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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_037795
当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 21445130-21452744 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2772 bp · LXL04_037795|LXL04_037795|OH1004|cDNA

ATGCCTGGGAATAACTACAATGGCAATTCATCAGTCCTCACGAGCCGAATAGAGCGGCTCTTGAGAGAACGAGAGCTACGAGAGCAACGAAAGAACAACAAATCCTCAAATTCTAGGGACGCTAATAGCAGCGAGCCTTTCGATCTCGAACCGCGATTAAGGGAAGGTGATAATAACTTCGTGGAACAGTATCTTGAAGGAGCATCCGCCGCACGTGACAAATGGGAAAAGCCAGATAGCGGACTTTTTACGCAACGACT...

CDS

下载 CDS FASTA

2772 bp · LXL04_037795|LXL04_037795|OH1004|CDS

ATGCCTGGGAATAACTACAATGGCAATTCATCAGTCCTCACGAGCCGAATAGAGCGGCTCTTGAGAGAACGAGAGCTACGAGAGCAACGAAAGAACAACAAATCCTCAAATTCTAGGGACGCTAATAGCAGCGAGCCTTTCGATCTCGAACCGCGATTAAGGGAAGGTGATAATAACTTCGTGGAACAGTATCTTGAAGGAGCATCCGCCGCACGTGACAAATGGGAAAAGCCAGATAGCGGACTTTTTACGCAACGACT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

923 aa · LXL04_037795|LXL04_037795|OH1004|PROTEIN

MPGNNYNGNSSVLTSRIERLLRERELREQRKNNKSSNSRDANSSEPFDLEPRLREGDNNFVEQYLEGASAARDKWEKPDSGLFTQRLLVVANRLPVSAVRRGEESWSLEVSGGGLVSALLGVKEVEAKWIGWAGVNVPDEPGQRALTKALAEKRCIPVFLDEEIVHQYYNGYCNNILWPLFHYLGLPQEDRLATTRSFQSQFAAYKKANQMFADVVNEHYEEGDVVWCHDYHLMFLPKCLKDHNKNMKVGWFLHTPFPSS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_037795
TK1151 IDTkA04G351470
OH-1004 IDLXL04_037795
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 86.294 / OH-1004 18.418
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_037795
位置Chr09:21445130-21452744 (+)
描述Similar to TPS1: Alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g78580 正常胚胎发育、营养生长和开花过渡所需。
Trehalose metabolism in Arabidopsis: occurrence of trehalose and molecular cloning and characterization of trehalose-6-phosphate synthase homologues.2001 · DOI: 10.1093/jexbot/52.362.1817
Trehalose-6-phosphate synthase 1, which catalyses the first step in trehalose synthesis, is essential for Arabidopsis embryo maturation.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01220.x
Truncation of Arabidopsis thaliana and Selaginella lepidophylla trehalose-6-phosphate synthase unlocks high catalytic activity and supports high trehalose levels on expression in yeast.2002 · DOI: 10.1042/bj20020517
Trehalose 6-phosphate is indispensable for carbohydrate utilization and growth in Arabidopsis thaliana.2003 · DOI: 10.1073/pnas.1132018100
Arabidopsis trehalose-6-phosphate synthase 1 is essential for normal vegetative growth and transition to flowering.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.039743
Trehalose metabolism and glucose sensing in plants.2005 · DOI: 10.1042/bst0330276
The role of trehalose-6-phosphate synthase in Arabidopsis embryo development.2005 · DOI: 10.1042/bst0330280
Delayed embryo development in the ARABIDOPSIS TREHALOSE-6-PHOSPHATE SYNTHASE 1 mutant is associated with altered cell wall structure, decreased cell division and starch accumulation.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02662.x
Isolation and molecular characterization of the Arabidopsis TPS1 gene, encoding trehalose-6-phosphate synthase.1998 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.1998.00063.x
At1g16980 可能的 α,α-海藻糖磷酸合酶 [UDP形成] 2。 暂无已核实直接文献
At4g27550 可能的 α,α-海藻糖磷酸合酶 [UDP 形成型] 4。 暂无已核实直接文献
At1g17000 可能的α,α-海藻糖-磷酸合酶 [UDP-形成] 3。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037795 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005991 trehalose metabolic process 生物过程
GO:0005992 trehalose biosynthetic process 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0009832 plant-type cell wall biogenesis 生物过程
GO:0010182 sugar mediated signaling pathway 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0048574 long-day photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0080186 developmental vegetative growth 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G16980
ath:AT1G17000
ath:AT1G78580
ath:AT4G27550
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.515
排名 1 · LXL04_037795 · OH-1004
细胞核0.261
排名 2 · LXL04_037795 · OH-1004
细胞膜0.181
排名 3 · LXL04_037795 · OH-1004
高尔基体0.089
排名 4 · LXL04_037795 · OH-1004
溶酶体／液泡0.075
排名 5 · LXL04_037795 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00982.28Glyco_transf_2086-551 aa
PF02358.23Trehalose_PPase610-823 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_037795PF00982.28Glyco_transf_20865513.2e-189630.3
LXL04_037795PF02358.23Trehalose_PPase6108231.7e-56191.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SYM4拟南芥Alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 178.108%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9FZ57拟南芥Probable alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 265.608%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9T079拟南芥Probable alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 465.937%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9SHG0拟南芥Probable alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 357.688%Swiss-Prot强数据库同源证据

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