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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G088220
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 23063878-23071240 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

5079 bp · TkA04G088220|TK1151|cDNA

ATTTTAACCCCAGAAAATCCACCATTTCGGACCTCTTTTCTCTCCTTCTCTCTCTTCGGTTCAGCCGCACTACTGTTCATGCGCCTCCATATCCCACCATCATCAATCACCTGCTTCTGCTCTAGGGTTTCTTCTCCACTTTTAGGGTTTTCAGATACCCCATCTTTCTCATCGTGTCCCATCTAATCCTCCATCCCAGGGGTTTTGGAAGAAGCTGGATAATCCCCTCTCTTTTCTCAGAAGAATCTCCATGCGCCGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

4215 bp · TkA04G088220|TK1151|CDS

ATGGCATTGGGAGATTTGATGGAGTCTAGGTTTTCGCAATCGCAGTCGTCAATGGTGGCGATGGTGTCTAATCACCTCGACGGGTATTCGAATTTGCAACATTCTAATTTGAATCCAACTGTTGTTCTTCAAGACGGAGTAGTGGCTGGTAATAGGGATAGAGATTCTTCTTCTGATTCAGTAGTTGCAGTGCAGAGGAGGGAGAATCACATCAACAGGGAAAATAGTGATAGGGAAAGGGAAGATTCCGAAACTGTTGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1404 aa · TkA04G088220|TK1151|PROTEIN

MALGDLMESRFSQSQSSMVAMVSNHLDGYSNLQHSNLNPTVVLQDGVVAGNRDRDSSSDSVVAVQRRENHINRENSDREREDSETVASTTSYGVGNGNAVVTGITATSMAYLPQNIVLSELRHDAFEACTPSGPAESGLVSKWRPKDRMKTGCVALVLCLNISVDPPDVIKISPCARMECWIDPFSMAPQKALETIGKTLSFQYERWQPKAKYKIQLDPTVEEVKKLCTTCRKYAKSERVLFHYNGHGVPKPTSNGEIWF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G088220
TK1151 IDTkA04G088220
OH-1004 IDLXL04_035985
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G088220
位置Chr04:23063878-23071240 (+)
描述Similar to RAPTOR1: Regulatory-associated protein of TOR 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g08850 植物 TOR 激酶途径的可能组成部分，为 TOR 募集底物。
Arabidopsis TARGET OF RAPAMYCIN interacts with RAPTOR, which regulates the activity of S6 kinase in response to osmotic stress signals.2006 · DOI: 10.1105/tpc.105.035931
At5g01770 可能是植物TOR激酶通路的组成部分。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os12g0110000 TORC1复合物的组成部分，该复合物是控制植物发育的必需细胞生长调节因子。 暂无已核实直接文献
Os11g0109933 TORC1复合物的组成部分，该复合物是控制植物发育的必需细胞生长调节因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035985 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000045 autophagosome assembly 生物过程
GO:0001558 regulation of cell growth 生物过程
GO:0001932 regulation of protein phosphorylation 生物过程
GO:0001938 positive regulation of endothelial cell proliferation 生物过程
GO:0002181 cytoplasmic translation 生物过程
GO:0006974 DNA damage response 生物过程
GO:0008361 regulation of cell size 生物过程
GO:0009267 cellular response to starvation 生物过程
GO:0009410 response to xenobiotic stimulus 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0010492 maintenance of shoot apical meristem identity 生物过程
GO:0010506 regulation of autophagy 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G08850
ath:AT5G01770
dosa:Os11g0109933
dosa:Os12g0110000
osa:136354644
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.620
排名 1 · TkA04G088220 · TK1151
细胞核0.201
排名 2 · TkA04G088220 · TK1151
高尔基体0.187
排名 3 · TkA04G088220 · TK1151
溶酶体／液泡0.146
排名 4 · TkA04G088220 · TK1151
细胞膜0.110
排名 5 · TkA04G088220 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14538Raptor_N149-300 aa
PF00656Peptidase_C14213-336 aa
PF13513HEAT_EZ550-569 aa
PF02985HEAT551-572 aa
PF23098Beta-prop_NOL10_N574-599 aa
PF02985HEAT608-624 aa
PF28344BRAT1670-750 aa
PF02985HEAT688-716 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G088220PF14538Raptor_N1493002.3e-71239.2
TkA04G088220PF00656Peptidase_C142133360.0215.3
TkA04G088220PF13513HEAT_EZ5505690.0008620.5
TkA04G088220PF02985HEAT5515721.6e-0731.6
TkA04G088220PF23098Beta-prop_NOL10_N5745995.3e-0833.1
TkA04G088220PF02985HEAT6086241.6e-0731.6
TkA04G088220PF28344BRAT16707500.01214.6
TkA04G088220PF02985HEAT6887161.6e-0731.6
TkA04G088220PF13646HEAT_26887870.000222.3
TkA04G088220PF13513HEAT_EZ6917130.0008620.5
TkA04G088220PF13513HEAT_EZ7397660.0008620.5
TkA04G088220PF02985HEAT7407681.6e-0731.6
TkA04G088220PF29037DSE1_N7597814.1e-0523.6
TkA04G088220PF25460Beta-prop_Aladin7727910.01115.7
TkA04G088220PF28344BRAT18889160.01214.6
TkA04G088220PF27534NovG_helical8939290.009216.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93YQ1拟南芥sp|Q93YQ1|RTOR1_ARATH Regulatory-associated protein of TOR 171.400%Swiss-Prot高置信
Q9LZW9拟南芥sp|Q9LZW9|RTOR2_ARATH Regulatory-associated protein of TOR 266.700%Swiss-Prot高置信
Q0IQN5水稻sp|Q0IQN5|RTOR2_ORYSJ Regulatory-associated protein of TOR 270.800%Swiss-Prot高置信
C7J8E5水稻sp|C7J8E5|RTOR1_ORYSJ Regulatory-associated protein of TOR 169.900%Swiss-Prot高置信

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