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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G019370
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 4966860-4970380 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2283 bp · TkA01G019370|TK1151|cDNA

ATGAAACCATAAGGAGCAAAGATATTATAGAGTGAGATTGTAAGGTTTTATAAATCGCGGGTACCATTTTACAATTATGTCAAAATCAATAAAGAAAGATATAGAAGAGGGAGTTTTTTTTTGTAATATTGTTCAGATCCTGTATATTACTGATAAACCTTCAAGTAGTTGTTCATGTGAAGAAGGAGCAAACGAGTGACCCAACTTGAGATCTAATGGGTAATTGTCTGCCGATGGAAGATTTAAGCAAGCTATTTCGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1962 bp · TkA01G019370|TK1151|CDS

ATGGGTAATTGTCTGCCGATGGAAGATTTAAGCAAGCTATTTCGGCCTCGCCGGGATGAGTTTCTCAAACTATCTCAAGACGACAAACTCTGCGCATTCCTTGCAACGTTTCCAACTCAACTTCAATATACGAAACCTCAGTTCTACTTCATATTATGGGTTTTTTGGAGTCAACAAGCAGTATCTCGAAATAATTCATCTTCAAGTGAGTCTCCTCTATATTCAATTTCAGGCGACACCAGCGAATTTGTAATCCACGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

653 aa · TkA01G019370|TK1151|PROTEIN

MGNCLPMEDLSKLFRPRRDEFLKLSQDDKLCAFLATFPTQLQYTKPQFYFILWVFWSQQAVSRNNSSSSESPLYSISGDTSEFVIHEKIRSSFYKFDLTLYDFDGLIQFWAPVTTGGRRLLSTSDQPFAVNYLDTGLDKFRLCSLNYRYNIDVNTLDVDKETTIISGAPASAFLNHLPEVVLDLKAHDNGCPLVRSALECDLMAYIVLPVRDPSQRCCVGVVECFMKRSDCSLVIFNKLNESLEGVGLSTFDVRECLPYK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G019370
TK1151 IDTkA01G019370
OH-1004 IDLXL04_005739
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)88.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G019370
位置Chr01:4966860-4970380 (+)
描述Similar to NLP6: Protein NLP6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g24020 参与硝酸盐同化调节和硝酸盐信号转导的转录因子。
The nodule inception-like protein 7 modulates nitrate sensing and metabolism in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03695.x
At1g64530 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
At3g59580 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
At1g76350 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0131100 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005739 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0010167 response to nitrate 生物过程
GO:0042128 nitrate assimilation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0000987 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding 分子功能
GO:0001046 core promoter sequence-specific DNA binding 分子功能
GO:0001216 DNA-binding transcription activator activity 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G64530
ath:AT4G24020
dosa:Os01g0236700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.697
排名 1 · TkA01G019370 · TK1151
细胞质0.305
排名 2 · TkA01G019370 · TK1151
细胞膜0.102
排名 3 · TkA01G019370 · TK1151
内质网0.050
排名 4 · TkA01G019370 · TK1151
质体0.022
排名 5 · TkA01G019370 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00564PB1124-139 aa
PF22922GAF_NLP189-229 aa
PF02042RWP-RK258-277 aa
PF22922GAF_NLP266-419 aa
PF01051Rep3_N467-518 aa
PF01710HTH_Tnp_IS630473-536 aa
PF02042RWP-RK478-527 aa
PF00564PB1568-648 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G019370PF00564PB11241397.3e-1142.6
TkA01G019370PF22922GAF_NLP1892294.9e-2898.5
TkA01G019370PF02042RWP-RK2582772.2e-1247.7
TkA01G019370PF22922GAF_NLP2664194.9e-2898.5
TkA01G019370PF01051Rep3_N4675180.0514.7
TkA01G019370PF01710HTH_Tnp_IS6304735360.04314.6
TkA01G019370PF02042RWP-RK4785272.2e-1247.7
TkA01G019370PF00564PB15686487.3e-1142.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84TH9拟南芥sp|Q84TH9|NLP7_ARATH Protein NLP727.200%Swiss-Prot低置信
Q8RWY4拟南芥sp|Q8RWY4|NLP6_ARATH Protein NLP628.000%Swiss-Prot低置信
Q9M1B0拟南芥sp|Q9M1B0|NLP9_ARATH Protein NLP927.800%Swiss-Prot低置信
Q9SFW8拟南芥sp|Q9SFW8|NLP5_ARATH Protein NLP526.500%Swiss-Prot低置信
Q10S83水稻sp|Q10S83|NLP1_ORYSJ Protein NLP130.200%Swiss-Prot中等置信

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