ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 83 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA08G144880
Chr08:37795722-37798288 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032048
Chr07:15513805-15521752 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.200 查询 100.000 / 对象 52.456 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G144880 |
|
TkA08G145190
Chr08:37883556-37884847 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_003474
Chr01:80571264-80573671 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.500 查询 98.895 / 对象 46.134 |
TkA08G145190 | |
|
TkA08G145860
Chr08:38021531-38024630 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032052
Chr07:15710858-15721505 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
70.000 查询 99.754 / 对象 72.827 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G145860 |
|
TkA08G145990
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GWHBCHF00000009
|
LXL04_032055
Chr07:15742068-15742550 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.800 查询 100.000 / 对象 89.375 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G145990 |
|
TkA08G146140
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GWHBCHF00000009
|
LXL04_032058
Chr07:15780742-15783165 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 97.358 / 对象 58.636 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G146140 |
|
TkA08G146180
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GWHBCHF00000009
|
LXL04_032059
Chr07:15788708-15790326 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
95.000 查询 86.785 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G146180 |
|
TkA08G146330
Chr08:38169996-38173511 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032062
Chr07:15838616-15841350 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G146330 |
|
TkA08G148630
Chr08:38701780-38702198 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032079
Chr07:16461410-16462263 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.800 查询 76.415 / 对象 50.311 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G148630 |
|
TkA08G149460
Chr08:38899580-38901556 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032087
Chr07:16614463-16617425 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 36.789 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G149460 |
|
TkA08G149470
Chr08:38901684-38903261 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032087
Chr07:16614463-16617425 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 98.246 / 对象 18.729 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G149470 |
|
TkA08G150290
Chr08:39119445-39126275 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032097
Chr07:16761005-16766962 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.800 查询 97.886 / 对象 51.710 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G150290 |
|
TkA08G150460
Chr08:39155709-39156317 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_025772
Chr05:116792115-116792698 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.500 查询 100.000 / 对象 84.615 |
TkA08G150460 | |
|
TkA08G150520
Chr08:39183853-39190929 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032101
Chr07:16801766-16807719 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G150520 |
|
TkA08G150580
Chr08:39202390-39212236 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032104
Chr07:16818659-16844872 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 93.142 / 对象 48.242 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G150580 |
|
TkA08G150720
Chr08:39240077-39250984 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032104
Chr07:16818659-16844872 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.800 查询 96.641 / 对象 49.148 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G150720 |
|
TkA08G150930
Chr08:39299621-39307963 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032106
Chr07:16907033-16915777 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G150930 |
|
TkA08G151030
Chr08:39324646-39325098 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_027461
Chr06:16581806-16585145 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.900 查询 98.020 / 对象 14.865 |
TkA08G151030 | |
|
TkA08G151090
Chr08:39349707-39353620 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032114
Chr07:16989833-16993825 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.600 查询 98.537 / 对象 63.365 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G151090 |
|
TkA08G151460
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GWHBCHF00000009
|
LXL04_032121
Chr07:17085306-17086256 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.900 查询 97.714 / 对象 54.114 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G151460 |
|
TkA08G151860
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GWHBCHF00000009
|
LXL04_032132
Chr07:17252209-17255101 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.200 查询 98.225 / 对象 54.485 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G151860 |
|
TkA08G152050
Chr08:39672590-39674895 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032136
Chr07:17296615-17298758 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.000 查询 100.000 / 对象 65.471 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G152050 |
|
TkA08G152120
Chr08:39689609-39693590 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032137
Chr07:17336160-17338835 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
53.000 查询 89.189 / 对象 98.630 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G152120 |
|
TkA08G152740
Chr08:39841692-39842233 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_019417
Chr04:30836249-30836790 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA08G152740 | |
|
TkA08G153140
Chr08:39955963-39958276 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_008461
Chr02:100152417-100153785 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.900 查询 50.000 / 对象 93.846 |
TkA08G153140 | |
|
TkA08G153340
Chr08:40035363-40036948 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032159
Chr07:17665995-17669439 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.800 查询 88.889 / 对象 37.801 |
JCVI_TKOH_00346 | TkA08G153340 |
|
TkA08G153600
Chr08:40104070-40104420 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031611
Chr07:8465605-8471749 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 97.414 / 对象 29.815 |
JCVI_TKOH_00347 | TkA08G153600 |
|
TkA08G153770
Chr08:40142685-40144641 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031614
Chr07:8497696-8498544 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.400 查询 100.000 / 对象 82.075 |
JCVI_TKOH_00347 | TkA08G153770 |
|
TkA08G153970
Chr08:40185226-40186805 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031618
Chr07:8519189-8520365 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00347 | TkA08G153970 |
|
TkA08G154100
Chr08:40232591-40234763 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_031620
Chr07:8564135-8566308 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
53.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00347 | TkA08G154100 |
|
TkA08G154450
Chr08:40340052-40340885 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_011877
Chr03:2105165-2105998 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA08G154450 | |
|
TkA08G154460
Chr08:40341765-40344920 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_002518
Chr01:50694866-50700064 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
75.800 查询 37.654 / 对象 41.147 |
TkA08G154460 | |
|
TkA08G154500
Chr08:40356707-40359517 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_005957
Chr01:176362421-176362947 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA08G154500 | |
|
TkA08G154840
Chr08:40421277-40421741 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_013304
Chr03:27364377-27364841 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA08G154840 | |
|
TkA08G155180
Chr08:40529235-40529604 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_026038
Chr05:120046818-120047193 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
82.000 查询 99.000 / 对象 96.078 |
TkA08G155180 | |
|
TkA08G155470
Chr08:40607308-40610936 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032191
Chr07:18479741-18493672 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.700 查询 99.577 / 对象 42.921 |
JCVI_TKOH_00348 | TkA08G155470 |
|
TkA08G156170
Chr08:40733828-40734216 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032186
Chr07:18281195-18281583 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00348 | TkA08G156170 |
|
TkA08G156190
Chr08:40741711-40742872 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_034672
Chr07:113169133-113172962 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.100 查询 91.071 / 对象 14.448 |
TkA08G156190 | |
|
TkA08G158150
Chr08:41154136-41169283 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032180
Chr07:17925891-17931924 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.800 查询 98.358 / 对象 94.052 |
JCVI_TKOH_00348 | TkA08G158150 |
|
TkA08G158160
Chr08:41169008-41170059 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032175
Chr07:17827058-17832470 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.400 查询 99.412 / 对象 11.575 |
JCVI_TKOH_00348 | TkA08G158160 |
|
TkA08G158250
Chr08:41185968-41186483 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_001968
Chr01:38228207-38228722 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA08G158250 | |
|
TkA08G158480
Chr08:41265393-41265983 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_032172
Chr07:17815830-17816441 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 96.552 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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TkA08G170990 | |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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