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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_005882
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 175031855-175035193 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1998 bp · LXL04_005882|LXL04_005882|OH1004|cDNA

ATGAAACAATTGTTTCAATTTCAACTCCTGTGTGTTACTTTAGGGTTCCTTCTACCGTCTTACGACGCCGTTCAACCGCTTGAAGTTCATGCGTTAAATTCGTTCAAAGAAGCTATTTTTGAAGACCCGTTGTTGGTTTTATCAAGCTGGAATAGCCTTGATTCTGATCCCTGTAACTGGTTCGGTGTTACATGTTCTGGAAATCAAGTTTTAAAACTTAACATTTCTAGTTCTTCGATAAAGGGATTCATCGCTGAAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1998 bp · LXL04_005882|LXL04_005882|OH1004|CDS

ATGAAACAATTGTTTCAATTTCAACTCCTGTGTGTTACTTTAGGGTTCCTTCTACCGTCTTACGACGCCGTTCAACCGCTTGAAGTTCATGCGTTAAATTCGTTCAAAGAAGCTATTTTTGAAGACCCGTTGTTGGTTTTATCAAGCTGGAATAGCCTTGATTCTGATCCCTGTAACTGGTTCGGTGTTACATGTTCTGGAAATCAAGTTTTAAAACTTAACATTTCTAGTTCTTCGATAAAGGGATTCATCGCTGAAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

665 aa · LXL04_005882|LXL04_005882|OH1004|PROTEIN

MKQLFQFQLLCVTLGFLLPSYDAVQPLEVHALNSFKEAIFEDPLLVLSSWNSLDSDPCNWFGVTCSGNQVLKLNISSSSIKGFIAEELFQLSALQELYAFFSLRILFHLRITQDSSRNCNSFRILHENKLIGSIPMSIGSLKSLKVLDLGKNQLSGPIPSEIGNLLSIAQINLQSNGLTGKLPSEVFHLQNLQELRLDRNKLQGTIECGSSSLRVADFSYNFLTGTIPKCLEQLPRINFRGNCMNITDTKQRTPKKCGGI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_005882
TK1151 IDTkA01G009800
OH-1004 IDLXL04_005882
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)93.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_005882
位置Chr01:175031855-175035193 (-)
描述Similar to At1g63430: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g63430
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g63430 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g63430。 暂无已核实直接文献
At4g18640 通过结合不明的雌性引诱剂参与花粉管对雌性信号的感知。
Analysis of the root-hair morphogenesis transcriptome reveals the molecular identity of six genes with roles in root-hair development in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02609.x
At5g45840 参与花粉管对雌性信号的感知。
A receptor heteromer mediates the male perception of female attractants in plants.2016 · DOI: 10.1038/nature16975
At2g40270 非活性受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g40270。 暂无已核实直接文献
At3g56050 可能的非活性受体样蛋白激酶 At3g56050。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005882 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007166 cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0048765 root hair cell differentiation 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0012505 endomembrane system 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G63430
ath:AT2G40270
ath:AT3G56050
ath:AT4G18640
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.818
排名 1 · LXL04_005882 · OH-1004
内质网0.091
排名 2 · LXL04_005882 · OH-1004
细胞质0.077
排名 3 · LXL04_005882 · OH-1004
细胞核0.060
排名 4 · LXL04_005882 · OH-1004
溶酶体／液泡0.033
排名 5 · LXL04_005882 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_228-66 aa
PF13855.13LRR_8125-178 aa
PF23598.2LRR_14131-198 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr366-577 aa
PF00069.32Pkinase367-632 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_005882PF08263.18LRRNT_228661.1e-1248.8
LXL04_005882PF13855.13LRR_81251781e-0938.7
LXL04_005882PF23598.2LRR_141311982.5e-0627.2
LXL04_005882PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr3665772.6e-1660.4
LXL04_005882PF00069.32Pkinase3676328.8e-1245.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGH8拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6343054.026%Swiss-Prot强数据库同源证据
C0LGQ4拟南芥Protein MALE DISCOVERER 231.936%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C0LGU7拟南芥Protein MALE DISCOVERER 131.167%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9SIZ4拟南芥Inactive receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g4027033.424%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LYN6拟南芥Probable inactive receptor-like protein kinase At3g5605034.521%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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