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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_004857
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 148862752-148869370 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2393 bp · LXL04_004857|LXL04_004857|OH1004|cDNA

TACATGTAGAAAACAATATGGAGAAACCGGCTTCAAGTACAGGGTTATGGAGAACGAAGTCGGATCAATTACCCAAGATATTGGGAGATGCAATGAAATCGCCAGTGTCAAacgaagaaacaaaagaagttgACAGTTATACGCTTTCAAGAAAATCTAGCAAGAATCAAGTGCTTGCATCACCGGGCCGAACTGGCACTAGTGGAAGAAACACGCACATCAAAAGAGGAAAGAGTGGTCAAATAAAATTTGATTATGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

2376 bp · LXL04_004857|LXL04_004857|OH1004|CDS

ATGGAGAAACCGGCTTCAAGTACAGGGTTATGGAGAACGAAGTCGGATCAATTACCCAAGATATTGGGAGATGCAATGAAATCGCCAGTGTCAAACGAAGAAACAAAAGAAGTTGACAGTTATACGCTTTCAAGAAAATCTAGCAAGAATCAAGTGCTTGCATCACCGGGCCGAACTGGCACTAGTGGAAGAAACACGCACATCAAAAGAGGAAAGAGTGGTCAAATAAAATTTGATTATGATGATGTTGGGAGTGGGGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

791 aa · LXL04_004857|LXL04_004857|OH1004|PROTEIN

MEKPASSTGLWRTKSDQLPKILGDAMKSPVSNEETKEVDSYTLSRKSSKNQVLASPGRTGTSGRNTHIKRGKSGQIKFDYDDVGSGAALSRASSASLGFSFSLAAFTMPPDEIVDSRPFSDDDIPEDIEAGTRKKFQTEPTLQIYLKFTDVTYKIITKGVTSTEEKYILNGINGFVNPGEVLALMGPSGSGKTTLLSLLGGRLRDHTSGGSITYNDQPYSKFLKSRIGFVTQDDVLFPHLTVKETITYAALLRLSKTLTK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_004857
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_004857
位置Chr01:148862752-148869370 (+)
描述Similar to ABCG22: ABC transporter G family member 22
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g06530 ABC 转运蛋白 G 家族成员 22。 暂无已核实直接文献
At3g52310 ABC转运蛋白G家族成员27。 暂无已核实直接文献
At1g31770 植物生长的正调节剂，充当外排泵，参与主要的根到芽长距离细胞分裂素通过木质部汁液的运输。
ABCG9, ABCG11 and ABCG14 ABC transporters are required for vascular development in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12334
Arabidopsis ABCG14 protein controls the acropetal translocation of root-synthesized cytokinins.2014 · DOI: 10.1038/ncomms4274
Arabidopsis ABCG14 is essential for the root-to-shoot translocation of cytokinin.2014 · DOI: 10.1073/pnas.1321519111
Cytokinin Response Factor 6 Represses Cytokinin-Associated Genes during Oxidative Stress.2016 · DOI: 10.1104/pp.16.00415
A Role of Cytokinin Transporter in Arabidopsis Immunity.2017 · DOI: 10.1094/mpmi-01-17-0011-r
At4g27420 与 ABCG31 一起参与花粉适应性所需的甾醇糖苷的花粉外衣沉积。
ABCG9, ABCG11 and ABCG14 ABC transporters are required for vascular development in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12334
The role of Arabidopsis ABCG9 and ABCG31 ATP binding cassette transporters in pollen fitness and the deposition of steryl glycosides on the pollen coat.2014 · DOI: 10.1105/tpc.113.118935
At3g13220 介导孢子花粉素前体穿过绒毡层质膜进入花药室，在发育中的小孢子壁上聚合，因此是雄性生育能力和花粉外壁形成以及绒毡层程序性细胞死亡之前的图案化所必需的。
ATP-binding cassette transporter G26 is required for male fertility and pollen exine formation in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.161968
WBC27, an adenosine tri-phosphate-binding cassette protein, controls pollen wall formation and patterning in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1111/j.1744-7909.2010.01010.x
An ABCG/WBC-type ABC transporter is essential for transport of sporopollenin precursors for exine formation in developing pollen.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04412.x
Arabidopsis mutant of AtABCG26, an ABC transporter gene, is defective in pollen maturation.2011 · DOI: 10.1016/j.jplph.2011.05.014
ABCG26-mediated polyketide trafficking and hydroxycinnamoyl spermidines contribute to pollen wall exine formation in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.130484

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004857 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009736 cytokinin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010115 regulation of abscisic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0010148 transpiration 生物过程
GO:0010152 pollen maturation 生物过程
GO:0010184 cytokinin transport 生物过程
GO:0010208 pollen wall assembly 生物过程
GO:0010222 stem vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0010584 pollen exine formation 生物过程
GO:0010588 cotyledon vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0030638 polyketide metabolic process 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G31770
ath:AT3G13220
ath:AT4G27420
ath:AT5G06530
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.749
排名 1 · LXL04_004857 · OH-1004
细胞质0.118
排名 2 · LXL04_004857 · OH-1004
内质网0.104
排名 3 · LXL04_004857 · OH-1004
溶酶体／液泡0.071
排名 4 · LXL04_004857 · OH-1004
高尔基体0.057
排名 5 · LXL04_004857 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00005.34ABC_tran169-320 aa
PF19055.7ABC2_membrane_7349-415 aa
PF01061.30ABC2_membrane483-700 aa
PF12698.14ABC2_membrane_3535-735 aa
PF19055.7ABC2_membrane_7557-660 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_004857PF00005.34ABC_tran1693204.6e-31109.0
LXL04_004857PF19055.7ABC2_membrane_73494152e-1557.3
LXL04_004857PF01061.30ABC2_membrane4837003e-45155.1
LXL04_004857PF12698.14ABC2_membrane_35357351.2e-0835.2
LXL04_004857PF19055.7ABC2_membrane_75576602e-1557.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93YS4拟南芥ABC transporter G family member 2268.742%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9FT51拟南芥ABC transporter G family member 2762.517%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9C6W5拟南芥ABC transporter G family member 1445.790%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9SZR9拟南芥ABC transporter G family member 947.293%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LK50拟南芥ABC transporter G family member 2643.628%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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