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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA03G324370
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 79712138-79716899 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

3252 bp · TkA03G324370|TK1151|cDNA

TAGAAGTCCACCATACACGGACTAAAATTGTTCAAAATCCCTTTGTATTCGTAGATGCTATCAACAGATTTTGTACGAAATCCTCTGATTCATTCATTCAATTCTACGTCCATCAATTTGCAGCACATTCTCTCTATACGACGATGTCGTCAATTGCGTTGATTTTAATTGGACTTGCAATTTTTACCGGTGTGAAGATAGCTATGTTCGCCGTGTTTTATGTTCGCTGAATCAATTGTAACGAGGTTTCTTTAATCTGC...

1557 bp · TkA03G324370|TK1151|CDS

ATGGAGTCAATTTCTGGAGATGAGTTTGACCCAAGTGATGAACTAGACTCAAATGCACAAGAAGAGAAGATCTTCGTTGCAGTGAGGCTTAGGCCTTTAAACGATAAAGAAATTGCAAAAAACGATTTATCCGATTGGGAATGCATAAACAAAACCACCATTATATACAAAAGCAACAACCAATCAGACAGACCAATGTACCCAAACGCCTTCACTTTCGACCGAGTATACGGATATGACAGTACAACAAAACAAATATA...

518 aa · TkA03G324370|TK1151|PROTEIN

MESISGDEFDPSDELDSNAQEEKIFVAVRLRPLNDKEIAKNDLSDWECINKTTIIYKSNNQSDRPMYPNAFTFDRVYGYDSTTKQIYDEGVKTIALSVLNGINSSVFAYGQTSSGKTYTMSGITEFAIADIYDYINRHNDREFVMKFSAIEIYNECVKDLLSVDNTQLRLLDDPEKGTVVEKLTEANLRDCNHLKELIYMSEAERQIGETALNEMSSRSHQILRLTVESSALDYKGGDSGRSLSATVSFVDLAGSERASQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G324370
TK1151 IDTkA03G324370
OH-1004 IDLXL04_008835
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.718 / OH-1004 60.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G324370
位置Chr03:79712138-79716899 (+)
描述Similar to KIN7F: Kinesin-like protein KIN-7F
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g51150 类驱动蛋白 KIN-7G。 暂无已核实直接文献
At5g66310 类驱动蛋白KIN-7H。 暂无已核实直接文献
At2g21300 类 kinesin 蛋白 KIN-7E。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0538800 体外结合ATP/ADP。 暂无已核实直接文献
Os02g0645100 类驱动蛋白KIN-7C。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_008835 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0003777 microtubule motor activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008017 microtubule binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G21300
ath:AT3G51150
dosa:Os04g0538800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.728
排名 1 · TkA03G324370 · TK1151
细胞核0.293
排名 2 · TkA03G324370 · TK1151
细胞膜0.076
排名 3 · TkA03G324370 · TK1151
线粒体0.044
排名 4 · TkA03G324370 · TK1151
溶酶体/液泡0.041
排名 5 · TkA03G324370 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16796Microtub_bd26-161 aa
PF00225Kinesin29-346 aa
PF23568ARM_LIN95-132 aa
PF26069DUF8026127-165 aa
PF02181FH2339-424 aa
PF23568ARM_LIN352-422 aa
PF26069DUF8026356-373 aa
PF26466DNA_primase_lrg_N356-414 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G324370PF16796Microtub_bd261613.6e-2073.2
TkA03G324370PF00225Kinesin293466.4e-97325.2
TkA03G324370PF23568ARM_LIN951320.2611.2
TkA03G324370PF26069DUF80261271650.06913.9
TkA03G324370PF02181FH23394240.0115.7
TkA03G324370PF23568ARM_LIN3524220.2611.2
TkA03G324370PF26069DUF80263563730.06913.9
TkA03G324370PF26466DNA_primase_lrg_N3564140.1113.0
TkA03G324370PF03836IQGAP_helical3594200.02815.1
TkA03G324370PF10805DUF27303604160.2312.5
TkA03G324370PF21408MTR4-like_stalk3603787.87.6
TkA03G324370PF22564HAAS3694060.1213.4
TkA03G324370PF00225Kinesin3734086.4e-97325.2
TkA03G324370PF15794CCDC1063974740.0215.4
TkA03G324370PF21408MTR4-like_stalk3974117.87.6
TkA03G324370PF26069DUF80264465000.06913.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4J394拟南芥sp|F4J394|KN7G_ARATH Kinesin-like protein KIN-7G62.300%Swiss-Prot高置信
F4JZ68拟南芥sp|F4JZ68|KN7H_ARATH Kinesin-like protein KIN-7H63.600%Swiss-Prot高置信
F4IGL2拟南芥sp|F4IGL2|KN7E_ARATH Kinesin-like protein KIN-7E62.000%Swiss-Prot高置信
Q7X7H4水稻sp|Q7X7H4|KN7F_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-7F64.900%Swiss-Prot高置信
Q6H638水稻sp|Q6H638|KN7C_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-7C61.800%Swiss-Prot高置信

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