ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 49 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA04G342260
Chr04:86410971-86417547 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039568
ChrUn:1416612-1422787 (-)
JAJTUU010000013.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00220 | TkA04G342260 |
|
TkA04G342280
Chr04:86420233-86422347 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039569
ChrUn:1425395-1426673 (-)
JAJTUU010000013.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00220 | TkA04G342280 |
|
TkA04G343130
Chr04:86677498-86679807 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039713
ChrUn:11134-12806 (+)
JAJTUU010000030.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G343130 | |
|
TkA04G343840
Chr04:86900886-86901397 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_031094
Chr07:383375-383807 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
74.600 查询 96.667 / 对象 100.000 |
TkA04G343840 | |
|
TkA04G344300
Chr04:87036043-87042621 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037745
Chr09:20026222-20032114 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00199 | TkA04G344300 |
|
TkA04G345120
Chr04:87248825-87257738 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037752
Chr09:20172821-20176172 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.200 查询 99.548 / 对象 66.270 |
JCVI_TKOH_00199 | TkA04G345120 |
|
TkA04G345160
Chr04:87276945-87278255 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039762
ChrUn:252403-253713 (+)
JAJTUU010000036.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
91.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00221 | TkA04G345160 |
|
TkA04G345280
Chr04:87308901-87309474 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_012874
Chr03:20200715-20201271 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
64.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G345280 | |
|
TkA04G345580
Chr04:87366417-87367096 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_025313
Chr05:109703427-109705793 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.700 查询 97.500 / 对象 24.684 |
TkA04G345580 | |
|
TkA04G345940
Chr04:87464316-87465656 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037748
Chr09:20086385-20087725 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00199 | TkA04G345940 |
|
TkA04G346680
Chr04:87585373-87586686 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037753
Chr09:20202418-20203731 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00199 | TkA04G346680 |
|
TkA04G347940
Chr04:87902138-87903430 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039705
ChrUn:137101-137987 (-)
JAJTUU010000029.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
85.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G347940 | |
|
TkA04G348060
Chr04:87934473-87935088 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037763
Chr09:20447558-20448173 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00199 | TkA04G348060 |
|
TkA04G348290
Chr04:87995552-87996028 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037874
Chr09:23729759-23730289 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
77.600 查询 29.747 / 对象 73.134 |
TkA04G348290 | |
|
TkA04G348700
Chr04:88088621-88088965 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_001492
Chr01:27677474-27679903 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.000 查询 79.825 / 对象 59.091 |
TkA04G348700 | |
|
TkA04G349230
Chr04:88181334-88184190 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_023545
Chr05:49359184-49361081 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
69.500 查询 42.384 / 对象 67.544 |
TkA04G349230 | |
|
TkA04G349670
Chr04:88279187-88282301 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037773
Chr09:20870306-20872871 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00199 | TkA04G349670 |
|
TkA04G350070
Chr04:88358124-88359277 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_002938
Chr01:61767140-61771460 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
84.700 查询 81.188 / 对象 58.280 |
TkA04G350070 | |
|
TkA04G351470
Chr04:88719068-88721762 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037795
Chr09:21445130-21452744 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.800 查询 86.294 / 对象 18.418 |
JCVI_TKOH_00199 | TkA04G351470 |
|
TkA04G351990
Chr04:88798526-88802173 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039840
ChrUn:93700-98376 (-)
JAJTUU010000052.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 83.899 |
TkA04G351990 | |
|
TkA04G352250
Chr04:88849618-88849932 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037800
Chr09:21616405-21616719 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00199 | TkA04G352250 |
|
TkA04G352900
Chr04:89034116-89035062 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037811
Chr09:21835530-21838155 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 87.975 / 对象 48.432 |
JCVI_TKOH_00199 | TkA04G352900 |
|
TkA04G353210
Chr04:89131577-89132912 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039756
ChrUn:246208-247425 (-)
JAJTUU010000035.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.700 查询 100.000 / 对象 96.257 |
TkA04G353210 | |
|
TkA04G353220
Chr04:89133954-89136172 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037813
Chr09:21908392-21909334 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00199 | TkA04G353220 |
|
TkA04G353960
Chr04:89282869-89287475 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037820
Chr09:22040037-22043504 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 85.270 |
JCVI_TKOH_00199 | TkA04G353960 |
|
TkA04G355990
Chr04:89800644-89801582 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037834
Chr09:22372693-22375652 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.300 查询 98.462 / 对象 46.154 |
JCVI_TKOH_00199 | TkA04G355990 |
|
TkA04G356200
Chr04:89837819-89838139 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_014746
Chr03:56228838-56229158 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G356200 | |
|
TkA04G359120
Chr04:90496670-90506288 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037940
Chr09:25850503-25860857 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
91.200 查询 95.325 / 对象 39.520 |
JCVI_TKOH_00201 | TkA04G359120 |
|
TkA04G359140
Chr04:90509473-90510711 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_003600
Chr01:87425311-87427491 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.500 查询 100.000 / 对象 58.416 |
TkA04G359140 | |
|
TkA04G360930
Chr04:90877819-90878617 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037935
Chr09:25590694-25591410 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.300 查询 97.479 / 对象 69.461 |
JCVI_TKOH_00201 | TkA04G360930 |
|
TkA04G360960
Chr04:90881916-90885905 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037933
Chr09:25573569-25575406 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
54.100 查询 65.896 / 对象 90.654 |
JCVI_TKOH_00201 | TkA04G360960 |
|
TkA04G360970
Chr04:90886088-90889246 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037932
Chr09:25564469-25566315 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
64.000 查询 51.327 / 对象 71.404 |
JCVI_TKOH_00201 | TkA04G360970 |
|
TkA04G361050
Chr04:90898913-90900501 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037931
Chr09:25528728-25529523 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00201 | TkA04G361050 |
|
TkA04G361150
Chr04:90929237-90929578 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037929
Chr09:25499613-25499954 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00201 | TkA04G361150 |
|
TkA04G361520
Chr04:91009789-91010744 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037921
Chr09:25426738-25434325 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 97.321 / 对象 34.385 |
JCVI_TKOH_00201 | TkA04G361520 |
|
TkA04G365370
Chr04:91829284-91829736 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_011418
Chr02:163995105-163996816 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.000 查询 57.333 / 对象 35.685 |
TkA04G365370 | |
|
TkA04G365480
Chr04:91860807-91862553 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_002728
Chr01:56399473-56401594 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
73.500 查询 74.775 / 对象 84.694 |
JCVI_TKOH_00178 | TkA04G365480 |
|
TkA04G365810
Chr04:91959783-91960367 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_002733
Chr01:56557956-56558885 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.100 查询 81.443 / 对象 54.861 |
JCVI_TKOH_00178 | TkA04G365810 |
|
TkA04G366340
Chr04:92064632-92068571 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_002735
Chr01:56667421-56676323 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.800 查询 100.000 / 对象 56.955 |
JCVI_TKOH_00178 | TkA04G366340 |
|
TkA04G366710
Chr04:92156640-92159600 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_006793
Chr02:25249106-25251414 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.800 查询 100.000 / 对象 42.755 |
TkA04G366710 | |
|
TkA04G366880
Chr04:92209952-92216711 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_002738
Chr01:56772385-56774701 (+)
CM104799.1
|
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76.100 查询 92.222 / 对象 89.545 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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CM104807.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.500 查询 98.881 / 对象 52.165 |
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CM104807.1
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CM104807.1
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