ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 1 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA01G000070
Chr01:11903-13760 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_000004
Chr01:91872-97366 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 30.971 |
JCVI_TKOH_00001 | TkA01G000070 |
|
TkA01G000100
Chr01:25698-27524 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_036035
Chr08:34508235-34509494 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.700 查询 87.719 / 对象 66.964 |
TkA01G000100 | |
|
TkA01G000270
Chr01:67703-68362 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_000007
Chr01:135159-135818 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00001 | TkA01G000270 |
|
TkA01G000350
Chr01:85257-85973 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_019143
Chr04:24539183-24554851 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.500 查询 94.578 / 对象 9.033 |
TkA01G000350 | |
|
TkA01G000430
Chr01:98482-98919 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_019143
Chr04:24539183-24554851 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 94.483 / 对象 7.883 |
TkA01G000430 | |
|
TkA01G000650
Chr01:150874-152595 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_036631
Chr08:45683667-45686231 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
74.000 查询 100.000 / 对象 67.096 |
JCVI_TKOH_00056 | TkA01G000650 |
|
TkA01G001190
Chr01:262285-262861 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_020268
Chr04:62381600-62382114 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
67.200 查询 78.102 / 对象 94.309 |
TkA01G001190 | |
|
TkA01G001560
Chr01:412210-413047 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_006004
Chr01:176865948-176867668 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.400 查询 96.610 / 对象 49.782 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G001560 |
|
TkA01G001580
Chr01:418885-421412 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_006006
Chr01:176873201-176875272 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.800 查询 89.355 / 对象 63.765 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G001580 |
|
TkA01G001990
Chr01:536660-543826 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005992
Chr01:176707941-176709014 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G001990 |
|
TkA01G002040
Chr01:551944-559191 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005988
Chr01:176694865-176695212 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G002040 |
|
TkA01G002180
Chr01:584457-589142 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005998
Chr01:176763479-176767206 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.300 查询 88.973 / 对象 26.145 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G002180 |
|
TkA01G002710
Chr01:703419-706195 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005996
Chr01:176741820-176748945 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.500 查询 99.735 / 对象 58.089 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G002710 |
|
TkA01G002750
Chr01:714318-714656 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_035832
Chr08:30067745-30068672 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.000 查询 90.179 / 对象 84.167 |
TkA01G002750 | |
|
TkA01G002810
Chr01:739077-745875 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005992
Chr01:176707941-176709014 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G002810 |
|
TkA01G002820
Chr01:746002-747971 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005989
Chr01:176696355-176698050 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 56.017 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G002820 |
|
TkA01G004090
Chr01:1070353-1073960 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005968
Chr01:176444101-176447262 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.500 查询 94.366 / 对象 71.850 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G004090 |
|
TkA01G004100
Chr01:1074279-1077221 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005967
Chr01:176440223-176443352 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 96.296 / 对象 55.615 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G004100 |
|
TkA01G004160
Chr01:1086513-1087001 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005965
Chr01:176435213-176436035 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.600 查询 100.000 / 对象 57.711 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G004160 |
|
TkA01G004520
Chr01:1195168-1197839 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005938
Chr01:175929407-175931846 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G004520 |
|
TkA01G004740
Chr01:1240803-1241475 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_030442
Chr06:116066663-116067326 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA01G004740 | |
|
TkA01G004920
Chr01:1277505-1278682 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005946
Chr01:176085304-176085707 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 92.000 / 对象 83.636 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G004920 |
|
TkA01G005030
Chr01:1293741-1294307 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005948
Chr01:176093357-176094159 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.900 查询 92.453 / 对象 52.973 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G005030 |
|
TkA01G005220
Chr01:1331194-1333024 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_034803
Chr08:1704991-1715277 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.600 查询 77.679 / 对象 21.376 |
TkA01G005220 | |
|
TkA01G006320
Chr01:1633518-1635076 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005933
Chr01:175898061-175898816 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
73.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G006320 |
|
TkA01G006690
Chr01:1737535-1738368 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_038322
Chr09:37281123-37281527 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
84.500 查询 37.184 / 对象 76.866 |
TkA01G006690 | |
|
TkA01G006710
Chr01:1745491-1748365 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005926
Chr01:175838218-175840838 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 89.105 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G006710 |
|
TkA01G006900
Chr01:1780930-1782394 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005925
Chr01:175789955-175791442 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
81.700 查询 100.000 / 对象 98.384 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G006900 |
|
TkA01G007190
Chr01:1867365-1880441 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005920
Chr01:175722075-175735194 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
75.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G007190 |
|
TkA01G008450
Chr01:2219600-2221789 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005903
Chr01:175465007-175481995 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 99.740 / 对象 16.530 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G008450 |
|
TkA01G008470
Chr01:2226543-2232882 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005900
Chr01:175380921-175385248 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
