TkA01G009050 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G009050

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 2430244-2437169 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1452 bp · TkA01G009050|TK1151|cDNA

ATGGCAGATATGGGATCTAATTTGTTCTTGTTGGGATATCATTTTCAAGTCATTGTAGGGGAGTGGTTGTCATCAAGAAGCAAAGCAACAGTCAAGAGCAAGCTCACCCGTATTCTTCAACCTGCACTTGGTAATGCAAAAATTTCCATCATTTGTACTGTGGCACCAAAAGAGGTTCATGTAGAGGAAACAAAGGGTACCCTTCAGTTTATCCGTAGAGCTAAACGTATCACCAACTATGTTCAAGTAAACGAGGAGAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1452 bp · TkA01G009050|TK1151|CDS

ATGGCAGATATGGGATCTAATTTGTTCTTGTTGGGATATCATTTTCAAGTCATTGTAGGGGAGTGGTTGTCATCAAGAAGCAAAGCAACAGTCAAGAGCAAGCTCACCCGTATTCTTCAACCTGCACTTGGTAATGCAAAAATTTCCATCATTTGTACTGTGGCACCAAAAGAGGTTCATGTAGAGGAAACAAAGGGTACCCTTCAGTTTATCCGTAGAGCTAAACGTATCACCAACTATGTTCAAGTAAACGAGGAGAC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

483 aa · TkA01G009050|TK1151|PROTEIN

MADMGSNLFLLGYHFQVIVGEWLSSRSKATVKSKLTRILQPALGNAKISIICTVAPKEVHVEETKGTLQFIRRAKRITNYVQVNEETMSKKIQVIVSIPQLLNQFQILLLLKDLIILGHLEYVYSRPLQDEFGDVADEDTWMVRAFTSFLLEQSFEEDDDKSPTSKLISTTNEVVKSIMSTFEADVSVAINGYRKRDNLEGEIGNSENCKNYKDCTLETQIASWKTNMSVENNHLIQASKARIHGLEKDPTEHIAQQQSL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G009050`
TK1151 ID	TkA01G009050
OH-1004 ID	LXL04_023182
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	62.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 44.928 / OH-1004 89.375 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G009050

位置 Chr01:2430244-2437169 (-)

描述 Similar to KIN7N: Kinesin-like protein KIN-7N

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g59540`	类动力蛋白 KIN-7N。	暂无已核实直接文献
`UniProt: F4J2K4`	类驱动蛋白 KIN-7O。	暂无已核实直接文献
`At3g51150`	类驱动蛋白 KIN-7G。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os11g0552600`	驱动蛋白样蛋白KIN-7L。	暂无已核实直接文献
`Os09g0421200`	类动力蛋白 KIN-7I。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023182 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000226 microtubule cytoskeleton organization 生物过程

GO:0000278 mitotic cell cycle 生物过程

GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程

GO:0008608 attachment of spindle microtubules to kinetochore 生物过程

GO:0033044 regulation of chromosome organization 生物过程

GO:0042327 positive regulation of phosphorylation 生物过程

GO:0051301 cell division 生物过程

GO:0090307 mitotic spindle assembly 生物过程

GO:0140694 membraneless organelle assembly 生物过程

GO:1901987 regulation of cell cycle phase transition 生物过程

GO:0000775 chromosome, centromeric region 细胞组分

GO:0000776 kinetochore 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G59540

ath:AT3G10180

ddi:DDB_G0285101

dosa:Os09g0421200

dosa:Os11g0552600

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.430

排名 1 · TkA01G009050 · TK1151

细胞质0.397

排名 2 · TkA01G009050 · TK1151

线粒体0.153

排名 3 · TkA01G009050 · TK1151

细胞膜0.058

排名 4 · TkA01G009050 · TK1151

内质网0.039

排名 5 · TkA01G009050 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07109Mg-por_mtran_C13-31 aa

PF00225Kinesin32-77 aa

PF07109Mg-por_mtran_C34-93 aa

PF00225Kinesin239-282 aa

PF07109Mg-por_mtran_C393-427 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G009050	`PF07109`	Mg-por_mtran_C	13	31	0.022	15.8
TkA01G009050	`PF00225`	Kinesin	32	77	1.2e-08	35.1
TkA01G009050	`PF07109`	Mg-por_mtran_C	34	93	0.022	15.8
TkA01G009050	`PF00225`	Kinesin	239	282	1.2e-08	35.1
TkA01G009050	`PF07109`	Mg-por_mtran_C	393	427	0.022	15.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9S7P3`	拟南芥	sp\|Q9S7P3\|KN7N_ARATH Kinesin-like protein KIN-7N	77.800%	Swiss-Prot	低置信
`F4J2K4`	拟南芥	sp\|F4J2K4\|KN7O_ARATH Kinesin-like protein KIN-7O	59.300%	Swiss-Prot	低置信
`F4J394`	拟南芥	sp\|F4J394\|KN7G_ARATH Kinesin-like protein KIN-7G	58.500%	Swiss-Prot	低置信
`Q2R2P7`	水稻	sp\|Q2R2P7\|KN7L_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-7L	75.900%	Swiss-Prot	低置信
`B9G3M6`	水稻	sp\|B9G3M6\|KN7I_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-7I	61.100%	Swiss-Prot	低置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看

基因详情