ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 1703 条。当前显示第 1 / 18 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA01G000340
Chr01:81790-84409 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_036623
Chr08:45638172-45640331 (+)
CM104806.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
99.600 查询 92.129 / 对象 97.538 |
JCVI_TKOH_00056 | TkA01G000340 |
|
TkA01G000450
Chr01:101397-104219 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_036625
Chr08:45649001-45651552 (+)
CM104806.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
99.600 查询 95.573 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00056 | TkA01G000450 |
|
TkA01G000460
Chr01:104883-106798 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_036626
Chr08:45652763-45654359 (-)
CM104806.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00056 | TkA01G000460 |
|
TkA01G000480
Chr01:107079-109356 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_036627
Chr08:45654381-45657025 (-)
CM104806.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.800 查询 100.000 / 对象 99.735 |
JCVI_TKOH_00056 | TkA01G000480 |
|
TkA01G000550
Chr01:127187-132790 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_036629
Chr08:45675340-45680516 (+)
CM104806.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
97.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00056 | TkA01G000550 |
|
TkA01G000700
Chr01:160848-162131 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_036634
Chr08:45693769-45695052 (-)
CM104806.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
96.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00056 | TkA01G000700 |
|
TkA01G002840
Chr01:753419-754100 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005987
Chr01:176688265-176688947 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G002840 |
|
TkA01G003160
Chr01:834953-846136 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005981
Chr01:176611655-176618510 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G003160 |
|
TkA01G005670
Chr01:1420375-1421810 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005773
Chr01:173205155-173206264 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.800 查询 86.567 / 对象 91.710 |
TkA01G005670 | |
|
TkA01G007120
Chr01:1845456-1848109 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005921
Chr01:175755197-175757499 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.700 查询 99.219 / 对象 70.637 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G007120 |
|
TkA01G009800
Chr01:2670989-2675134 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005882
Chr01:175031855-175035193 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G009800 |
|
TkA01G010060
Chr01:2734997-2740188 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005879
Chr01:174978161-174982752 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G010060 |
|
TkA01G013660
Chr01:3546218-3548331 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005838
Chr01:174302481-174304193 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G013660 |
|
TkA01G014030
Chr01:3639155-3641553 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005826
Chr01:174208104-174210106 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.900 查询 93.719 / 对象 70.644 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G014030 |
|
TkA01G015560
Chr01:3976355-3982958 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005784
Chr01:173386471-173391250 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G015560 |
|
TkA01G017550
Chr01:4489324-4490685 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005768
Chr01:173127923-173129156 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.300 查询 81.308 / 对象 72.803 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G017550 |
|
TkA01G018380
Chr01:4679247-4683979 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005759
Chr01:172902578-172907475 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.800 查询 100.000 / 对象 96.970 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G018380 |
|
TkA01G019350
Chr01:4959485-4962371 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005741
Chr01:172570320-172573082 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
93.500 查询 100.000 / 对象 99.441 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G019350 |
|
TkA01G022060
Chr01:5660355-5661014 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005715
Chr01:171884477-171885394 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 71.803 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G022060 |
|
TkA01G023590
Chr01:6065861-6069671 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005690
Chr01:170939034-170942849 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G023590 |
|
TkA01G023850
Chr01:6128861-6149682 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005683
Chr01:170827481-170835520 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.900 查询 100.000 / 对象 97.143 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G023850 |
|
TkA01G028930
Chr01:7417690-7420120 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005619
Chr01:169409854-169411989 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.700 查询 93.371 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00003 | TkA01G028930 |
|
TkA01G029140
Chr01:7482909-7483619 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005626
Chr01:169497445-169498440 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.000 查询 98.661 / 对象 70.393 |
JCVI_TKOH_00003 | TkA01G029140 |
|
TkA01G031320
Chr01:8079659-8081247 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_004181
Chr01:127812738-127814345 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.900 查询 96.356 / 对象 86.232 |
TkA01G031320 | |
|
TkA01G031420
Chr01:8106299-8107180 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005597
Chr01:169050651-169051625 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.400 查询 100.000 / 对象 90.432 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G031420 |
|
TkA01G032380
Chr01:8383666-8387009 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005581
Chr01:168777681-168780929 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G032380 |
|
TkA01G034420
Chr01:8965245-8968588 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005555
Chr01:168365537-168365908 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
91.500 查询 82.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G034420 |
|
TkA01G041420
Chr01:10651263-10651763 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005500
Chr01:165652314-165652820 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.800 查询 100.000 / 对象 98.810 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G041420 |
|
TkA01G045650
Chr01:11805422-11810812 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_015941
Chr03:99444372-99450128 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00043 | TkA01G045650 |
|
TkA01G045850
Chr01:11865075-11865821 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_015942
Chr03:99458780-99459319 (+)
CM104801.1
|
较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00043 | TkA01G045850 |
|
TkA01G050130
Chr01:12988622-12989278 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005441
Chr01:163950318-163952567 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.500 查询 100.000 / 对象 76.224 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G050130 |
|
TkA01G050460
Chr01:13053380-13056563 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005439
Chr01:163888717-163891279 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G050460 |
|
TkA01G056540
Chr01:14627404-14628843 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005387
Chr01:162508645-162512354 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.800 查询 100.000 / 对象 73.551 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G056540 |
|
TkA01G070560
Chr01:18043840-18045993 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_038389
Chr09:39551392-39554212 (-)
CM104807.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.200 查询 94.135 / 对象 91.573 |
TkA01G070560 | |
|
TkA01G072670
Chr01:18676492-18678241 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005244
Chr01:158779213-158781954 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 77.358 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G072670 |
|
TkA01G075440
Chr01:19294574-19296154 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005215
Chr01:157881079-157883813 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
92.200 查询 84.507 / 对象 85.906 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G075440 |
|
TkA01G077320
Chr01:19729155-19730734 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005191
Chr01:157469885-157472983 (+)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 97.368 / 对象 77.487 |
JCVI_TKOH_00004 | TkA01G077320 |
|
TkA01G084280
Chr01:21539854-21540216 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_018978
Chr04:20882274-20883215 (+)
CM104802.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.800 查询 100.000 / 对象 99.174 |
TkA01G084280 | |
|
TkA01G085470
Chr01:21800040-21802337 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005011
Chr01:152947671-152954930 (-)
CM104799.1
|
较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
90.900 查询 90.980 / 对象 77.679 |
JCVI_TKOH_00007 | TkA01G085470 |
|
TkA01G088420
Chr01:22520459-22521625 (+)
GWHBCHF00000002
|
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.500 查询 92.766 / 对象 94.956 |
TkA01G241330 | |
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CM104799.1
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
95.600 查询 100.000 / 对象 71.165 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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CM104805.1
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较可信 1:1 | 双向最佳命中 + 高覆盖 + 局部共线性支持;非主染色体对应 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
99.700 查询 94.712 / 对象 96.361 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
98.700 查询 100.000 / 对象 92.262 |
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99.300 查询 100.000 / 对象 80.637 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
94.000 查询 93.396 / 对象 78.175 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
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LXL04_003364
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较可信 1:1 | 序列相似性支持;共线性或覆盖度证据不足 较可信 |
100.000 查询 100.000 / 对象 73.404 |
JCVI_TKOH_00022 | TkA01G368630 |
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