82.700 查询 99.395 / 对象 99.698 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G008470 |
|
TkA01G008500
Chr01:2234954-2236428 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_006318
Chr02:6793665-6795235 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 85.577 / 对象 55.975 |
TkA01G008500 | |
|
TkA01G009050
Chr01:2430244-2437169 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_023182
Chr05:25935259-25937934 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
62.600 查询 44.928 / 对象 89.375 |
TkA01G009050 | |
|
TkA01G009060
Chr01:2438536-2440499 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005897
Chr01:175353169-175354888 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G009060 |
|
TkA01G009070
Chr01:2441376-2442763 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005896
Chr01:175341852-175352148 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.900 查询 95.210 / 对象 8.530 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G009070 |
|
TkA01G009090
Chr01:2445204-2450190 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005896
Chr01:175341852-175352148 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.400 查询 95.727 / 对象 49.142 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G009090 |
|
TkA01G009230
Chr01:2492189-2495000 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005893
Chr01:175276430-175279078 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.800 查询 97.991 / 对象 97.991 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G009230 |
|
TkA01G009300
Chr01:2523602-2526336 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005891
Chr01:175255810-175258288 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 63.037 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G009300 |
|
TkA01G009330
Chr01:2531467-2532928 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005889
Chr01:175249208-175250325 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G009330 |
|
TkA01G009410
Chr01:2569066-2571223 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_029312
Chr06:87123775-87128516 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.800 查询 93.023 / 对象 30.189 |
TkA01G009410 | |
|
TkA01G009860
Chr01:2689947-2696500 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005880
Chr01:174997909-174999403 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.100 查询 42.661 / 对象 93.737 |
JCVI_TKOH_00002 | TkA01G009860 |
|
TkA01G010740
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GWHBCHF00000002
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 85.246 |
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CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
68.900 查询 99.029 / 对象 100.000 |
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|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
55.600 查询 42.056 / 对象 20.833 |
TkA01G011620 | |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
84.600 查询 87.857 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
57.500 查询 23.810 / 对象 88.571 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.600 查询 94.118 / 对象 45.198 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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CM104799.1
|
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CM104799.1
|
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92.100 查询 87.449 / 对象 57.064 |
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CM104803.1
|
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CM104802.1
|
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|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.200 查询 97.352 / 对象 67.419 |
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|
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83.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
86.700 查询 100.000 / 对象 99.524 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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Chr01:172652592-172655879 (-)
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|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.900 查询 97.160 / 对象 42.844 |
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95.100 查询 93.192 / 对象 57.704 |
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66.700 查询 51.000 / 对象 25.758 |
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|
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76.900 查询 66.812 / 对象 79.716 |
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79.800 查询 100.000 / 对象 99.385 |
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100.000 查询 17.699 / 对象 27.027 |
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CM104799.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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TkA01G024500
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Chr04:104935425-104939782 (-)
CM104802.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.700 查询 80.508 / 对象 36.398 |
TkA01G024500 | |
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TkA01G026000
Chr01:6719962-6725058 (-)
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Chr03:132570432-132591888 (-)
CM104801.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
45.900 查询 93.220 / 对象 93.770 |
TkA01G026000 | |
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TkA01G026780
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Chr07:6638153-6638628 (+)
CM104805.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
78.600 查询 41.176 / 对象 53.846 |
TkA01G026780 | |
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CM104799.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
81.200 查询 100.000 / 对象 90.560 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.300 查询 90.400 / 对象 18.051 |
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CM104799.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 48.958 |
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100.000 查询 24.599 / 对象 30.263 |
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CM104799.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.000 查询 100.000 / 对象 96.403 |
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TkA01G028810
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CM104799.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.700 查询 68.750 / 对象 75.862 |
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73.200 查询 36.716 / 对象 27.746 |
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CM104799.1
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89.700 查询 99.594 / 对象 98.687 |
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CM104803.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
45.200 查询 99.504 / 对象 71.951 |
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TkA01G029430
Chr01:7548225-7548554 (+)
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ChrUn:3132531-3132866 (+)
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
95.400 查询 99.083 / 对象 97.297 |
TkA01G029430 | |
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TkA01G030110
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LXL04_011126
Chr02:158360274-158362392 (+)
CM104800.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.600 查询 37.963 / 对象 24.260 |
TkA01G030110 |
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