同源/共线性证据
跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。
证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。
全局区块概览
共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
| 参考材料 | 组装 | 基因数 | gap 数 | 端粒扫描 |
|---|---|---|---|---|
| TK1151 | TK1151_GWHBCHF00000000 |
45224 | 1917 | 0/9 |
| OH-1004 | OH1004_GCA_047496595.1 |
40057 | 131 | 0/711 |
查询解析
输入 ID
JCVI_TKOH_00260
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 41
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块:
JCVI_TKOH_00260当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。
线性共线性图
当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。
High
Medium
Other
仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。
当前查询证据
当前查询没有可展示的 ID 对照记录。
共线性证据
| 区块 | 查询位置 | 目标位置 | 方向 | 当前映射锚点数 | 置信等级 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|
JCVI_TKOH_00260 |
Chr06:2547833-3118928 | Chr05:126226324-126949061 | mixed | 41 | 高置信 | Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline. |
区块锚点基因
锚点总数: 41 · 当前范围 1–41 · 页码 1/1
| TK1151 基因 | OH-1004 基因 | 区块 | 一致性 | 覆盖度 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
TkA06G009940 | LXL04_026432 | JCVI_TKOH_00260 | 89.3 | 100.0 / 57.5 | Complex |
TkA06G009980 | LXL04_026434 | JCVI_TKOH_00260 | 99.7 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA06G009990 | LXL04_026435 | JCVI_TKOH_00260 | 96.8 | 99.365 / 35.108 | 待复核 |
TkA06G010110 | LXL04_026436 | JCVI_TKOH_00260 | 97.1 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA06G010120 | LXL04_026436 | JCVI_TKOH_00260 | 93.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA06G010170 | LXL04_026437 | JCVI_TKOH_00260 | 86.5 | 82.687 / 100.0 | Complex |
TkA06G010380 | LXL04_026439 | JCVI_TKOH_00260 | 97.8 | 63.571 / 18.313 | 待复核 |
TkA06G010400 | LXL04_026440 | JCVI_TKOH_00260 | 100.0 | 94.958 / 20.849 | 待复核 |
TkA06G010470 | LXL04_026442 | JCVI_TKOH_00260 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA06G010510 | LXL04_026443 | JCVI_TKOH_00260 | 99.9 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA06G010530 | LXL04_026444 | JCVI_TKOH_00260 | 99.8 | 95.01 / 97.633 | Complex |
TkA06G010580 | LXL04_026447 | JCVI_TKOH_00260 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA06G010600 | LXL04_026448 | JCVI_TKOH_00260 | 99.8 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA06G010610 | LXL04_026449 | JCVI_TKOH_00260 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA06G010620 | LXL04_026450 | JCVI_TKOH_00260 | 100.0 | 100.0 / 95.108 | Strict |
TkA06G010730 | LXL04_026451 | JCVI_TKOH_00260 | 96.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA06G010740 | LXL04_026452 | JCVI_TKOH_00260 | 79.1 | 84.038 / 67.474 | Complex |
TkA06G010760 | LXL04_026453 | JCVI_TKOH_00260 | 98.3 | 97.776 / 74.537 | Probable |
TkA06G010800 | LXL04_026454 | JCVI_TKOH_00260 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA06G010950 | LXL04_026458 | JCVI_TKOH_00260 | 98.2 | 94.958 / 99.123 | 待复核 |
TkA06G011040 | LXL04_026459 | JCVI_TKOH_00260 | 99.4 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA06G011110 | LXL04_026462 | JCVI_TKOH_00260 | 82.4 | 93.117 / 29.715 | Complex |
TkA06G011120 | LXL04_026462 | JCVI_TKOH_00260 | 100.0 | 49.339 / 12.281 | Complex |
TkA06G011210 | LXL04_026463 | JCVI_TKOH_00260 | 94.9 | 100.0 / 100.0 | Probable |
TkA06G011220 | LXL04_026465 | JCVI_TKOH_00260 | 96.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA06G011240 | LXL04_026465 | JCVI_TKOH_00260 | 64.1 | 85.714 / 98.99 | Complex |
TkA06G011460 | LXL04_026465 | JCVI_TKOH_00260 | 64.2 | 96.732 / 99.663 | Complex |
TkA06G011480 | LXL04_026466 | JCVI_TKOH_00260 | 86.6 | 100.0 / 24.969 | Complex |
TkA06G011520 | LXL04_026466 | JCVI_TKOH_00260 | 100.0 | 100.0 / 39.13 | 待复核 |
TkA06G011530 | LXL04_026467 | JCVI_TKOH_00260 | 100.0 | 94.286 / 13.769 | 待复核 |
TkA06G011570 | LXL04_026467 | JCVI_TKOH_00260 | 33.8 | 88.742 / 47.149 | Complex |
TkA06G011580 | LXL04_026468 | JCVI_TKOH_00260 | 88.6 | 91.713 / 41.412 | 待复核 |
TkA06G011700 | LXL04_026470 | JCVI_TKOH_00260 | 99.7 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA06G011720 | LXL04_026471 | JCVI_TKOH_00260 | 97.4 | 81.283 / 27.636 | 待复核 |
TkA06G011740 | LXL04_026472 | JCVI_TKOH_00260 | 69.0 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA06G011750 | LXL04_026473 | JCVI_TKOH_00260 | 99.2 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA06G011790 | LXL04_026475 | JCVI_TKOH_00260 | 99.2 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA06G011810 | LXL04_026476 | JCVI_TKOH_00260 | 99.1 | 100.0 / 57.216 | 待复核 |
TkA06G011820 | LXL04_026477 | JCVI_TKOH_00260 | 99.7 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA06G011830 | LXL04_026478 | JCVI_TKOH_00260 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA06G011860 | LXL04_026480 | JCVI_TKOH_00260 | 98.4 | 100.0 / 75.153 | Probable |