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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G080550
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 21136560-21145658 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1724 bp · TkA04G080550|TK1151|cDNA

GAAAAAAAGTTATGGTACTAAATGCGTCTACCTCCATTCTCCCAACTTCTTTTTAAACCGCCATACATTTCATCTTCATAACTCGATCCAAACATCTTCCTTCCCATCATCCCACAATGTCTCCTCCCCTCGATTTTGAACTCATCTCAAAATGCAGTACGAAATCGAGATCCCACCAAACTGTGGCTTCATCCCTCAACAGTGCCCTACTCCTGTCCGGCAACCCTTTCCCGTACTACTTCCTCATAGCCCTGGAAGCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1422 bp · TkA04G080550|TK1151|CDS

ATGTCTCCTCCCCTCGATTTTGAACTCATCTCAAAATGCAGTACGAAATCGAGATCCCACCAAACTGTGGCTTCATCCCTCAACAGTGCCCTACTCCTGTCCGGCAACCCTTTCCCGTACTACTTCCTCATAGCCCTGGAAGCCGGAAACATATTCAGAGCTTTCATCCTATTACTCTCCTTCCCAATTATCCACACCATTTCCATCTTCTCCAAGTCTGTATCTATTCAGATCTTTATCTTCATCACGTTTGCCGGGTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

473 aa · TkA04G080550|TK1151|PROTEIN

MSPPLDFELISKCSTKSRSHQTVASSLNSALLLSGNPFPYYFLIALEAGNIFRAFILLLSFPIIHTISIFSKSVSIQIFIFITFAGLRIRDVELVSSSVLPRFYVGDVRPETWKVFNSFGKRYVVTSSPRVMVEHFAKNFLGADEVLGTELEVTKSGRATGFVKEPGVLIGEFKKSAILQEFEGSNLPDLGIGGGETDRDFMATCKEGYMVPQTRCEPLPKNKLLSPIIFHEGRLVQRPTPLVALLTFLWMPIGIFLSIL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G080550
TK1151 IDTkA04G080550
OH-1004 IDLXL04_036075
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.040 / OH-1004 92.540
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G080550
位置Chr04:21136560-21145658 (-)
描述Similar to GPAT6: Glycerol-3-phosphate 2-O-acyltransferase 6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g38110 将酰基-ACP 的酰基酯化至甘油-3-磷酸的 sn-2 位，这是角质生物合成中的一个步骤。
A distinct type of glycerol-3-phosphate acyltransferase with sn-2 preference and phosphatase activity producing 2-monoacylglycerol.2010 · DOI: 10.1073/pnas.0914149107
At1g01610 将酰基-ACP 的酰基酯化至甘油-3-磷酸的 sn-2 位，这是角质生物合成中的一个步骤。
A distinct type of glycerol-3-phosphate acyltransferase with sn-2 preference and phosphatase activity producing 2-monoacylglycerol.2010 · DOI: 10.1073/pnas.0914149107
UniProt: Q5XF03 将酰基-ACP 的酰基酯化至甘油-3-磷酸的 sn-1 位，这是甘油脂生物合成中的重要步骤。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036075 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0008654 phospholipid biosynthetic process 生物过程
GO:0009610 response to symbiotic fungus 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0010143 cutin biosynthetic process 生物过程
GO:0016024 CDP-diacylglycerol biosynthetic process 生物过程
GO:0036377 arbuscular mycorrhizal association 生物过程
GO:0046486 glycerolipid metabolic process 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004366 glycerol-3-phosphate O-acyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G01610
ath:AT2G38110
ath:AT4G00400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.342
排名 1 · TkA04G080550 · TK1151
细胞膜0.177
排名 2 · TkA04G080550 · TK1151
高尔基体0.176
排名 3 · TkA04G080550 · TK1151
溶酶体／液泡0.132
排名 4 · TkA04G080550 · TK1151
细胞质0.091
排名 5 · TkA04G080550 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23270HAD_RAM2_N22-211 aa
PF12710HAD64-185 aa
PF01553Acyltransferase298-399 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G080550PF23270HAD_RAM2_N222112.6e-58197.5
TkA04G080550PF12710HAD641855.6e-1143.9
TkA04G080550PF01553Acyltransferase2983991.6e-0835.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O80437拟南芥sp|O80437|GPAT6_ARATH Glycerol-3-phosphate 2-O-acyltransferase 672.500%Swiss-Prot高置信
Q9LMM0拟南芥sp|Q9LMM0|GPAT4_ARATH Glycerol-3-phosphate 2-O-acyltransferase 459.700%Swiss-Prot高置信
Q5XF03拟南芥sp|Q5XF03|GPAT8_ARATH Probable glycerol-3-phosphate acyltransferase 858.200%Swiss-Prot高置信

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