基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA01G019910
当前版本: TK1151
染色体: Chr01
坐标: 5101562-5108048
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3358 bp · TkA01G019910|TK1151|cDNA
CTGAAAACAAAATCAACAGAAAGTCGTAATGTTTTATATGTTTTGATCCTTTGTTAATTAAAAAAAACACATAAAATGTAATCTCTCTTATATAAATCAATACTAAGTTGTGAAAATGATGTGGACCCGACAGATGTGGAGAAGTGGATCACGGCTTACAAATTCTTTACCCATTTTTGTGTTTGTTGTGCCATAGGATTGCAAGTAGCGAAGTCCAACTATTAGATTCCACACCTCTTTGGAATCACCAACACCATAAG...
CDS
下载 CDS FASTA1533 bp · TkA01G019910|TK1151|CDS
ATGGGGCAAGTATGTATGTCGACAACCGACGTCGCGTTTTACGTCGTCGATGCTCATATGTGGGGGTTCCGCGGTGCTTGCGCCGAACATCATTTACAGAAAGGTCAAGGGGTCGCCGGAAGGGCTTTCGCGACTCGAAGTTCTTGTTTTTGTGAAAACATCACGCATTTTGGGAAAACAGAGTACCCTTTGGTTCATTATGCGCGGATGTTCGGGTTAGTTGGATCTTTCGCGATTTGTTTGAGGAGTAGTCATACCGG...
510 aa · TkA01G019910|TK1151|PROTEIN
MGQVCMSTTDVAFYVVDAHMWGFRGACAEHHLQKGQGVAGRAFATRSSCFCENITHFGKTEYPLVHYARMFGLVGSFAICLRSSHTGDDDYVLEFFLPPNVVEFEDQQRMLGSLLTSMKQHFRSLKVASGEEIGEDGRMVDIIKACADGDVIDSGIQSIRLSECVVSNGGPAVGVEPLVGPSGVNGNCGKLENVEVTKKSERKRGKAEKSISLEVLQQHFAGSLKDAAKNLGVCPTTMKRICRQHGISRWPSRKINKVNR...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA01G019910 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA01G019910 |
| OH-1004 ID | LXL04_005733 |
| 关系 / 置信度 | 序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核 |
| 蛋白一致性 (%) | 100.000 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 100.000 / OH-1004 55.435覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA01G019910 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:5101562-5108048 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to NLP7: Protein NLP7 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0009414 response to water deprivation 生物过程 GO:0010118 stomatal movement 生物过程 GO:0010167 response to nitrate 生物过程 GO:0042128 nitrate assimilation 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能 GO:0000987 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding 分子功能 GO:0001046 core promoter sequence-specific DNA binding 分子功能 GO:0001216 DNA-binding transcription activator activity 分子功能 GO:0003677 DNA binding 分子功能 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G64530 ath:AT1G76350 ath:AT2G17150 ath:AT4G24020 dosa:Os01g0236700 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.971
细胞质0.080
细胞膜0.030
内质网0.018
质体0.013
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF22922GAF_NLP3-125 aaPF02042RWP-RK203-275 aaPF12728HTH_17223-253 aaPF00564PB1347-372 aaPF05521Phage_HCP391-473 aaPF00564PB1416-497 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA01G019910 | PF22922 | GAF_NLP | 3 | 125 | 1.3e-55 | 188.3 |
| TkA01G019910 | PF02042 | RWP-RK | 203 | 275 | 6.4e-28 | 97.4 |
| TkA01G019910 | PF12728 | HTH_17 | 223 | 253 | 0.024 | 15.6 |
| TkA01G019910 | PF00564 | PB1 | 347 | 372 | 1.6e-20 | 73.5 |
| TkA01G019910 | PF05521 | Phage_HCP | 391 | 473 | 0.13 | 13.6 |
| TkA01G019910 | PF00564 | PB1 | 416 | 497 | 1.6e-20 | 73.5 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q84TH9 | 拟南芥 | sp|Q84TH9|NLP7_ARATH Protein NLP7 | 50.400% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q8RWY4 | 拟南芥 | sp|Q8RWY4|NLP6_ARATH Protein NLP6 | 48.000% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9SFW8 | 拟南芥 | sp|Q9SFW8|NLP5_ARATH Protein NLP5 | 38.100% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9LE38 | 拟南芥 | sp|Q9LE38|NLP4_ARATH Protein NLP4 | 36.200% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q5NB82 | 水稻 | sp|Q5NB82|NLP3_ORYSJ Protein NLP3 | 45.500% | Swiss-Prot | 中等置信 |