ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 33 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA03G317610
Chr03:77978967-77981308 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_013222
Chr03:26220828-26221385 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
95.100 查询 100.000 / 对象 97.279 |
TkA03G317610 | |
|
TkA03G317820
Chr03:78042429-78043104 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_027125
Chr06:9344663-9347689 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
72.900 查询 57.843 / 对象 32.857 |
TkA03G317820 | |
|
TkA03G319980
Chr03:78467538-78467990 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008867
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CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.300 查询 94.309 / 对象 16.984 |
JCVI_TKOH_00141 | TkA03G319980 |
|
TkA03G319990
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GWHBCHF00000004
|
LXL04_008867
Chr02:110728390-110731165 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.800 查询 97.425 / 对象 33.236 |
JCVI_TKOH_00141 | TkA03G319990 |
|
TkA03G320000
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GWHBCHF00000004
|
LXL04_008867
Chr02:110728390-110731165 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.200 查询 100.000 / 对象 20.937 |
JCVI_TKOH_00141 | TkA03G320000 |
|
TkA03G320520
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GWHBCHF00000004
|
LXL04_003774
Chr01:100814584-100815108 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA03G320520 | |
|
TkA03G320550
Chr03:78806720-78807854 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008850
Chr02:110401754-110402512 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00141 | TkA03G320550 |
|
TkA03G321320
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GWHBCHF00000004
|
LXL04_010551
Chr02:148926428-148930235 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
72.500 查询 84.259 / 对象 36.813 |
TkA03G321320 | |
|
TkA03G321340
Chr03:79005595-79009865 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_037318
Chr09:6015593-6018625 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
80.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA03G321340 | |
|
TkA03G321550
Chr03:79057670-79065212 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008856
Chr02:110489797-110492010 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00141 | TkA03G321550 |
|
TkA03G321900
Chr03:79153223-79154363 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008853
Chr02:110424651-110425397 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00141 | TkA03G321900 |
|
TkA03G324370
Chr03:79712138-79716899 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008835
Chr02:110013751-110017038 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.800 查询 96.718 / 对象 60.000 |
JCVI_TKOH_00141 | TkA03G324370 |
|
TkA03G324550
Chr03:79741950-79742354 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_023447
Chr05:41480524-41480902 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
84.800 查询 73.881 / 对象 95.192 |
TkA03G324550 | |
|
TkA03G324560
Chr03:79742387-79743987 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008832
Chr02:109984528-109989971 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 99.707 / 对象 28.632 |
JCVI_TKOH_00141 | TkA03G324560 |
|
TkA03G325420
Chr03:79931674-79933274 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007513
Chr02:51060007-51061379 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.800 查询 91.000 / 对象 31.058 |
JCVI_TKOH_00142 | TkA03G325420 |
|
TkA03G325880
Chr03:80050171-80055155 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007505
Chr02:50891500-50894072 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
79.500 查询 82.759 / 对象 90.782 |
JCVI_TKOH_00142 | TkA03G325880 |
|
TkA03G327120
Chr03:80402892-80406061 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007494
Chr02:50527573-50537802 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 85.656 / 对象 41.061 |
JCVI_TKOH_00142 | TkA03G327120 |
|
TkA03G327130
Chr03:80406565-80411942 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_007493
Chr02:50522545-50526970 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 100.000 / 对象 49.412 |
JCVI_TKOH_00142 | TkA03G327130 |
|
TkA03G329140
Chr03:80926408-80933258 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008822
Chr02:109744573-109750028 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.400 查询 100.000 / 对象 39.583 |
JCVI_TKOH_00143 | TkA03G329140 |
|
TkA03G329350
Chr03:80979501-80981000 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008820
Chr02:109696192-109698136 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.500 查询 98.723 / 对象 85.442 |
JCVI_TKOH_00143 | TkA03G329350 |
|
TkA03G329870
Chr03:81085179-81086678 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008813
Chr02:109603023-109604660 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.000 查询 100.000 / 对象 91.560 |
