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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G323230
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 80444290-80446819 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2215 bp · TkA01G323230|TK1151|cDNA

AACCAAGAAAAGTTGGGTTGTGGGAAAGAGTTAAATGACGTGCTTCCTTCTAAACCAGAAAAAAGCCGTTGTTTGGCACCCGGTCATCGTCGTTATCGAGGAACCAAAAAGAGGACTCACAGACACGATTTTCTTGTTTCCCTCTTCACTGAAACCCTCACCAACAACTTCAATGGAGGTTCATATGCATACTCGATCGCCTTACCATCTTACTCTTATATTCCCCAAAAGCAGTATTAAGATCTCCACGAAGTTCCCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1932 bp · TkA01G323230|TK1151|CDS

ATGACGTGCTTCCTTCTAAACCAGAAAAAAGCCGTTGTTTGGCACCCGGTCATCGTCGTTATCGAGGAACCAAAAAGAGGACTCACAGACACGATTTTCTTGTTTCCCTCTTCACTGAAACCCTCACCAACAACTTCAATGGAGGTTCATATGCATACTCGATCGCCTTACCATCTTACTCTTATATTCCCCAAAAGCAGTATTAAGATCTCCACGAAGTTCCCTTTTCTTCTTCAAACCTCAACCACCTCCCGTCGACT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

643 aa · TkA01G323230|TK1151|PROTEIN

MTCFLLNQKKAVVWHPVIVVIEEPKRGLTDTIFLFPSSLKPSPTTSMEVHMHTRSPYHLTLIFPKSSIKISTKFPFLLQTSTTSRRLHYTSLFVAATRAPLPLPLPLPPTSVVPLEQPGGKMVVELVGTFNELTERMKNNNNQLLSTSSSRLLFKTLKLCLPILQTLPLAPDGRSPLSRALSAAILLADLQMDAEVISVGILREALEANAISMYQVKDRIGISTAHLLHETLRVKNMSSKVDIYDEETTSALRKFCLTYY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G323230
TK1151 IDTkA01G323230
OH-1004 IDLXL04_003672
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 94.712 / OH-1004 96.361
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G323230
位置Chr01:80444290-80446819 (-)
描述Similar to CRSH: Probable GTP diphosphokinase CRSH, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g17470 在体外具有钙依赖的鸟苷3′-二磷酸5′-二磷酸（ppGpp）合酶活性，并能在功能上互补大肠杆菌relA突变体。
The bacterial stringent response, conserved in chloroplasts, controls plant fertilization.2008 · DOI: 10.1093/pcp/pcm177
Expression profiling of four RelA/SpoT-like proteins, homologues of bacterial stringent factors, in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1007/s00425-008-0758-5

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0161200 在体外具有钙依赖的鸟苷3′-二磷酸5′-二磷酸（ppGpp）合酶活性，并能在功能上互补大肠杆菌relA突变体。
Calcium-activated (p)ppGpp synthetase in chloroplasts of land plants.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m703820200
Os05g0161800 在体外具有钙依赖的鸟苷3′-二磷酸5′-二磷酸（ppGpp）合酶活性，并能在功能上互补大肠杆菌relA突变体。
Calcium-activated (p)ppGpp synthetase in chloroplasts of land plants.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m703820200
Os05g0161500 在体外具有钙依赖的鸟苷3′-二磷酸5′-二磷酸（ppGpp）合酶活性，并能在功能上互补大肠杆菌relA突变体。
Calcium-activated (p)ppGpp synthetase in chloroplasts of land plants.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m703820200
Os09g0442600 可能的ppGpp（鸟苷酸3'-二磷酸5'-二磷酸）合成酶，可能参与植物对病原体和其他胁迫的快速ppGpp介导反应。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003672 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0015969 guanosine tetraphosphate metabolic process 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0005525 GTP binding 分子功能
GO:0008728 GTP diphosphokinase activity 分子功能
GO:0016301 kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G17470
dosa:Os05g0161200
dosa:Os05g0161500
dosa:Os05g0161800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.952
排名 1 · TkA01G323230 · TK1151
线粒体0.056
排名 2 · TkA01G323230 · TK1151
细胞核0.029
排名 3 · TkA01G323230 · TK1151
细胞质0.027
排名 4 · TkA01G323230 · TK1151
过氧化物酶体0.017
排名 5 · TkA01G323230 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13328HD_4117-139 aa
PF29176Allatotropin-like_C130-140 aa
PF13328HD_4170-307 aa
PF17959EF-hand_14243-280 aa
PF22560GMT-wHTH341-386 aa
PF04607RelA_SpoT373-498 aa
PF04607RelA_SpoT506-535 aa
PF23564EF-hand_FSTL1532-563 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G323230PF13328HD_41171395.8e-2175.6
TkA01G323230PF29176Allatotropin-like_C1301400.01515.5
TkA01G323230PF13328HD_41703075.8e-2175.6
TkA01G323230PF17959EF-hand_142432800.1213.4
TkA01G323230PF22560GMT-wHTH3413860.05714.5
TkA01G323230PF04607RelA_SpoT3734981.6e-28100.0
TkA01G323230PF04607RelA_SpoT5065351.6e-28100.0
TkA01G323230PF23564EF-hand_FSTL15325630.06414.4
TkA01G323230PF17959EF-hand_145385800.1213.4
TkA01G323230PF13202EF-hand_55395625.8e-1038.9
TkA01G323230PF00036EF-hand_15415648.7e-1244.4
TkA01G323230PF13499EF-hand_75415925.8e-1143.3
TkA01G323230PF13405EF-hand_65415661.2e-0834.7
TkA01G323230PF13833EF-hand_85415620.000122.7
TkA01G323230PF29176Allatotropin-like_C5415580.01515.5
TkA01G323230PF24548EF_EFCAB10_C5415720.03814.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84R11拟南芥sp|Q84R11|CRSH_ARATH Probable GTP diphosphokinase CRSH, chloroplastic64.700%Swiss-Prot高置信
Q6ATB4水稻sp|Q6ATB4|CRSH1_ORYSJ GTP diphosphokinase CRSH1, chloroplastic59.200%Swiss-Prot高置信
Q75IS2水稻sp|Q75IS2|CRSH3_ORYSJ GTP diphosphokinase CRSH3, chloroplastic53.000%Swiss-Prot高置信
Q6ATB2水稻sp|Q6ATB2|CRSH2_ORYSJ GTP diphosphokinase CRSH2, chloroplastic52.200%Swiss-Prot高置信
Q67UU0水稻sp|Q67UU0|RSH3_ORYSJ Probable GTP diphosphokinase RSH3, chloroplastic33.600%Swiss-Prot中等置信

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