同源/共线性证据
跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。
证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。
全局区块概览
共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
| 参考材料 | 组装 | 基因数 | gap 数 | 端粒扫描 |
|---|---|---|---|---|
| TK1151 | TK1151_GWHBCHF00000000 |
45224 | 1917 | 0/9 |
| OH-1004 | OH1004_GCA_047496595.1 |
40057 | 131 | 0/711 |
查询解析
输入 ID
JCVI_TKOH_00046
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 39
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块:
JCVI_TKOH_00046当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。
线性共线性图
当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。
High
Medium
Other
仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。
当前查询证据
当前查询没有可展示的 ID 对照记录。
共线性证据
| 区块 | 查询位置 | 目标位置 | 方向 | 当前映射锚点数 | 置信等级 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|
JCVI_TKOH_00046 |
Chr01:42535681-43801504 | Chr03:10859347-11832572 | mixed | 39 | 高置信 | Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline. |
区块锚点基因
锚点总数: 39 · 当前范围 1–39 · 页码 1/1
| TK1151 基因 | OH-1004 基因 | 区块 | 一致性 | 覆盖度 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
TkA01G166350 | LXL04_012413 | JCVI_TKOH_00046 | 96.3 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G166360 | LXL04_012412 | JCVI_TKOH_00046 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA01G166380 | LXL04_012411 | JCVI_TKOH_00046 | 49.3 | 87.356 / 72.757 | Complex |
TkA01G166410 | LXL04_012411 | JCVI_TKOH_00046 | 67.9 | 100.0 / 69.435 | Complex |
TkA01G166820 | LXL04_012410 | JCVI_TKOH_00046 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA01G166840 | LXL04_012409 | JCVI_TKOH_00046 | 99.9 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G166850 | LXL04_012408 | JCVI_TKOH_00046 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA01G166860 | LXL04_012407 | JCVI_TKOH_00046 | 99.5 | 99.296 / 35.696 | 待复核 |
TkA01G166880 | LXL04_012407 | JCVI_TKOH_00046 | 99.0 | 84.783 / 44.43 | Complex |
TkA01G167040 | LXL04_012406 | JCVI_TKOH_00046 | 100.0 | 100.0 / 59.965 | 待复核 |
TkA01G167150 | LXL04_012404 | JCVI_TKOH_00046 | 92.8 | 77.654 / 87.421 | Complex |
TkA01G167160 | LXL04_012403 | JCVI_TKOH_00046 | 100.0 | 89.744 / 30.523 | 待复核 |
TkA01G167170 | LXL04_012402 | JCVI_TKOH_00046 | 100.0 | 100.0 / 26.994 | 待复核 |
TkA01G167480 | LXL04_012398 | JCVI_TKOH_00046 | 99.7 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA01G167550 | LXL04_012393 | JCVI_TKOH_00046 | 100.0 | 66.667 / 28.715 | 待复核 |
TkA01G167560 | LXL04_012392 | JCVI_TKOH_00046 | 98.3 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G167570 | LXL04_012391 | JCVI_TKOH_00046 | 95.8 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G167580 | LXL04_012390 | JCVI_TKOH_00046 | 96.7 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G167650 | LXL04_012389 | JCVI_TKOH_00046 | 99.4 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G167670 | LXL04_012388 | JCVI_TKOH_00046 | 97.5 | 93.795 / 87.528 | Complex |
TkA01G167900 | LXL04_012382 | JCVI_TKOH_00046 | 90.6 | 100.0 / 96.0 | Complex |
TkA01G167910 | LXL04_012381 | JCVI_TKOH_00046 | 99.6 | 96.667 / 100.0 | Complex |
TkA01G168100 | LXL04_012377 | JCVI_TKOH_00046 | 99.7 | 100.0 / 83.457 | Complex |
TkA01G168480 | LXL04_012375 | JCVI_TKOH_00046 | 100.0 | 95.213 / 89.055 | Complex |
TkA01G168830 | LXL04_012372 | JCVI_TKOH_00046 | 99.5 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G168840 | LXL04_012371 | JCVI_TKOH_00046 | 98.8 | 94.972 / 100.0 | Complex |
TkA01G168930 | LXL04_012370 | JCVI_TKOH_00046 | 93.5 | 98.662 / 98.835 | Complex |
TkA01G169190 | LXL04_012369 | JCVI_TKOH_00046 | 93.1 | 72.05 / 95.726 | Probable |
TkA01G169250 | LXL04_012368 | JCVI_TKOH_00046 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G169330 | LXL04_012367 | JCVI_TKOH_00046 | 99.4 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G169380 | LXL04_012366 | JCVI_TKOH_00046 | 98.8 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G169410 | LXL04_012365 | JCVI_TKOH_00046 | 98.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G169420 | LXL04_012363 | JCVI_TKOH_00046 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G169980 | LXL04_012362 | JCVI_TKOH_00046 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA01G170090 | LXL04_012359 | JCVI_TKOH_00046 | 96.8 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G170780 | LXL04_012356 | JCVI_TKOH_00046 | 98.1 | 99.458 / 100.0 | Complex |
TkA01G170800 | LXL04_012355 | JCVI_TKOH_00046 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA01G170880 | LXL04_012353 | JCVI_TKOH_00046 | 99.7 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G170900 | LXL04_012352 | JCVI_TKOH_00046 | 93.5 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |