	2.4e-78	262.9
TkA04G109470	`PF30985`	OEP21	25	188	2.4e-78	262.9
TkA04G109470	`PF09961`	DUF2195	28	81	0.15	12.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q6ID99`	拟南芥	sp\|Q6ID99\|OP21A_ARATH Outer envelope pore protein 21A, chloroplastic	57.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FPG2`	拟南芥	sp\|Q9FPG2\|OP21B_ARATH Outer envelope pore protein 21B, chloroplastic	54.500%	Swiss-Prot	高置信
`B8AFI8`	水稻	sp\|B8AFI8\|OEP21_ORYSI Outer envelope pore protein 21, chloroplastic	39.400%	Swiss-Prot	中等置信
`Q6K965`	水稻	sp\|Q6K965\|OEP21_ORYSJ Outer envelope pore protein 21, chloroplastic	38.900%	Swiss-Prot	中等置信

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