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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G323240
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 80448786-80453171 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1774 bp · TkA01G323240|TK1151|cDNA

CTTCGCACCACCCACCTGGCGGCCAAAATTCAGAAAATGCCAAGTCCAAACAATTTCTCACGCGACTATGTTCCTCCCACGCAGTCACCCATGTGGCCTGAAAACCTCTGCGTTTTGGCTAATCGAGTACACCTCTTTGCTTTCTCCACCTTCACCAAACTCTATGTTTTAAGCAACAAAATTCGAGAGATTTCGTAACAAATCTACAGATGGTGGAGTTGGTTTTAGAGGATAAAGATGCCGCCGATTGGGTTTACAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1386 bp · TkA01G323240|TK1151|CDS

ATGGTGGAGTTGGTTTTAGAGGATAAAGATGCCGCCGATTGGGTTTACAGAGGAGAAGGAGGCCTCAATATTGTTCTTGCATACAACGGATCCTCTTCCAACTTCATTGGCAAAGTGTTACGGGTACGAAAGGTAAAGAGGAATGGAACGGAATGTGAGAAAGCTCCCTCAGCTTTATCTGTGCATGAGTGTCTTGTATGGGAAGGCGTAGGAGATCTTTTATCTGCTTCAACAAAAGATATTGTAAATCATATGTATGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

461 aa · TkA01G323240|TK1151|PROTEIN

MVELVLEDKDAADWVYRGEGGLNIVLAYNGSSSNFIGKVLRVRKVKRNGTECEKAPSALSVHECLVWEGVGDLLSASTKDIVNHMYAKHVMSPLLGPQHVDAGVRVQVTKEFLELVHNRVLFQRPSWRVDNARVNTLHDSALLMSDHSIFPHAVDGEECCISVEIKPKCGFLPVSKFIREKNSAKKRISRFKLHQILKFHQGKISQISEYDPLDLFSGSKPRVLKSIKDLFLTPQNNFRVLINGSLVFGSSGGEAEDTDS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G323240
TK1151 IDTkA01G323240
OH-1004 IDLXL04_003673
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)98.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 92.262
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G323240
位置Chr01:80448786-80453171 (-)
描述Similar to IPK1: Inositol-pentakisphosphate 2-kinase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g42810 可能将 Ins(1,3,4,5,6)P₅ 的第 2 位磷酸化，生成植酸 Ins(1,2,3,4,5,6)P₆。
Generation of phytate-free seeds in Arabidopsis through disruption of inositol polyphosphate kinases.2005 · DOI: 10.1073/pnas.0504172102
Characterization of an Arabidopsis inositol 1,3,4,5,6-pentakisphosphate 2-kinase (AtIPK1).2006 · DOI: 10.1042/bj20051331

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8AVX5 在位置 2 磷酸化 Ins(1,3,4,5,6)P5 形成 Ins(1,2,3,4,5,6)P6（InsP6 或植酸盐）。 暂无已核实直接文献
Os04g0661200 在位置 2 磷酸化 Ins(1,3,4,5,6)P5 形成 Ins(1,2,3,4,5,6)P6（InsP6 或植酸盐）。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003673 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007368 determination of left/right symmetry 生物过程
GO:0010264 myo-inositol hexakisphosphate biosynthetic process 生物过程
GO:0030643 intracellular phosphate ion homeostasis 生物过程
GO:0032402 melanosome transport 生物过程
GO:0032958 inositol phosphate biosynthetic process 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0048527 lateral root development 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0051607 defense response to virus 生物过程
GO:0055062 phosphate ion homeostasis 生物过程
GO:0060287 epithelial cilium movement involved in determination of left/right asymmetry 生物过程
GO:1901838 positive regulation of transcription of nucleolar large rRNA by RNA polymerase I 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G42810
dosa:Os04g0661200
dre:541511
rno:306808
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.571
排名 1 · TkA01G323240 · TK1151
细胞核0.366
排名 2 · TkA01G323240 · TK1151
细胞膜0.102
排名 3 · TkA01G323240 · TK1151
线粒体0.077
排名 4 · TkA01G323240 · TK1151
内质网0.075
排名 5 · TkA01G323240 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF18358Tudor_42-19 aa
PF06090Ins_P5_2-kin16-424 aa
PF18358Tudor_4435-451 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G323240PF18358Tudor_42190.2911.5
TkA01G323240PF06090Ins_P5_2-kin164243.8e-109366.2
TkA01G323240PF18358Tudor_44354510.2911.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93YN9拟南芥sp|Q93YN9|IPPK_ARATH Inositol-pentakisphosphate 2-kinase52.400%Swiss-Prot高置信
B8AVX5水稻sp|B8AVX5|IPK1_ORYSI Inositol-pentakisphosphate 2-kinase IPK150.900%Swiss-Prot高置信
Q7XQZ6水稻sp|Q7XQZ6|IPK1_ORYSJ Inositol-pentakisphosphate 2-kinase IPK150.900%Swiss-Prot高置信

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