JCVI_TKOH_00143 | TkA03G329870 |
|
TkA03G330080
Chr03:81142074-81143690 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008812
Chr02:109536219-109537835 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00143 | TkA03G330080 |
|
TkA03G330610
Chr03:81273710-81275335 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008804
Chr02:109376066-109381188 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
90.000 查询 95.898 / 对象 47.794 |
JCVI_TKOH_00143 | TkA03G330610 |
|
TkA03G330780
Chr03:81307636-81313666 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_030141
Chr06:109205239-109205870 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA03G330780 | |
|
TkA03G331530
Chr03:81467524-81470354 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_033389
Chr07:42577797-42579605 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
85.100 查询 64.356 / 对象 86.818 |
TkA03G331530 | |
|
TkA03G331620
Chr03:81487948-81496870 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_024179
Chr05:83391995-83393035 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
79.600 查询 97.340 / 对象 88.688 |
TkA03G331620 | |
|
TkA03G332580
Chr03:81774299-81777303 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008791
Chr02:108891119-108892652 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.700 查询 64.167 / 对象 64.167 |
JCVI_TKOH_00143 | TkA03G332580 |
|
TkA03G332990
Chr03:81857826-81864264 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008821
Chr02:109696950-109697648 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
58.200 查询 81.679 / 对象 74.483 |
JCVI_TKOH_00143 | TkA03G332990 |
|
TkA03G333200
Chr03:81891463-81891929 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009450
Chr02:126735782-126737368 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 100.000 / 对象 44.206 |
TkA03G333200 | |
|
TkA03G334170
Chr03:82177766-82178344 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_033758
Chr07:56295078-56295320 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.800 查询 41.667 / 对象 100.000 |
TkA03G334170 | |
|
TkA03G334740
Chr03:82378559-82381362 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008763
Chr02:108326158-108328446 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00143 | TkA03G334740 |
|
TkA03G335070
Chr03:82446238-82447429 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_021067
Chr04:120551693-120554062 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
56.100 查询 45.238 / 对象 29.586 |
TkA03G335070 | |
|
TkA03G336780
Chr03:82870365-82879379 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_020503
Chr04:83834443-83835993 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.100 查询 57.377 / 对象 91.503 |
TkA03G336780 | |
|
TkA03G337510
Chr03:83026581-83027801 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008753
Chr02:108086429-108087817 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 95.692 / 对象 67.316 |
JCVI_TKOH_00143 | TkA03G337510 |
|
TkA03G338010
Chr03:83136544-83136945 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008750
Chr02:107968179-107975505 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.600 查询 92.481 / 对象 51.037 |
JCVI_TKOH_00143 | TkA03G338010 |
|
TkA03G339440
Chr03:83556678-83558372 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_035879
Chr08:31108790-31110664 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
52.600 查询 51.099 / 对象 42.697 |
TkA03G339440 | |
|
TkA03G339750
Chr03:83604023-83604346 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_034471
Chr07:101990098-101990896 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.100 查询 96.262 / 对象 54.211 |
TkA03G339750 | |
|
TkA03G340640
Chr03:83845150-83852696 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008732
Chr02:107252758-107259804 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00143 | TkA03G340640 |
|
TkA03G341100
Chr03:83969362-83971037 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_039578
ChrUn:496780-499689 (-)
JAJTUU010000014.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.300 查询 100.000 / 对象 44.311 |
TkA03G341100 | |
|
TkA03G341590
Chr03:84077489-84078556 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_038340
Chr09:38227726-38229897 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
71.800 查询 31.967 / 对象 34.821 |
TkA03G341590 | |
|
TkA03G342410
Chr03:84271928-84273939 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008717
Chr02:106855116-106858185 (+)
CM104800.1
|
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.300 查询 86.010 / 对象 97.076 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.000 查询 98.252 / 对象 94.399 |
TkA03G359500 | |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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87.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
80.900 查询 65.827 / 对象 88.696 |
TkA03G365970 |