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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G158150
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 41154136-41169283 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4203 bp · TkA08G158150|TK1151|cDNA

CCATGCACAGACGATTGACATTGACGGCTTATGAGTATTATACTTGTTCTTTTCTAAGACGACGATAGTTGAGGCGGTGTGCAGAAGAGACCTAATTGGAATTACTTGGGGAAATTTCTGAGATCTCTGATAGGGGAAGAAATATGCGGTCATTGACTCGACATTTTCCTTTTGGAATTTATCTGTAGGTGTCTTTGACCATGAATATTTGACGTATTACCTGCGTAATGCTTTTGTCTTCTTCCCCTACCCAACTTGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

4389 bp · TkA08G158150|TK1151|CDS

ATGGCCTTTACGAGGATTTTACTTGGGGGAATCACCATGGTTTATGAAGGTGATTTTGATTTGCTTTCACCAGCCACACAAATAAGTATTTCAGACATCTTCAACCTGGTTTTTGTCTTTCTCTTCTACCTGGTGCTCCTCTTAAGTTACTTTATGAAAAATAACACCAACAGATCCAGGGGAAGAAGTGATTGGATTTCTCTATCAGTTTCATTTTGTTGTTTTCTCACTTCTATTGCATATCTTATTGCTGGTTTATG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1462 aa · TkA08G158150|TK1151|PROTEIN

MAFTRILLGGITMVYEGDFDLLSPATQISISDIFNLVFVFLFYLVLLLSYFMKNNTNRSRGRSDWISLSVSFCCFLTSIAYLIAGLWDATAKTPQSSWWVLIVRSLIWASLMVSLLVEKFKSVKILASLWWVFLFGSISVINIKCLTDKQSISVLVLIEWVASFLLFFCTLRNIIHFFTQQTPSQNLSDPLLVDGTQEETHTSQLKEPTFLSKLSFSWVNPLIALGYRKPLILEDIPSLPSIDQSSTAHEKFTKAWNSLQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G158150
TK1151 IDTkA08G158150
OH-1004 IDLXL04_032180
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)97.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.358 / OH-1004 94.052
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G158150
位置Chr08:41154136-41169283 (+)
描述Similar to ABCC8: ABC transporter C family member 8
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g21250 谷胱甘肽 S-结合物泵。 暂无已核实直接文献
At3g59140 谷胱甘肽 S-结合物泵。 暂无已核实直接文献
At1g04120 谷胱甘肽 S-结合物泵。
The Arabidopsis thaliana ABC transporter AtMRP5 controls root development and stomata movement.2001 · DOI: 10.1093/emboj/20.8.1875
The plant multidrug resistance ABC transporter AtMRP5 is involved in guard cell hormonal signalling and water use.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.016012.x
Binding of sulfonylurea by AtMRP5, an Arabidopsis multidrug resistance-related protein that functions in salt tolerance.2004 · DOI: 10.1104/pp.103.027045
The Arabidopsis ATP-binding cassette protein AtMRP5/AtABCC5 is a high affinity inositol hexakisphosphate transporter involved in guard cell signaling and phytate storage.2009 · DOI: 10.1074/jbc.m109.030247
At3g13090 谷胱甘肽 S-结合物泵。 暂无已核实直接文献
At3g60160 谷胱甘肽 S-结合物泵。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XCD4 ABC 转运蛋白，可能影响植酸转运和区室化。 暂无已核实直接文献
Os03g0142800 ABC 转运蛋白，可能影响植酸转运和区室化。
Mutations of the multi-drug resistance-associated protein ABC transporter gene 5 result in reduction of phytic acid in rice seeds.2009 · DOI: 10.1007/s00122-009-1018-1
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032180 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0030007 intracellular potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0048046 apoplast 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G04120
ath:AT3G13080
ath:AT3G13090
ath:AT3G21250
ath:AT3G59140
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.453
排名 1 · TkA08G158150 · TK1151
溶酶体／液泡0.284
排名 2 · TkA08G158150 · TK1151
内质网0.133
排名 3 · TkA08G158150 · TK1151
细胞质0.122
排名 4 · TkA08G158150 · TK1151
高尔基体0.079
排名 5 · TkA08G158150 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05970PIF18-27 aa
PF00664ABC_membrane46-83 aa
PF20703nSTAND1245-268 aa
PF00664ABC_membrane283-546 aa
PF00005ABC_tran618-752 aa
PF13476AAA_23619-648 aa
PF13555AAA_29622-648 aa
PF03308MeaB622-662 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G158150PF05970PIF18270.2911.4
TkA08G158150PF00664ABC_membrane46831.4e-42147.0
TkA08G158150PF20703nSTAND12452680.02814.8
TkA08G158150PF00664ABC_membrane2835461.4e-42147.0
TkA08G158150PF00005ABC_tran6187522.5e-52177.8
TkA08G158150PF13476AAA_236196480.03115.6
TkA08G158150PF13555AAA_296226481.2e-0628.9
TkA08G158150PF03308MeaB6226620.01914.7
TkA08G158150PF12775AAA_76226560.03414.4
TkA08G158150PF02463SMC_N6236522.3e-1041.0
TkA08G158150PF01580FtsK_SpoIIIE6236490.2211.6
TkA08G158150PF20703nSTAND16246470.02814.8
TkA08G158150PF02367TsaE6246520.1812.5
TkA08G158150PF25199nSTAND_NTPase56246610.2511.9
TkA08G158150PF00006ATP-synt_ab6256650.0008219.8
TkA08G158150PF03193RsgA_GTPase6256550.01416.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LGU1拟南芥sp|Q8LGU1|AB8C_ARATH ABC transporter C family member 862.600%Swiss-Prot高置信
Q9LYS2拟南芥sp|Q9LYS2|AB10C_ARATH ABC transporter C family member 1047.200%Swiss-Prot中等置信
Q7GB25拟南芥sp|Q7GB25|AB5C_ARATH ABC transporter C family member 541.700%Swiss-Prot中等置信
Q8VZZ4拟南芥sp|Q8VZZ4|AB6C_ARATH ABC transporter C family member 637.500%Swiss-Prot中等置信
Q9M1C7拟南芥sp|Q9M1C7|AB9C_ARATH ABC transporter C family member 939.700%Swiss-Prot中等置信
A2XCD4水稻sp|A2XCD4|AB13C_ORYSI ABC transporter C family member 1342.900%Swiss-Prot中等置信
Q10RX7水稻sp|Q10RX7|AB13C_ORYSJ ABC transporter C family member 1342.900%Swiss-Prot中等置信

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